MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014154	GC	3	6	475	480	0 %	0 %	50 %	50 %	296137612
2	NC_014154	TG	4	8	504	511	0 %	50 %	50 %	0 %	296137612
3	NC_014154	GC	3	6	832	837	0 %	0 %	50 %	50 %	296137613
4	NC_014154	GC	3	6	955	960	0 %	0 %	50 %	50 %	296137613
5	NC_014154	CT	3	6	1907	1912	0 %	50 %	0 %	50 %	296137614
6	NC_014154	GC	3	6	2690	2695	0 %	0 %	50 %	50 %	296137616
7	NC_014154	CG	3	6	3789	3794	0 %	0 %	50 %	50 %	296137617
8	NC_014154	GC	3	6	4689	4694	0 %	0 %	50 %	50 %	296137619
9	NC_014154	GC	3	6	4724	4729	0 %	0 %	50 %	50 %	296137619
10	NC_014154	GC	3	6	4732	4737	0 %	0 %	50 %	50 %	296137619
11	NC_014154	GC	3	6	5045	5050	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
12	NC_014154	GC	3	6	5171	5176	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
13	NC_014154	CG	3	6	5583	5588	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
14	NC_014154	GC	3	6	5744	5749	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
15	NC_014154	GC	3	6	6083	6088	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
16	NC_014154	CG	3	6	6122	6127	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
17	NC_014154	GC	3	6	6137	6142	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
18	NC_014154	CG	3	6	6200	6205	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
19	NC_014154	GC	3	6	6227	6232	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
20	NC_014154	GC	3	6	6347	6352	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
21	NC_014154	GC	3	6	6361	6366	0 %	0 %	50 %	50 %	296137620
22	NC_014154	CG	3	6	7065	7070	0 %	0 %	50 %	50 %	296137621
23	NC_014154	GC	3	6	8047	8052	0 %	0 %	50 %	50 %	296137622
24	NC_014154	GC	3	6	8377	8382	0 %	0 %	50 %	50 %	296137622
25	NC_014154	CG	3	6	9290	9295	0 %	0 %	50 %	50 %	296137622
26	NC_014154	GC	3	6	10021	10026	0 %	0 %	50 %	50 %	296137623
27	NC_014154	CG	3	6	10222	10227	0 %	0 %	50 %	50 %	296137623
28	NC_014154	GC	3	6	10927	10932	0 %	0 %	50 %	50 %	296137624
29	NC_014154	GC	3	6	12421	12426	0 %	0 %	50 %	50 %	296137625
30	NC_014154	GC	3	6	12806	12811	0 %	0 %	50 %	50 %	296137626
31	NC_014154	GC	3	6	13648	13653	0 %	0 %	50 %	50 %	296137626
32	NC_014154	GC	3	6	13662	13667	0 %	0 %	50 %	50 %	296137626
33	NC_014154	CG	3	6	13951	13956	0 %	0 %	50 %	50 %	296137626
34	NC_014154	GC	3	6	16629	16634	0 %	0 %	50 %	50 %	296137628
35	NC_014154	GT	3	6	16749	16754	0 %	50 %	50 %	0 %	296137628
36	NC_014154	AC	3	6	18702	18707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014154	GC	3	6	19730	19735	0 %	0 %	50 %	50 %	296137631
38	NC_014154	GC	3	6	20258	20263	0 %	0 %	50 %	50 %	296137632
39	NC_014154	GC	3	6	21356	21361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014154	GC	3	6	22419	22424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014154	GC	3	6	23854	23859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014154	CG	3	6	24128	24133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014154	GC	3	6	24923	24928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014154	CG	3	6	25401	25406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014154	GC	3	6	26847	26852	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
46	NC_014154	CG	3	6	27030	27035	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
47	NC_014154	TG	3	6	27292	27297	0 %	50 %	50 %	0 %	296137633
48	NC_014154	CG	3	6	27924	27929	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
49	NC_014154	CG	4	8	28222	28229	0 %	0 %	50 %	50 %	296137633
