MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT02

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014155	CGTG	2	8	1257	1264	0 %	25 %	50 %	25 %	296137656
2	NC_014155	CAGT	2	8	1462	1469	25 %	25 %	25 %	25 %	296137656
3	NC_014155	CGCC	2	8	1911	1918	0 %	0 %	25 %	75 %	296137658
4	NC_014155	CGGT	2	8	2202	2209	0 %	25 %	50 %	25 %	296137658
5	NC_014155	GATG	2	8	2702	2709	25 %	25 %	50 %	0 %	296137659
6	NC_014155	CACC	2	8	3107	3114	25 %	0 %	0 %	75 %	296137660
7	NC_014155	CCTA	2	8	3981	3988	25 %	25 %	0 %	50 %	296137661
8	NC_014155	GCTG	2	8	4103	4110	0 %	25 %	50 %	25 %	296137661
9	NC_014155	CTCG	2	8	4676	4683	0 %	25 %	25 %	50 %	296137663
10	NC_014155	AAGG	2	8	5617	5624	50 %	0 %	50 %	0 %	296137664
11	NC_014155	ACTT	2	8	5636	5643	25 %	50 %	0 %	25 %	296137664
12	NC_014155	AGGC	2	8	5647	5654	25 %	0 %	50 %	25 %	296137664
13	NC_014155	AGCG	2	8	5821	5828	25 %	0 %	50 %	25 %	296137664
14	NC_014155	TGTT	2	8	5950	5957	0 %	75 %	25 %	0 %	296137664
15	NC_014155	AGCC	2	8	6086	6093	25 %	0 %	25 %	50 %	296137664
16	NC_014155	CTCA	2	8	6508	6515	25 %	25 %	0 %	50 %	296137665
17	NC_014155	GTCG	2	8	6777	6784	0 %	25 %	50 %	25 %	296137665
18	NC_014155	GCGG	2	8	6994	7001	0 %	0 %	75 %	25 %	296137665
19	NC_014155	CCGG	2	8	7054	7061	0 %	0 %	50 %	50 %	296137665
20	NC_014155	CAGA	2	8	7578	7585	50 %	0 %	25 %	25 %	296137665
21	NC_014155	ATCA	2	8	8215	8222	50 %	25 %	0 %	25 %	296137665
22	NC_014155	ATCA	2	8	8359	8366	50 %	25 %	0 %	25 %	296137665
23	NC_014155	TCCA	2	8	8734	8741	25 %	25 %	0 %	50 %	296137666
24	NC_014155	ATGC	2	8	8786	8793	25 %	25 %	25 %	25 %	296137666
25	NC_014155	TCGC	2	8	8901	8908	0 %	25 %	25 %	50 %	296137666
26	NC_014155	CGGC	2	8	9615	9622	0 %	0 %	50 %	50 %	296137667
27	NC_014155	GAAC	2	8	9676	9683	50 %	0 %	25 %	25 %	296137667
28	NC_014155	CGCT	2	8	10314	10321	0 %	25 %	25 %	50 %	296137668
29	NC_014155	GCCG	2	8	11247	11254	0 %	0 %	50 %	50 %	296137669
30	NC_014155	CTGG	2	8	11463	11470	0 %	25 %	50 %	25 %	296137669
31	NC_014155	GACG	2	8	11988	11995	25 %	0 %	50 %	25 %	296137669
32	NC_014155	TCCG	2	8	12268	12275	0 %	25 %	25 %	50 %	296137669
33	NC_014155	CGAC	2	8	13334	13341	25 %	0 %	25 %	50 %	296137669
34	NC_014155	ACGC	2	8	13987	13994	25 %	0 %	25 %	50 %	296137670
35	NC_014155	ACGC	2	8	14040	14047	25 %	0 %	25 %	50 %	296137670
36	NC_014155	TCAG	2	8	14916	14923	25 %	25 %	25 %	25 %	296137672
37	NC_014155	TGGC	2	8	15034	15041	0 %	25 %	50 %	25 %	296137673
38	NC_014155	TCCG	2	8	15738	15745	0 %	25 %	25 %	50 %	296137675
39	NC_014155	GGTT	2	8	16071	16078	0 %	50 %	50 %	0 %	296137675
40	NC_014155	GAAC	2	8	16332	16339	50 %	0 %	25 %	25 %	296137676
41	NC_014155	GCAA	2	8	16369	16376	50 %	0 %	25 %	25 %	296137676
42	NC_014155	TCTT	2	8	16599	16606	0 %	75 %	0 %	25 %	296137676
43	NC_014155	GATT	2	8	16760	16767	25 %	50 %	25 %	0 %	296137676
44	NC_014155	GCGT	2	8	17946	17953	0 %	25 %	50 %	25 %	296137677
45	NC_014155	GGCG	2	8	18281	18288	0 %	0 %	75 %	25 %	296137677
46	NC_014155	TTGC	2	8	18822	18829	0 %	50 %	25 %	25 %	296137678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.