MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	AGGG	2	8	63	70	25 %	0 %	75 %	0 %	296137680
2	NC_014157	AAGG	2	8	145	152	50 %	0 %	50 %	0 %	296137680
3	NC_014157	CAGG	2	8	169	176	25 %	0 %	50 %	25 %	296137680
4	NC_014157	CGGG	2	8	1703	1710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014157	GGGC	2	8	1882	1889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014157	GATT	2	8	2539	2546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014157	CCTG	2	8	4009	4016	0 %	25 %	25 %	50 %	296137683
8	NC_014157	TGAC	2	8	4920	4927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014157	GCGA	2	8	5228	5235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014157	AAAC	2	8	6047	6054	75 %	0 %	0 %	25 %	296137684
11	NC_014157	GCTG	2	8	7179	7186	0 %	25 %	50 %	25 %	296137686
12	NC_014157	TCCA	2	8	7587	7594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014157	GCCA	2	8	7892	7899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014157	CGTC	2	8	8225	8232	0 %	25 %	25 %	50 %	296137689
15	NC_014157	TGCT	2	8	8350	8357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014157	TGCG	2	8	8988	8995	0 %	25 %	50 %	25 %	296137690
17	NC_014157	AGGC	2	8	9003	9010	25 %	0 %	50 %	25 %	296137690
18	NC_014157	CCCT	2	8	9324	9331	0 %	25 %	0 %	75 %	296137690
19	NC_014157	GCGG	2	8	11439	11446	0 %	0 %	75 %	25 %	296137692
20	NC_014157	TTTC	2	8	12119	12126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014157	GAAC	2	8	12950	12957	50 %	0 %	25 %	25 %	296137693
22	NC_014157	AGTC	2	8	13111	13118	25 %	25 %	25 %	25 %	296137693
23	NC_014157	GCCT	2	8	14699	14706	0 %	25 %	25 %	50 %	296137695
24	NC_014157	CCGG	2	8	15001	15008	0 %	0 %	50 %	50 %	296137695
25	NC_014157	TGCT	2	8	15303	15310	0 %	50 %	25 %	25 %	296137696
26	NC_014157	CGGC	2	8	15324	15331	0 %	0 %	50 %	50 %	296137696
27	NC_014157	CAGT	2	8	15887	15894	25 %	25 %	25 %	25 %	296137696
28	NC_014157	GCAC	2	8	15963	15970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014157	CCGG	2	8	16073	16080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014157	GGCA	2	8	16289	16296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014157	GTCA	2	8	16676	16683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014157	GGCA	2	8	16794	16801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014157	GCGA	2	8	16986	16993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014157	TCCT	2	8	17036	17043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014157	CCCG	2	8	17060	17067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_014157	CGGT	2	8	17389	17396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014157	GAAT	2	8	17692	17699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014157	GACT	2	8	17922	17929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014157	GACT	2	8	17936	17943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014157	GCCT	2	8	18174	18181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014157	TTTG	2	8	18267	18274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014157	GCCC	2	8	19013	19020	0 %	0 %	25 %	75 %	296137697
43	NC_014157	GCTT	2	8	19489	19496	0 %	50 %	25 %	25 %	296137697
44	NC_014157	CTTC	2	8	19502	19509	0 %	50 %	0 %	50 %	296137697
45	NC_014157	TCCT	2	8	19686	19693	0 %	50 %	0 %	50 %	296137697
46	NC_014157	CTCC	2	8	19997	20004	0 %	25 %	0 %	75 %	296137697