50	NC_014154	GA	3	6	28233	28238	50 %	0 %	50 %	0 %	296137633
51	NC_014154	AC	3	6	29270	29275	50 %	0 %	0 %	50 %	296137633
52	NC_014154	TA	5	10	30273	30282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014154	CG	3	6	30381	30386	0 %	0 %	50 %	50 %	296137636
54	NC_014154	CG	3	6	31261	31266	0 %	0 %	50 %	50 %	296137637
55	NC_014154	TA	5	10	31395	31404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014154	TA	3	6	31411	31416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014154	TA	5	10	32278	32287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014154	AT	4	8	32361	32368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014154	GT	3	6	32395	32400	0 %	50 %	50 %	0 %	296137640
60	NC_014154	TA	5	10	33335	33344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014154	TA	5	10	33355	33364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014154	GA	3	6	33804	33809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014154	GC	3	6	33991	33996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014154	CG	3	6	34179	34184	0 %	0 %	50 %	50 %	296137643
65	NC_014154	GC	3	6	34960	34965	0 %	0 %	50 %	50 %	296137643
66	NC_014154	CG	3	6	35356	35361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014154	CG	3	6	35389	35394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014154	GC	3	6	35685	35690	0 %	0 %	50 %	50 %	296137644
69	NC_014154	TA	5	10	36204	36213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014154	TG	3	6	36239	36244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014154	GC	3	6	36434	36439	0 %	0 %	50 %	50 %	296137645
72	NC_014154	GT	3	6	36573	36578	0 %	50 %	50 %	0 %	296137646
73	NC_014154	TG	3	6	36632	36637	0 %	50 %	50 %	0 %	296137646
74	NC_014154	CG	3	6	37711	37716	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
75	NC_014154	CG	3	6	37764	37769	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
76	NC_014154	CG	3	6	38113	38118	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
77	NC_014154	CG	3	6	38786	38791	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
78	NC_014154	GC	3	6	38849	38854	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
79	NC_014154	GC	3	6	38884	38889	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
80	NC_014154	AC	3	6	38931	38936	50 %	0 %	0 %	50 %	296137647
81	NC_014154	GC	3	6	39253	39258	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
82	NC_014154	CG	3	6	39561	39566	0 %	0 %	50 %	50 %	296137647
83	NC_014154	GC	3	6	39939	39944	0 %	0 %	50 %	50 %	296137648
84	NC_014154	GC	3	6	39958	39963	0 %	0 %	50 %	50 %	296137648
85	NC_014154	TA	3	6	40499	40504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014154	GC	3	6	40583	40588	0 %	0 %	50 %	50 %	296137649
87	NC_014154	CG	3	6	40681	40686	0 %	0 %	50 %	50 %	296137649
88	NC_014154	GC	3	6	40736	40741	0 %	0 %	50 %	50 %	296137649
89	NC_014154	TG	3	6	40858	40863	0 %	50 %	50 %	0 %	296137650
90	NC_014154	CG	4	8	40887	40894	0 %	0 %	50 %	50 %	296137650
91	NC_014154	AC	3	6	43087	43092	50 %	0 %	0 %	50 %	296137652
92	NC_014154	GC	4	8	43251	43258	0 %	0 %	50 %	50 %	296137652
93	NC_014154	AC	3	6	43817	43822	50 %	0 %	0 %	50 %	296137652
94	NC_014154	AC	3	6	44578	44583	50 %	0 %	0 %	50 %	296137653
95	NC_014154	GC	3	6	44914	44919	0 %	0 %	50 %	50 %	296137653
96	NC_014154	GA	3	6	45008	45013	50 %	0 %	50 %	0 %	296137653
97	NC_014154	GA	3	6	45431	45436	50 %	0 %	50 %	0 %	296137654
98	NC_014154	GA	3	6	45488	45493	50 %	0 %	50 %	0 %	296137654

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.