MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014154	GGC	2	6	43	48	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014154	GAC	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014154	TGC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014154	ACG	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014154	AAT	2	6	4362	4367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014154	CGC	2	6	4368	4373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014154	CCG	2	6	4438	4443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014154	CCG	2	6	4596	4601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014154	CAA	2	6	7761	7766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014154	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014154	GGC	2	6	7877	7882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014154	TGT	2	6	7883	7888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014154	GTC	2	6	18617	18622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014154	GCC	2	6	18656	18661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014154	CCT	2	6	20327	20332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014154	GCG	2	6	20377	20382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014154	GCC	2	6	20467	20472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014154	CGG	2	6	20490	20495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014154	TGG	2	6	20543	20548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014154	CAC	2	6	20601	20606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014154	CAC	2	6	20621	20626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014154	GAA	2	6	20661	20666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014154	TCC	2	6	20683	20688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014154	TGG	2	6	20869	20874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014154	CTT	2	6	20957	20962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014154	GGC	2	6	20979	20984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014154	TCG	2	6	21001	21006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014154	GAT	2	6	21068	21073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014154	GGA	2	6	21080	21085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014154	TGG	2	6	21190	21195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014154	TCA	2	6	21235	21240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014154	CTG	2	6	21339	21344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014154	ACG	2	6	21471	21476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014154	GTG	2	6	21534	21539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014154	GGT	2	6	21563	21568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014154	CAG	2	6	21579	21584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014154	TGG	2	6	21607	21612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014154	TCA	2	6	21697	21702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014154	CGA	2	6	21845	21850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014154	GCG	2	6	21857	21862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014154	CTG	2	6	21867	21872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014154	GCG	2	6	21949	21954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014154	GAC	2	6	21969	21974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014154	GCT	2	6	21991	21996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014154	CGG	2	6	22021	22026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014154	GCG	2	6	22045	22050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014154	GCT	2	6	22106	22111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014154	CCG	2	6	22114	22119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014154	AGG	2	6	22350	22355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014154	CTG	2	6	22519	22524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014154	CGA	2	6	22539	22544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014154	CCG	2	6	22688	22693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014154	TCG	2	6	22713	22718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014154	CAC	2	6	22827	22832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014154	GCG	2	6	22976	22981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014154	GCG	2	6	22993	22998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014154	GGT	2	6	23012	23017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014154	CAC	2	6	23021	23026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014154	TCG	2	6	23185	23190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014154	AGC	2	6	23202	23207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014154	GCA	2	6	23371	23376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014154	CGT	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014154	CAT	2	6	23514	23519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014154	ACT	2	6	23569	23574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014154	GCA	2	6	23579	23584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014154	TGC	2	6	23653	23658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014154	GGT	2	6	23683	23688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014154	GTG	2	6	23693	23698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014154	AAG	2	6	23741	23746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014154	GAC	2	6	23807	23812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014154	AAG	2	6	23816	23821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014154	GTG	2	6	23828	23833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014154	GAT	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014154	CCA	2	6	23889	23894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014154	GTG	2	6	23921	23926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014154	AGC	2	6	23976	23981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014154	CAA	2	6	24046	24051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014154	GGA	2	6	24073	24078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014154	CTG	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014154	AAG	2	6	24161	24166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014154	TGA	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014154	ACG	2	6	24225	24230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014154	TCA	2	6	24255	24260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014154	AGA	2	6	24333	24338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014154	AGA	2	6	24450	24455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014154	TCG	2	6	24459	24464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014154	TTC	2	6	24479	24484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014154	GCT	2	6	24572	24577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014154	TGC	2	6	24741	24746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014154	CTA	2	6	24751	24756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014154	CGA	2	6	24877	24882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014154	ACA	2	6	24987	24992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014154	GCG	2	6	25043	25048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014154	GTA	2	6	25311	25316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014154	TTG	2	6	25331	25336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014154	CAC	2	6	25481	25486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014154	CCT	2	6	25653	25658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014154	TGG	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014154	TCA	2	6	25755	25760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014154	CCA	2	6	25899	25904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014154	CTG	2	6	26012	26017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014154	CGG	2	6	26020	26025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014154	CGC	2	6	26092	26097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014154	ACG	2	6	26124	26129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014154	TCT	3	9	26199	26207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014154	AAG	2	6	26264	26269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014154	TGC	2	6	26271	26276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014154	GCG	2	6	26333	26338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014154	AGA	2	6	26380	26385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014154	CTA	2	6	26419	26424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014154	GCC	2	6	26588	26593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014154	GTG	2	6	26632	26637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014154	TCG	2	6	26715	26720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014154	GGA	2	6	26802	26807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014154	GCG	2	6	29507	29512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014154	TCC	2	6	29516	29521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014154	GGC	2	6	29559	29564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014154	CCT	2	6	30165	30170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014154	CGC	2	6	30202	30207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014154	TCT	2	6	32197	32202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014154	GGA	2	6	32309	32314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014154	TGC	3	9	32342	32350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014154	GAC	2	6	33399	33404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014154	TTG	2	6	33444	33449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014154	TGA	2	6	34025	34030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014154	CAT	2	6	35348	35353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014154	CCG	2	6	35385	35390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014154	GGC	2	6	35426	35431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014154	GGA	2	6	35453	35458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014154	GCT	2	6	35835	35840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014154	TGG	2	6	36271	36276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014154	ACC	2	6	36285	36290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014154	GGC	2	6	36493	36498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014154	GCC	2	6	36505	36510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014154	CCT	2	6	36665	36670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_014154	GCC	2	6	36726	36731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014154	CTA	2	6	40291	40296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014154	AGG	2	6	40525	40530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014154	GAT	2	6	41101	41106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014154	CAA	2	6	41112	41117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014154	CGG	2	6	41161	41166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014154	GGC	2	6	41169	41174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014154	CTG	2	6	41238	41243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014154	CGT	2	6	41273	41278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014154	CAC	2	6	41662	41667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_014154	GCA	2	6	45711	45716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.