MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014154	CGCAG	2	10	1576	1585	20 %	0 %	40 %	40 %	296137613
2	NC_014154	ACCGC	2	10	5025	5034	20 %	0 %	20 %	60 %	296137620
3	NC_014154	GCGAG	2	10	5794	5803	20 %	0 %	60 %	20 %	296137620
4	NC_014154	GGCGC	2	10	6259	6268	0 %	0 %	60 %	40 %	296137620
5	NC_014154	CCCCA	2	10	6929	6938	20 %	0 %	0 %	80 %	296137620
6	NC_014154	GGCGC	2	10	9513	9522	0 %	0 %	60 %	40 %	296137622
7	NC_014154	GCGTT	2	10	12005	12014	0 %	40 %	40 %	20 %	296137625
8	NC_014154	TTTGC	2	10	17052	17061	0 %	60 %	20 %	20 %	296137628
9	NC_014154	TTGCG	2	10	17136	17145	0 %	40 %	40 %	20 %	296137628
10	NC_014154	CCAGC	2	10	17838	17847	20 %	0 %	20 %	60 %	296137628
11	NC_014154	TGTGG	2	10	18935	18944	0 %	40 %	60 %	0 %	296137630
12	NC_014154	GATCG	2	10	29213	29222	20 %	20 %	40 %	20 %	296137633
13	NC_014154	TGGCT	2	10	31004	31013	0 %	40 %	40 %	20 %	296137637
14	NC_014154	GGCCG	2	10	31070	31079	0 %	0 %	60 %	40 %	296137637
15	NC_014154	GATCC	2	10	31277	31286	20 %	20 %	20 %	40 %	296137637
16	NC_014154	GCCGG	2	10	35222	35231	0 %	0 %	60 %	40 %	296137643
17	NC_014154	CCTGC	2	10	36844	36853	0 %	20 %	20 %	60 %	296137647
18	NC_014154	GCAGC	2	10	38269	38278	20 %	0 %	40 %	40 %	296137647
19	NC_014154	CCATC	2	10	42923	42932	20 %	20 %	0 %	60 %	296137652
20	NC_014154	GACGC	2	10	43799	43808	20 %	0 %	40 %	40 %	296137652
21	NC_014154	ACGCT	2	10	44084	44093	20 %	20 %	20 %	40 %	296137653

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.