MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	AAAGC	2	10	155	164	60 %	0 %	20 %	20 %	296137680
2	NC_014157	TGCCA	2	10	1005	1014	20 %	20 %	20 %	40 %	296137680
3	NC_014157	ACGGC	2	10	1259	1268	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014157	GGTTC	2	10	4220	4229	0 %	40 %	40 %	20 %	296137683
5	NC_014157	GAGCC	2	10	5072	5081	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014157	GGTGG	2	10	11449	11458	0 %	20 %	80 %	0 %	296137692
7	NC_014157	CTCTT	2	10	11840	11849	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014157	ATCGG	2	10	16245	16254	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014157	CGCTG	2	10	17500	17509	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014157	TGCTG	2	10	22474	22483	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014157	CCCGA	2	10	24805	24814	20 %	0 %	20 %	60 %	296137698
12	NC_014157	GCCCG	2	10	27463	27472	0 %	0 %	40 %	60 %	296137699
13	NC_014157	AAATA	2	10	27721	27730	80 %	20 %	0 %	0 %	296137699
14	NC_014157	TGCAT	2	10	27779	27788	20 %	40 %	20 %	20 %	296137699
15	NC_014157	AGCAA	2	10	27859	27868	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014157	TGCCC	2	10	27991	28000	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
17	NC_014157	CTCGC	2	10	28732	28741	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
18	NC_014157	CTTGC	2	10	28774	28783	0 %	40 %	20 %	40 %	296137700
19	NC_014157	GCCTC	2	10	28798	28807	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
20	NC_014157	AAGTC	2	10	29712	29721	40 %	20 %	20 %	20 %	296137700
21	NC_014157	CTCCG	2	10	30587	30596	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
22	NC_014157	TCCGC	2	10	31225	31234	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
23	NC_014157	GCCTC	2	10	31680	31689	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
24	NC_014157	GCAGA	2	10	32514	32523	40 %	0 %	40 %	20 %	296137700
25	NC_014157	TCCCT	2	10	33647	33656	0 %	40 %	0 %	60 %	296137701
26	NC_014157	CACGG	2	10	35022	35031	20 %	0 %	40 %	40 %	296137703
27	NC_014157	CGCGG	2	10	35747	35756	0 %	0 %	60 %	40 %	296137703
28	NC_014157	GGGCG	2	10	36865	36874	0 %	0 %	80 %	20 %	296137705
29	NC_014157	GCCGA	2	10	38540	38549	20 %	0 %	40 %	40 %	296137706
30	NC_014157	TTGAC	2	10	38856	38865	20 %	40 %	20 %	20 %	296137707
31	NC_014157	GGAGA	2	10	39405	39414	40 %	0 %	60 %	0 %	296137707
32	NC_014157	TGCCC	2	10	39798	39807	0 %	20 %	20 %	60 %	296137708
33	NC_014157	GTGCC	2	10	39941	39950	0 %	20 %	40 %	40 %	296137708
34	NC_014157	GCGTC	2	10	40518	40527	0 %	20 %	40 %	40 %	296137709
35	NC_014157	CGGGG	2	10	40686	40695	0 %	0 %	80 %	20 %	296137709
36	NC_014157	GTCCC	2	10	40976	40985	0 %	20 %	20 %	60 %	296137710
37	NC_014157	GTGCA	2	10	41772	41781	20 %	20 %	40 %	20 %	296137710
38	NC_014157	GGGGC	2	10	41876	41885	0 %	0 %	80 %	20 %	296137710
39	NC_014157	CCGGG	2	10	41899	41908	0 %	0 %	60 %	40 %	296137710
40	NC_014157	GCCCC	2	10	45727	45736	0 %	0 %	20 %	80 %	296137714
41	NC_014157	TTGGT	2	10	46499	46508	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014157	GCCCC	2	10	50424	50433	0 %	0 %	20 %	80 %	296137718
43	NC_014157	TCGAG	2	10	52527	52536	20 %	20 %	40 %	20 %	296137719
44	NC_014157	CTCCC	2	10	53353	53362	0 %	20 %	0 %	80 %	296137720
45	NC_014157	GCTCT	2	10	54403	54412	0 %	40 %	20 %	40 %	296137721
46	NC_014157	TCGCC	2	10	54459	54468	0 %	20 %	20 %	60 %	296137721
47	NC_014157	CCGAC	2	10	55508	55517	20 %	0 %	20 %	60 %	296137721
48	NC_014157	GACGG	2	10	56021	56030	20 %	0 %	60 %	20 %	296137722
49	NC_014157	GCTCC	2	10	57432	57441	0 %	20 %	20 %	60 %	296137724
50	NC_014157	TTCGT	2	10	58064	58073	0 %	60 %	20 %	20 %	296137724
51	NC_014157	CGGCG	2	10	60300	60309	0 %	0 %	60 %	40 %	296137724
52	NC_014157	TCGCG	2	10	61403	61412	0 %	20 %	40 %	40 %	296137724
53	NC_014157	CCGGC	2	10	62279	62288	0 %	0 %	40 %	60 %	296137725
54	NC_014157	GTTCA	2	10	63270	63279	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014157	AACCA	2	10	63530	63539	60 %	0 %	0 %	40 %	296137726
56	NC_014157	CGGAA	2	10	63731	63740	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014157	CGAGA	2	10	64361	64370	40 %	0 %	40 %	20 %	296137728
58	NC_014157	GGCCG	2	10	65812	65821	0 %	0 %	60 %	40 %	296137730
59	NC_014157	CGGCC	2	10	66012	66021	0 %	0 %	40 %	60 %	296137731
60	NC_014157	CCCGC	2	10	66296	66305	0 %	0 %	20 %	80 %	296137731
61	NC_014157	CCCGG	2	10	66307	66316	0 %	0 %	40 %	60 %	296137731
62	NC_014157	GGCAT	2	10	70547	70556	20 %	20 %	40 %	20 %	296137735
63	NC_014157	GCTTC	2	10	70719	70728	0 %	40 %	20 %	40 %	296137735
64	NC_014157	TTCAG	2	10	71068	71077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014157	CATGA	2	10	73060	73069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014157	GTCAG	2	10	74721	74730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014157	GCAAG	2	10	75636	75645	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014157	CGCCT	2	10	75993	76002	0 %	20 %	20 %	60 %	296137741
69	NC_014157	TCCCG	2	10	77459	77468	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_014157	ACTTC	2	10	78537	78546	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014157	TCTCC	2	10	79093	79102	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014157	GGTCT	2	10	79265	79274	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014157	CCGCT	2	10	79656	79665	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014157	GCCCT	2	10	81279	81288	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014157	GTGGC	2	10	82812	82821	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.