47	NC_014157	CCGG	2	8	20058	20065	0 %	0 %	50 %	50 %	296137697
48	NC_014157	GCCG	2	8	21282	21289	0 %	0 %	50 %	50 %	296137697
49	NC_014157	AGGC	2	8	21572	21579	25 %	0 %	50 %	25 %	296137697
50	NC_014157	CAGG	2	8	21699	21706	25 %	0 %	50 %	25 %	296137697
51	NC_014157	GTTG	2	8	22245	22252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014157	TGCC	2	8	22545	22552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014157	TTTC	2	8	22572	22579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014157	CTGC	2	8	22874	22881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014157	TCAC	2	8	22973	22980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014157	CCCG	2	8	23299	23306	0 %	0 %	25 %	75 %	296137698
57	NC_014157	GACC	2	8	23505	23512	25 %	0 %	25 %	50 %	296137698
58	NC_014157	GACG	2	8	23529	23536	25 %	0 %	50 %	25 %	296137698
59	NC_014157	CTCG	2	8	24291	24298	0 %	25 %	25 %	50 %	296137698
60	NC_014157	ATCT	2	8	24586	24593	25 %	50 %	0 %	25 %	296137698
61	NC_014157	GCCC	2	8	24687	24694	0 %	0 %	25 %	75 %	296137698
62	NC_014157	CCCA	2	8	24973	24980	25 %	0 %	0 %	75 %	296137698
63	NC_014157	CGAG	2	8	25307	25314	25 %	0 %	50 %	25 %	296137698
64	NC_014157	ACCA	2	8	25453	25460	50 %	0 %	0 %	50 %	296137698
65	NC_014157	GCGG	2	8	25851	25858	0 %	0 %	75 %	25 %	296137698
66	NC_014157	GGAC	2	8	25991	25998	25 %	0 %	50 %	25 %	296137698
67	NC_014157	GCGG	2	8	26319	26326	0 %	0 %	75 %	25 %	296137698
68	NC_014157	GAGG	2	8	26715	26722	25 %	0 %	75 %	0 %	296137698
69	NC_014157	GTGG	2	8	26762	26769	0 %	25 %	75 %	0 %	296137698
70	NC_014157	GATA	2	8	27210	27217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014157	AGAA	2	8	27295	27302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014157	GATC	2	8	27378	27385	25 %	25 %	25 %	25 %	296137699
73	NC_014157	AGGG	2	8	27733	27740	25 %	0 %	75 %	0 %	296137699
74	NC_014157	GAGC	2	8	27903	27910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014157	CCTC	2	8	28045	28052	0 %	25 %	0 %	75 %	296137700
76	NC_014157	CCGG	2	8	28423	28430	0 %	0 %	50 %	50 %	296137700
77	NC_014157	CCCG	2	8	28624	28631	0 %	0 %	25 %	75 %	296137700
78	NC_014157	CTTC	2	8	28837	28844	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
79	NC_014157	GCTC	2	8	29214	29221	0 %	25 %	25 %	50 %	296137700
80	NC_014157	CTTC	2	8	29290	29297	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
81	NC_014157	TTCC	2	8	29312	29319	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
82	NC_014157	CGGT	2	8	30858	30865	0 %	25 %	50 %	25 %	296137700
83	NC_014157	TGGC	2	8	30908	30915	0 %	25 %	50 %	25 %	296137700
84	NC_014157	GCCC	2	8	31137	31144	0 %	0 %	25 %	75 %	296137700
85	NC_014157	CGGT	2	8	31242	31249	0 %	25 %	50 %	25 %	296137700
86	NC_014157	CCGG	2	8	31663	31670	0 %	0 %	50 %	50 %	296137700
87	NC_014157	GCCC	2	8	32081	32088	0 %	0 %	25 %	75 %	296137700
88	NC_014157	GGCT	2	8	32089	32096	0 %	25 %	50 %	25 %	296137700
89	NC_014157	ATAC	2	8	32896	32903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014157	GAAA	2	8	33408	33415	75 %	0 %	25 %	0 %	296137701
91	NC_014157	GGCC	2	8	34383	34390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014157	CCAG	2	8	34604	34611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014157	TGCC	2	8	34836	34843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014157	TTCC	2	8	34858	34865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014157	CCCG	2	8	34940	34947	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_014157	CGGG	2	8	35084	35091	0 %	0 %	75 %	25 %	296137703
