MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014154	GGC	2	6	43	48	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014154	GCA	2	6	287	292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137612
3	NC_014154	CCG	2	6	294	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137612
4	NC_014154	TGC	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137612
5	NC_014154	GGA	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137612
6	NC_014154	CAG	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137612
7	NC_014154	GAC	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014154	TGC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014154	GCA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
10	NC_014154	CCA	2	6	762	767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137613
11	NC_014154	GCA	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
12	NC_014154	GCA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
13	NC_014154	GCA	2	6	889	894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
14	NC_014154	GCC	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
15	NC_014154	AGC	3	9	1026	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
16	NC_014154	CCG	3	9	1038	1046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
17	NC_014154	GGC	2	6	1114	1119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137613
18	NC_014154	GCC	3	9	1127	1135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
19	NC_014154	GCC	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
20	NC_014154	GCC	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
21	NC_014154	GGC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137613
22	NC_014154	AGC	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
23	NC_014154	GGC	2	6	1321	1326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137613
24	NC_014154	TGG	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137613
25	NC_014154	AAG	2	6	1376	1381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137613
26	NC_014154	CCG	2	6	1395	1400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
27	NC_014154	AGC	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
28	NC_014154	GCC	2	6	1538	1543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
29	NC_014154	ACG	2	6	1773	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137614
30	NC_014154	ACG	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137614
31	NC_014154	TCT	2	6	1903	1908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137614
32	NC_014154	CGA	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137614
33	NC_014154	GCC	2	6	1976	1981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137615
34	NC_014154	GCT	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137615
35	NC_014154	GCA	2	6	2091	2096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137615
36	NC_014154	AGC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137615
37	NC_014154	ACG	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014154	GCC	2	6	2309	2314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
39	NC_014154	TGG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137616
40	NC_014154	GCT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
41	NC_014154	ACC	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137616
42	NC_014154	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
43	NC_014154	TGG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137616
44	NC_014154	CTG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
45	NC_014154	CAG	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137616
46	NC_014154	CGA	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137616
47	NC_014154	ACC	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137616
48	NC_014154	GCG	2	6	2613	2618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137616
49	NC_014154	GCC	2	6	2634	2639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
50	NC_014154	CTG	2	6	2660	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
51	NC_014154	GAT	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137616
52	NC_014154	CCG	3	9	2704	2712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
53	NC_014154	CCG	3	9	2794	2802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
54	NC_014154	GCC	3	9	2829	2837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
55	NC_014154	GGC	2	6	2867	2872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137616
56	NC_014154	CCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
57	NC_014154	CAG	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137616
58	NC_014154	GCC	4	12	3024	3035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
59	NC_014154	TCG	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
60	NC_014154	GCC	2	6	3215	3220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
61	NC_014154	CAT	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137617
62	NC_014154	TCA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137617
63	NC_014154	CGC	2	6	3297	3302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
64	NC_014154	GCA	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137617
65	NC_014154	TCG	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137617
66	NC_014154	TGC	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137617
67	NC_014154	TCG	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137617
68	NC_014154	GAA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137617
69	NC_014154	CGC	2	6	3574	3579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
70	NC_014154	ACC	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137617
71	NC_014154	CAG	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137617
72	NC_014154	GCC	2	6	3838	3843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
73	NC_014154	GCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137618
74	NC_014154	CGC	2	6	3961	3966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137618
75	NC_014154	GCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137618
76	NC_014154	CTT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137618
77	NC_014154	CGT	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137618
78	NC_014154	CGC	2	6	4082	4087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137618
79	NC_014154	TTC	2	6	4110	4115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137618
80	NC_014154	TGA	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137618
81	NC_014154	GAT	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137618
82	NC_014154	AAT	2	6	4362	4367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014154	CGC	2	6	4368	4373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014154	CCG	2	6	4438	4443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014154	CCG	2	6	4596	4601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014154	AGA	2	6	4661	4666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137619
87	NC_014154	CAT	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137619
88	NC_014154	TCA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137619
89	NC_014154	CGG	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137619
90	NC_014154	GCG	3	9	4828	4836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137619
91	NC_014154	CGC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137619
