MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	AAAGC	2	10	155	164	60 %	0 %	20 %	20 %	296137680
2	NC_014157	TGCCA	2	10	1005	1014	20 %	20 %	20 %	40 %	296137680
3	NC_014157	GGTTC	2	10	4220	4229	0 %	40 %	40 %	20 %	296137683
4	NC_014157	GGTGG	2	10	11449	11458	0 %	20 %	80 %	0 %	296137692
5	NC_014157	CCCGA	2	10	24805	24814	20 %	0 %	20 %	60 %	296137698
6	NC_014157	GCCCG	2	10	27463	27472	0 %	0 %	40 %	60 %	296137699
7	NC_014157	AAATA	2	10	27721	27730	80 %	20 %	0 %	0 %	296137699
8	NC_014157	TGCAT	2	10	27779	27788	20 %	40 %	20 %	20 %	296137699
9	NC_014157	TGCCC	2	10	27991	28000	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
10	NC_014157	CTCGC	2	10	28732	28741	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
11	NC_014157	CTTGC	2	10	28774	28783	0 %	40 %	20 %	40 %	296137700
12	NC_014157	GCCTC	2	10	28798	28807	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
13	NC_014157	AAGTC	2	10	29712	29721	40 %	20 %	20 %	20 %	296137700
14	NC_014157	CTCCG	2	10	30587	30596	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
15	NC_014157	TCCGC	2	10	31225	31234	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
16	NC_014157	GCCTC	2	10	31680	31689	0 %	20 %	20 %	60 %	296137700
17	NC_014157	GCAGA	2	10	32514	32523	40 %	0 %	40 %	20 %	296137700
18	NC_014157	TCCCT	2	10	33647	33656	0 %	40 %	0 %	60 %	296137701
19	NC_014157	CACGG	2	10	35022	35031	20 %	0 %	40 %	40 %	296137703
20	NC_014157	CGCGG	2	10	35747	35756	0 %	0 %	60 %	40 %	296137703
21	NC_014157	GGGCG	2	10	36865	36874	0 %	0 %	80 %	20 %	296137705
22	NC_014157	GCCGA	2	10	38540	38549	20 %	0 %	40 %	40 %	296137706
23	NC_014157	TTGAC	2	10	38856	38865	20 %	40 %	20 %	20 %	296137707
24	NC_014157	GGAGA	2	10	39405	39414	40 %	0 %	60 %	0 %	296137707
25	NC_014157	TGCCC	2	10	39798	39807	0 %	20 %	20 %	60 %	296137708
26	NC_014157	GTGCC	2	10	39941	39950	0 %	20 %	40 %	40 %	296137708
27	NC_014157	GCGTC	2	10	40518	40527	0 %	20 %	40 %	40 %	296137709
28	NC_014157	CGGGG	2	10	40686	40695	0 %	0 %	80 %	20 %	296137709
29	NC_014157	GTCCC	2	10	40976	40985	0 %	20 %	20 %	60 %	296137710
30	NC_014157	GTGCA	2	10	41772	41781	20 %	20 %	40 %	20 %	296137710
31	NC_014157	GGGGC	2	10	41876	41885	0 %	0 %	80 %	20 %	296137710
32	NC_014157	CCGGG	2	10	41899	41908	0 %	0 %	60 %	40 %	296137710
33	NC_014157	GCCCC	2	10	45727	45736	0 %	0 %	20 %	80 %	296137714
34	NC_014157	GCCCC	2	10	50424	50433	0 %	0 %	20 %	80 %	296137718
35	NC_014157	TCGAG	2	10	52527	52536	20 %	20 %	40 %	20 %	296137719
36	NC_014157	CTCCC	2	10	53353	53362	0 %	20 %	0 %	80 %	296137720
37	NC_014157	GCTCT	2	10	54403	54412	0 %	40 %	20 %	40 %	296137721
38	NC_014157	TCGCC	2	10	54459	54468	0 %	20 %	20 %	60 %	296137721
39	NC_014157	CCGAC	2	10	55508	55517	20 %	0 %	20 %	60 %	296137721
40	NC_014157	GACGG	2	10	56021	56030	20 %	0 %	60 %	20 %	296137722
41	NC_014157	GCTCC	2	10	57432	57441	0 %	20 %	20 %	60 %	296137724
42	NC_014157	TTCGT	2	10	58064	58073	0 %	60 %	20 %	20 %	296137724
43	NC_014157	CGGCG	2	10	60300	60309	0 %	0 %	60 %	40 %	296137724
44	NC_014157	TCGCG	2	10	61403	61412	0 %	20 %	40 %	40 %	296137724
45	NC_014157	CCGGC	2	10	62279	62288	0 %	0 %	40 %	60 %	296137725
46	NC_014157	AACCA	2	10	63530	63539	60 %	0 %	0 %	40 %	296137726
47	NC_014157	CGAGA	2	10	64361	64370	40 %	0 %	40 %	20 %	296137728
48	NC_014157	GGCCG	2	10	65812	65821	0 %	0 %	60 %	40 %	296137730
49	NC_014157	CGGCC	2	10	66012	66021	0 %	0 %	40 %	60 %	296137731
50	NC_014157	CCCGC	2	10	66296	66305	0 %	0 %	20 %	80 %	296137731
51	NC_014157	CCCGG	2	10	66307	66316	0 %	0 %	40 %	60 %	296137731
52	NC_014157	GGCAT	2	10	70547	70556	20 %	20 %	40 %	20 %	296137735
53	NC_014157	GCTTC	2	10	70719	70728	0 %	40 %	20 %	40 %	296137735
54	NC_014157	CGCCT	2	10	75993	76002	0 %	20 %	20 %	60 %	296137741

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.