MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014154	GCCGGA	2	12	264	275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137612
2	NC_014154	GTTGCC	2	12	3340	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137617
3	NC_014154	AGGGCC	2	12	5901	5912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137620
4	NC_014154	GCCGAC	2	12	9924	9935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296137623
5	NC_014154	GCCCAC	2	12	10033	10044	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296137623
6	NC_014154	ATTGGC	2	12	10064	10075	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296137623
7	NC_014154	ACGCCG	2	12	11103	11114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296137624
8	NC_014154	CGGCAA	2	12	11406	11417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137624
9	NC_014154	GGCGCG	2	12	12250	12261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137625
10	NC_014154	TTTGGC	2	12	13604	13615	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296137626
11	NC_014154	TCTGCA	2	12	14566	14577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296137627
12	NC_014154	CACCAT	2	12	17194	17205	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	296137628
13	NC_014154	TGGAGC	2	12	29022	29033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296137633
14	NC_014154	GCATGA	2	12	33005	33016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296137640
15	NC_014154	GAGCGC	2	12	34676	34687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137643
16	NC_014154	CCGGTG	2	12	35774	35785	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296137644
17	NC_014154	CGATGA	2	12	36638	36649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296137646
18	NC_014154	CAGGAA	2	12	45541	45552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296137654

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.