MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 1632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014159	CCT	2	6	895	900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141909
2	NC_014159	GCG	2	6	934	939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141909
3	NC_014159	CTT	2	6	963	968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141909
4	NC_014159	AGA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141909
5	NC_014159	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296141909
6	NC_014159	TAG	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141909
7	NC_014159	AGT	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141909
8	NC_014159	GAC	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
9	NC_014159	AAG	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141909
10	NC_014159	GGA	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141909
11	NC_014159	CGA	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
12	NC_014159	GCA	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
13	NC_014159	AGC	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
14	NC_014159	TGA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141909
15	NC_014159	CGA	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141909
16	NC_014159	CCG	2	6	2136	2141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141910
17	NC_014159	TGC	2	6	2259	2264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141910
18	NC_014159	TCC	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141910
19	NC_014159	TGC	3	9	2415	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141910
20	NC_014159	CAC	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141910
21	NC_014159	GCC	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141910
22	NC_014159	ATG	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141910
23	NC_014159	GAC	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141910
24	NC_014159	GCG	2	6	2542	2547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141910
25	NC_014159	GCC	2	6	2556	2561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141910
26	NC_014159	GCC	2	6	2687	2692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
27	NC_014159	GTT	2	6	2726	2731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141911
28	NC_014159	TGG	2	6	2886	2891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141911
29	NC_014159	CGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141911
30	NC_014159	CAG	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141911
31	NC_014159	GAG	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141911
32	NC_014159	CAG	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141911
33	NC_014159	GGC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141911
34	NC_014159	CGC	2	6	3090	3095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
35	NC_014159	CCG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
36	NC_014159	GCC	2	6	3173	3178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141911
37	NC_014159	TGC	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141911
38	NC_014159	GTT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141911
39	NC_014159	TCA	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141912
40	NC_014159	CCG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141912
41	NC_014159	GAA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141912
42	NC_014159	TGA	3	9	3739	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141912
43	NC_014159	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141913
44	NC_014159	GCC	2	6	3852	3857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141913
45	NC_014159	CGC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141913
46	NC_014159	GCC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141913
47	NC_014159	ACC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141913
48	NC_014159	GCT	2	6	4116	4121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141914
49	NC_014159	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141914
50	NC_014159	TTC	2	6	4170	4175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141914
51	NC_014159	TCG	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141914
52	NC_014159	GGC	2	6	4298	4303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141914
53	NC_014159	GCG	4	12	4331	4342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141914
54	NC_014159	TTC	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141914
55	NC_014159	AGA	2	6	4477	4482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141914
56	NC_014159	ATC	2	6	4981	4986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141915
57	NC_014159	GTG	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141915
58	NC_014159	CGT	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141915
59	NC_014159	ACC	2	6	5131	5136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141915
60	NC_014159	GCC	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141915
61	NC_014159	CAG	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141915
62	NC_014159	ACA	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141915
63	NC_014159	CAC	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141916
64	NC_014159	CGG	2	6	5419	5424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141916
65	NC_014159	CGA	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141916
66	NC_014159	TGT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141916
67	NC_014159	GTG	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141916
68	NC_014159	CGG	2	6	5570	5575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141916
69	NC_014159	TGG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141916
70	NC_014159	GCC	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141916
71	NC_014159	GGC	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141916
72	NC_014159	CGC	2	6	5819	5824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141916
73	NC_014159	CTG	2	6	5902	5907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141916
74	NC_014159	TCA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141916
75	NC_014159	CCG	2	6	5973	5978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141917
76	NC_014159	GCG	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141917
77	NC_014159	CGA	2	6	6082	6087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
78	NC_014159	CCG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141917
79	NC_014159	TCG	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141917
80	NC_014159	GCC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141917
81	NC_014159	CGA	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
82	NC_014159	GTC	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141917
83	NC_014159	TGG	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141917
84	NC_014159	ACG	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
85	NC_014159	ATG	2	6	6518	6523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141917
86	NC_014159	CAC	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141917
87	NC_014159	CGG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141917
88	NC_014159	CAG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141917
89	NC_014159	GCG	2	6	6614	6619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141917
90	NC_014159	CGA	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
91	NC_014159	CGA	2	6	6869	6874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
92	NC_014159	GCC	3	9	6913	6921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
93	NC_014159	GCG	3	9	6922	6930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141918
94	NC_014159	ACC	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141918
95	NC_014159	AGC	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
96	NC_014159	CCA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141918
97	NC_014159	CAG	2	6	7179	7184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
98	NC_014159	CCG	2	6	7187	7192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
99	NC_014159	GCG	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141918
100	NC_014159	CCG	2	6	7213	7218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
101	NC_014159	CCG	2	6	7292	7297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
102	NC_014159	GCC	2	6	7324	7329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
103	NC_014159	CGC	2	6	7404	7409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
104	NC_014159	CCG	2	6	7492	7497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
105	NC_014159	CAC	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141918
106	NC_014159	GCG	2	6	7546	7551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141918
107	NC_014159	CGG	2	6	7565	7570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141918
108	NC_014159	GCC	2	6	7591	7596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
109	NC_014159	CGA	2	6	7599	7604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
110	NC_014159	CAG	2	6	7611	7616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141918
111	NC_014159	GCC	2	6	7642	7647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141918
112	NC_014159	CGC	2	6	7735	7740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141919
113	NC_014159	GTG	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141919
114	NC_014159	GCC	2	6	7981	7986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141919
115	NC_014159	GCC	2	6	8038	8043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141919
116	NC_014159	CCG	3	9	8068	8076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141920
117	NC_014159	TCG	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141920
118	NC_014159	CGG	2	6	8149	8154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141920
119	NC_014159	GTG	2	6	8157	8162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141920
120	NC_014159	GCG	2	6	8170	8175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141920
121	NC_014159	CGT	2	6	8266	8271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141920
122	NC_014159	TCG	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141920
123	NC_014159	TGC	2	6	8307	8312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141920
124	NC_014159	AGT	2	6	8359	8364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141920
125	NC_014159	TGC	2	6	8489	8494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141920
126	NC_014159	TCT	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141920
127	NC_014159	TCG	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141920
128	NC_014159	GCC	2	6	8520	8525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141920
129	NC_014159	GTG	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141921
130	NC_014159	CAG	2	6	9429	9434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141921
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249	NC_014159	CGT	2	6	16451	16456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141928
250	NC_014159	GGC	2	6	16494	16499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141928
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252	NC_014159	TCG	2	6	17121	17126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141929
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254	NC_014159	CAG	2	6	17321	17326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141929
255	NC_014159	CCT	2	6	17395	17400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141929
256	NC_014159	GCT	2	6	17405	17410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141929
257	NC_014159	CGG	2	6	17444	17449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141929
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259	NC_014159	CGC	2	6	17498	17503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141929
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500	NC_014159	CCA	2	6	33363	33368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141944

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