97	NC_014157	GCCC	2	8	35288	35295	0 %	0 %	25 %	75 %	296137703
98	NC_014157	TTCG	2	8	35463	35470	0 %	50 %	25 %	25 %	296137703
99	NC_014157	CCAG	2	8	35560	35567	25 %	0 %	25 %	50 %	296137703
100	NC_014157	CGTG	2	8	36678	36685	0 %	25 %	50 %	25 %	296137705
101	NC_014157	CCCG	2	8	36708	36715	0 %	0 %	25 %	75 %	296137705
102	NC_014157	TCCC	2	8	37015	37022	0 %	25 %	0 %	75 %	296137705
103	NC_014157	GCCC	2	8	37225	37232	0 %	0 %	25 %	75 %	296137705
104	NC_014157	CGGC	2	8	38221	38228	0 %	0 %	50 %	50 %	296137706
105	NC_014157	GCCC	2	8	38554	38561	0 %	0 %	25 %	75 %	296137706
106	NC_014157	TCAA	2	8	38731	38738	50 %	25 %	0 %	25 %	296137707
107	NC_014157	ACGA	2	8	38823	38830	50 %	0 %	25 %	25 %	296137707
108	NC_014157	GCGG	2	8	39238	39245	0 %	0 %	75 %	25 %	296137707
109	NC_014157	CTTC	2	8	39317	39324	0 %	50 %	0 %	50 %	296137707
110	NC_014157	CCCA	2	8	39835	39842	25 %	0 %	0 %	75 %	296137708
111	NC_014157	CCCG	2	8	39994	40001	0 %	0 %	25 %	75 %	296137708
112	NC_014157	CGGC	2	8	40650	40657	0 %	0 %	50 %	50 %	296137709
113	NC_014157	AGGG	2	8	41007	41014	25 %	0 %	75 %	0 %	296137710
114	NC_014157	GGAG	2	8	41179	41186	25 %	0 %	75 %	0 %	296137710
115	NC_014157	CGAT	2	8	41262	41269	25 %	25 %	25 %	25 %	296137710
116	NC_014157	CAGG	2	8	41888	41895	25 %	0 %	50 %	25 %	296137710
117	NC_014157	CGGG	2	8	42072	42079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014157	GGGC	2	8	42350	42357	0 %	0 %	75 %	25 %	296137711
119	NC_014157	GCCC	2	8	42425	42432	0 %	0 %	25 %	75 %	296137711
120	NC_014157	CTCG	2	8	42753	42760	0 %	25 %	25 %	50 %	296137711
121	NC_014157	GGCG	2	8	43284	43291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014157	CGGT	2	8	43475	43482	0 %	25 %	50 %	25 %	296137712
123	NC_014157	CGTC	2	8	43659	43666	0 %	25 %	25 %	50 %	296137712
124	NC_014157	GAGG	2	8	44104	44111	25 %	0 %	75 %	0 %	296137712
125	NC_014157	GCAG	2	8	44201	44208	25 %	0 %	50 %	25 %	296137713
126	NC_014157	CGAG	2	8	44270	44277	25 %	0 %	50 %	25 %	296137713
127	NC_014157	GAAT	2	8	44400	44407	50 %	25 %	25 %	0 %	296137713
128	NC_014157	GCCG	2	8	44571	44578	0 %	0 %	50 %	50 %	296137713
129	NC_014157	GTCG	2	8	45011	45018	0 %	25 %	50 %	25 %	296137713
130	NC_014157	GGCG	2	8	45092	45099	0 %	0 %	75 %	25 %	296137713
131	NC_014157	GTTG	2	8	45437	45444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014157	ACCG	2	8	45949	45956	25 %	0 %	25 %	50 %	296137714
133	NC_014157	CGAG	2	8	46609	46616	25 %	0 %	50 %	25 %	296137715
134	NC_014157	ATCT	2	8	46844	46851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014157	TCCT	2	8	46977	46984	0 %	50 %	0 %	50 %	296137716
136	NC_014157	GCCC	2	8	47873	47880	0 %	0 %	25 %	75 %	296137716
137	NC_014157	ATCC	2	8	47891	47898	25 %	25 %	0 %	50 %	296137716
138	NC_014157	ACCC	2	8	48081	48088	25 %	0 %	0 %	75 %	296137716
139	NC_014157	CCGG	2	8	48287	48294	0 %	0 %	50 %	50 %	296137716
140	NC_014157	GATG	2	8	48374	48381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014157	GTCC	2	8	48557	48564	0 %	25 %	25 %	50 %	296137717
142	NC_014157	ACGG	2	8	48795	48802	25 %	0 %	50 %	25 %	296137717
143	NC_014157	CGGC	2	8	49303	49310	0 %	0 %	50 %	50 %	296137717
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.