MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014154	GCA	2	6	287	292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137612
2	NC_014154	CCG	2	6	294	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137612
3	NC_014154	TGC	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137612
4	NC_014154	GGA	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137612
5	NC_014154	CAG	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137612
6	NC_014154	GCA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
7	NC_014154	CCA	2	6	762	767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137613
8	NC_014154	GCA	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
9	NC_014154	GCA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
10	NC_014154	GCA	2	6	889	894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
11	NC_014154	GCC	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
12	NC_014154	AGC	3	9	1026	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
13	NC_014154	CCG	3	9	1038	1046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
14	NC_014154	GGC	2	6	1114	1119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137613
15	NC_014154	GCC	3	9	1127	1135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
16	NC_014154	GCC	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
17	NC_014154	GCC	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
18	NC_014154	GGC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137613
19	NC_014154	AGC	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
20	NC_014154	GGC	2	6	1321	1326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137613
21	NC_014154	TGG	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137613
22	NC_014154	AAG	2	6	1376	1381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137613
23	NC_014154	CCG	2	6	1395	1400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
24	NC_014154	AGC	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137613
25	NC_014154	GCC	2	6	1538	1543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137613
26	NC_014154	ACG	2	6	1773	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137614
27	NC_014154	ACG	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137614
28	NC_014154	TCT	2	6	1903	1908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137614
29	NC_014154	CGA	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137614
30	NC_014154	GCC	2	6	1976	1981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137615
31	NC_014154	GCT	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137615
32	NC_014154	GCA	2	6	2091	2096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137615
33	NC_014154	AGC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137615
34	NC_014154	GCC	2	6	2309	2314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
35	NC_014154	TGG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137616
36	NC_014154	GCT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
37	NC_014154	ACC	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137616
38	NC_014154	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
39	NC_014154	TGG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137616
40	NC_014154	CTG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
41	NC_014154	CAG	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137616
42	NC_014154	CGA	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137616
43	NC_014154	ACC	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137616
44	NC_014154	GCG	2	6	2613	2618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137616
45	NC_014154	GCC	2	6	2634	2639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
46	NC_014154	CTG	2	6	2660	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
47	NC_014154	GAT	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137616
48	NC_014154	CCG	3	9	2704	2712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
49	NC_014154	CCG	3	9	2794	2802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
50	NC_014154	GCC	3	9	2829	2837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
51	NC_014154	GGC	2	6	2867	2872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137616
52	NC_014154	CCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
53	NC_014154	CAG	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137616
54	NC_014154	GCC	4	12	3024	3035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137616
55	NC_014154	TCG	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137616
56	NC_014154	GCC	2	6	3215	3220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
57	NC_014154	CAT	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137617
58	NC_014154	TCA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137617
59	NC_014154	CGC	2	6	3297	3302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
60	NC_014154	GCA	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137617
61	NC_014154	TCG	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137617
62	NC_014154	TGC	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137617
63	NC_014154	TCG	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137617
64	NC_014154	GAA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137617
65	NC_014154	CGC	2	6	3574	3579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
66	NC_014154	ACC	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137617
67	NC_014154	CAG	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137617
68	NC_014154	GCC	2	6	3838	3843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137617
69	NC_014154	GCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137618
70	NC_014154	CGC	2	6	3961	3966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137618
71	NC_014154	GCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137618
72	NC_014154	CTT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137618
73	NC_014154	CGT	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137618
74	NC_014154	CGC	2	6	4082	4087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137618
75	NC_014154	TTC	2	6	4110	4115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137618
76	NC_014154	TGA	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137618
77	NC_014154	GAT	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137618
78	NC_014154	AGA	2	6	4661	4666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137619
79	NC_014154	CAT	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137619
80	NC_014154	TCA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137619
81	NC_014154	CGG	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137619
82	NC_014154	GCG	3	9	4828	4836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137619
83	NC_014154	CGC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137619
84	NC_014154	AAG	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137619
85	NC_014154	AGC	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
86	NC_014154	GGC	2	6	4947	4952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
87	NC_014154	ACG	3	9	5073	5081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
88	NC_014154	GGC	2	6	5083	5088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
89	NC_014154	CCG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
90	NC_014154	CCG	3	9	5156	5164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
91	NC_014154	GCT	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137620
92	NC_014154	GGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
93	NC_014154	TCA	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137620
94	NC_014154	GGA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137620
95	NC_014154	CGG	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
96	NC_014154	GCT	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137620
97	NC_014154	GCC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
98	NC_014154	AGC	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
99	NC_014154	GCA	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
100	NC_014154	ACG	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
101	NC_014154	GCA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
102	NC_014154	CAC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137620
103	NC_014154	AGC	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
104	NC_014154	GAC	2	6	6374	6379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137620
105	NC_014154	GCC	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
106	NC_014154	CGC	2	6	6500	6505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
107	NC_014154	AAG	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137620