92	NC_014154	AAG	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137619
93	NC_014154	AGC	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
94	NC_014154	GGC	2	6	4947	4952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
95	NC_014154	ACG	3	9	5073	5081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
96	NC_014154	GGC	2	6	5083	5088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
97	NC_014154	CCG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
98	NC_014154	CCG	3	9	5156	5164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
99	NC_014154	GCT	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137620
100	NC_014154	GGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
101	NC_014154	TCA	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137620
102	NC_014154	GGA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137620
103	NC_014154	CGG	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
104	NC_014154	GCT	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137620
105	NC_014154	GCC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
106	NC_014154	AGC	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
107	NC_014154	GCA	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
108	NC_014154	ACG	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
109	NC_014154	GCA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
110	NC_014154	CAC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137620
111	NC_014154	AGC	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
112	NC_014154	GAC	2	6	6374	6379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
113	NC_014154	GCC	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
114	NC_014154	CGC	2	6	6500	6505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
115	NC_014154	AAG	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137620
116	NC_014154	CGC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
117	NC_014154	GCC	2	6	6600	6605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
118	NC_014154	GCG	2	6	6700	6705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
119	NC_014154	GCC	2	6	6719	6724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
120	NC_014154	GCC	2	6	6749	6754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
121	NC_014154	GCC	2	6	6908	6913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
122	NC_014154	CGG	2	6	6982	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
123	NC_014154	GCT	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137621
124	NC_014154	GCC	3	9	7047	7055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137621
125	NC_014154	GCG	2	6	7095	7100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137621
126	NC_014154	TTG	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137621
127	NC_014154	CCT	2	6	7307	7312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137621
128	NC_014154	AGT	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137621
129	NC_014154	CAT	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137621
130	NC_014154	TCA	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137621
131	NC_014154	TCG	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137621
132	NC_014154	TGC	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137621
133	NC_014154	CAA	2	6	7761	7766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014154	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014154	GGC	2	6	7877	7882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014154	TGT	2	6	7883	7888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014154	TGA	2	6	8028	8033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137622
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139	NC_014154	ATC	2	6	8065	8070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
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141	NC_014154	CGG	2	6	8143	8148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
142	NC_014154	CAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
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145	NC_014154	GGC	2	6	8476	8481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
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149	NC_014154	GTC	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137622
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153	NC_014154	ATC	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
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157	NC_014154	GCG	2	6	8960	8965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
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161	NC_014154	ACT	2	6	9215	9220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
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164	NC_014154	AAC	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137622
165	NC_014154	CCG	2	6	9559	9564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137622
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171	NC_014154	CGG	2	6	9727	9732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137623
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179	NC_014154	GAT	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137623
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243	NC_014154	TGA	2	6	14809	14814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137627
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252	NC_014154	GGC	2	6	15184	15189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137627
253	NC_014154	ACC	2	6	15213	15218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137627
254	NC_014154	AAG	2	6	15363	15368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137627
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256	NC_014154	TAG	2	6	15421	15426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137627
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258	NC_014154	GCG	2	6	15463	15468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137627
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261	NC_014154	CGG	2	6	15825	15830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137628
262	NC_014154	CGT	2	6	15900	15905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137628
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264	NC_014154	CTG	3	9	16103	16111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137628
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386	NC_014154	TTC	2	6	24479	24484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
387	NC_014154	GCT	2	6	24572	24577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_014154	TGC	2	6	24741	24746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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394	NC_014154	TTG	2	6	25331	25336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_014154	TCG	2	6	26715	26720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_014154	GGA	2	6	26802	26807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
414	NC_014154	GGC	2	6	26915	26920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137633
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499	NC_014154	TGC	3	9	32342	32350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_014154	GCG	2	6	32412	32417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137640

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