108	NC_014154	CGC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
109	NC_014154	GCC	2	6	6600	6605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
110	NC_014154	GCG	2	6	6700	6705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
111	NC_014154	GCC	2	6	6719	6724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
112	NC_014154	GCC	2	6	6749	6754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
113	NC_014154	GCC	2	6	6908	6913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137620
114	NC_014154	CGG	2	6	6982	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137620
115	NC_014154	GCT	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137621
116	NC_014154	GCC	3	9	7047	7055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137621
117	NC_014154	GCG	2	6	7095	7100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137621
118	NC_014154	TTG	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137621
119	NC_014154	CCT	2	6	7307	7312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137621
120	NC_014154	AGT	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137621
121	NC_014154	CAT	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137621
122	NC_014154	TCA	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137621
123	NC_014154	TCG	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137621
124	NC_014154	TGC	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137621
125	NC_014154	TGA	2	6	8028	8033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137622
126	NC_014154	CGT	2	6	8053	8058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137622
127	NC_014154	ATC	2	6	8065	8070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
128	NC_014154	CGG	2	6	8117	8122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
129	NC_014154	CGG	2	6	8143	8148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
130	NC_014154	CAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
131	NC_014154	GGC	2	6	8319	8324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
132	NC_014154	CGG	2	6	8434	8439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
133	NC_014154	GGC	2	6	8476	8481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
134	NC_014154	CCT	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137622
135	NC_014154	CGC	2	6	8501	8506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137622
136	NC_014154	GCC	2	6	8579	8584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137622
137	NC_014154	GTC	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137622
138	NC_014154	TGC	2	6	8762	8767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137622
139	NC_014154	AGC	2	6	8822	8827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137622
140	NC_014154	GGC	2	6	8872	8877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
141	NC_014154	ATC	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
142	NC_014154	GAT	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137622
143	NC_014154	ACG	2	6	8918	8923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137622
144	NC_014154	AAC	2	6	8934	8939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137622
145	NC_014154	GCG	2	6	8960	8965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
146	NC_014154	ACC	2	6	9072	9077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137622
147	NC_014154	GGC	2	6	9078	9083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
148	NC_014154	TCC	2	6	9167	9172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137622
149	NC_014154	ACT	2	6	9215	9220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137622
150	NC_014154	GCA	2	6	9330	9335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137622
151	NC_014154	CGG	2	6	9371	9376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137622
152	NC_014154	AAC	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137622
153	NC_014154	CCG	2	6	9559	9564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137622
154	NC_014154	CGC	2	6	9575	9580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137622
155	NC_014154	AGC	2	6	9614	9619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137622
156	NC_014154	GAG	2	6	9646	9651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137622
157	NC_014154	CAT	2	6	9674	9679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137623
158	NC_014154	GGC	2	6	9701	9706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137623
159	NC_014154	CGG	2	6	9727	9732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137623
160	NC_014154	CTG	3	9	9849	9857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137623
161	NC_014154	CAA	2	6	9869	9874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137623
162	NC_014154	GAT	2	6	9884	9889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137623
163	NC_014154	GCT	2	6	10004	10009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137623
164	NC_014154	CGA	2	6	10112	10117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137623
165	NC_014154	CCG	2	6	10151	10156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137623
166	NC_014154	GAT	2	6	10280	10285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137623
167	NC_014154	GAT	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137623
168	NC_014154	TGC	2	6	10314	10319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137623
169	NC_014154	GCT	2	6	10322	10327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137623
170	NC_014154	GCC	2	6	10357	10362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137623
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244	NC_014154	TAG	2	6	15421	15426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137627
245	NC_014154	ACC	3	9	15436	15444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137627
246	NC_014154	GCG	2	6	15463	15468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137627
247	NC_014154	AAC	2	6	15549	15554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137627
248	NC_014154	ACA	2	6	15629	15634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137628
249	NC_014154	CGG	2	6	15825	15830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137628
250	NC_014154	CGT	2	6	15900	15905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137628
251	NC_014154	GTC	2	6	15970	15975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137628
252	NC_014154	CTG	3	9	16103	16111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137628
253	NC_014154	ACG	2	6	16172	16177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137628
254	NC_014154	GCT	2	6	16209	16214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137628
255	NC_014154	GGT	2	6	16254	16259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137628
256	NC_014154	TAG	2	6	16268	16273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137628
257	NC_014154	TGC	2	6	16422	16427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137628
258	NC_014154	CTT	2	6	16536	16541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137628
259	NC_014154	CGC	2	6	16551	16556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137628
260	NC_014154	TGA	2	6	16560	16565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137628
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262	NC_014154	ACC	2	6	16646	16651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137628
263	NC_014154	GCG	2	6	16704	16709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137628
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268	NC_014154	CGC	2	6	17206	17211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137628
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271	NC_014154	GGC	2	6	17740	17745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137628
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279	NC_014154	ACT	2	6	18340	18345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137629
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284	NC_014154	TCG	2	6	18988	18993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137630
285	NC_014154	GTG	2	6	19083	19088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137630
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376	NC_014154	CGG	2	6	32017	32022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137639
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499	NC_014154	GCC	2	6	41080	41085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137650
500	NC_014154	CGA	2	6	41460	41465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137651

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