MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 1773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014152	CTGAT	2	10	279	288	20 %	40 %	20 %	20 %	296131551
2	NC_014152	TATCT	2	10	1728	1737	20 %	60 %	0 %	20 %	296131552
3	NC_014152	AATTG	2	10	2909	2918	40 %	40 %	20 %	0 %	296131553
4	NC_014152	ATTAA	2	10	3300	3309	60 %	40 %	0 %	0 %	296131554
5	NC_014152	TTTTC	2	10	4328	4337	0 %	80 %	0 %	20 %	296131555
6	NC_014152	AGGCA	2	10	5025	5034	40 %	0 %	40 %	20 %	296131557
7	NC_014152	GAAAA	2	10	5600	5609	80 %	0 %	20 %	0 %	296131557
8	NC_014152	TCGAC	2	10	5895	5904	20 %	20 %	20 %	40 %	296131557
9	NC_014152	TCTTT	2	10	7153	7162	0 %	80 %	0 %	20 %	296131558
10	NC_014152	ATGAA	2	10	8486	8495	60 %	20 %	20 %	0 %	296131559
11	NC_014152	AAGGC	2	10	10436	10445	40 %	0 %	40 %	20 %	296131559
12	NC_014152	GGGCA	2	10	10479	10488	20 %	0 %	60 %	20 %	296131559
13	NC_014152	ATGCC	2	10	14390	14399	20 %	20 %	20 %	40 %	296131562
14	NC_014152	AAAAT	2	10	18861	18870	80 %	20 %	0 %	0 %	296131565
15	NC_014152	TTTTA	2	10	21259	21268	20 %	80 %	0 %	0 %	296131568
16	NC_014152	AAGGT	2	10	23568	23577	40 %	20 %	40 %	0 %	296131569
17	NC_014152	TTGAT	2	10	30891	30900	20 %	60 %	20 %	0 %	296131575
18	NC_014152	TCTTT	2	10	32597	32606	0 %	80 %	0 %	20 %	296131578
19	NC_014152	GCTTT	2	10	34408	34417	0 %	60 %	20 %	20 %	296131579
20	NC_014152	AGGGA	2	10	36778	36787	40 %	0 %	60 %	0 %	296131580
21	NC_014152	GGATG	2	10	37590	37599	20 %	20 %	60 %	0 %	296131581
22	NC_014152	TATAT	2	10	42484	42493	40 %	60 %	0 %	0 %	296131585
23	NC_014152	AAAAG	2	10	43110	43119	80 %	0 %	20 %	0 %	296131586
24	NC_014152	ATTTA	2	10	44839	44848	40 %	60 %	0 %	0 %	296131587
25	NC_014152	TCTGG	2	10	48586	48595	0 %	40 %	40 %	20 %	296131593
26	NC_014152	ACGGC	2	10	48711	48720	20 %	0 %	40 %	40 %	296131593
27	NC_014152	CAGCT	2	10	52194	52203	20 %	20 %	20 %	40 %	296131597
28	NC_014152	AACAG	2	10	52339	52348	60 %	0 %	20 %	20 %	296131598
29	NC_014152	AAAGA	2	10	54713	54722	80 %	0 %	20 %	0 %	296131600
30	NC_014152	GCAAA	2	10	58740	58749	60 %	0 %	20 %	20 %	296131605
31	NC_014152	GTTAA	2	10	60846	60855	40 %	40 %	20 %	0 %	296131606
32	NC_014152	CAGTT	2	10	61413	61422	20 %	40 %	20 %	20 %	296131607
33	NC_014152	CCCGG	2	10	62336	62345	0 %	0 %	40 %	60 %	296131607
34	NC_014152	AAAGA	2	10	62882	62891	80 %	0 %	20 %	0 %	296131608
35	NC_014152	CCGGC	2	10	65762	65771	0 %	0 %	40 %	60 %	296131611
36	NC_014152	TTATC	2	10	65945	65954	20 %	60 %	0 %	20 %	296131611
37	NC_014152	TGGTT	2	10	67555	67564	0 %	60 %	40 %	0 %	296131613
38	NC_014152	TGGAT	2	10	68156	68165	20 %	40 %	40 %	0 %	296131614
39	NC_014152	GGCCG	2	10	69739	69748	0 %	0 %	60 %	40 %	296131615
40	NC_014152	GGTGA	2	10	69867	69876	20 %	20 %	60 %	0 %	296131615
41	NC_014152	GCAAA	2	10	74192	74201	60 %	0 %	20 %	20 %	296131620
42	NC_014152	TAAAA	2	10	74410	74419	80 %	20 %	0 %	0 %	296131620
43	NC_014152	GGCCG	2	10	75443	75452	0 %	0 %	60 %	40 %	296131621
44	NC_014152	GCCAC	2	10	75961	75970	20 %	0 %	20 %	60 %	296131621
45	NC_014152	TTAAC	2	10	76818	76827	40 %	40 %	0 %	20 %	296131622
46	NC_014152	TAAAT	2	10	81430	81439	60 %	40 %	0 %	0 %	296131629
47	NC_014152	TTTCA	2	10	91075	91084	20 %	60 %	0 %	20 %	296131634
48	NC_014152	GCCAG	2	10	91392	91401	20 %	0 %	40 %	40 %	296131634
49	NC_014152	ACCGA	2	10	92655	92664	40 %	0 %	20 %	40 %	296131635
50	NC_014152	GTGAT	2	10	94275	94284	20 %	40 %	40 %	0 %	296131637
51	NC_014152	GGGTT	2	10	95079	95088	0 %	40 %	60 %	0 %	296131638
52	NC_014152	TGACC	2	10	95378	95387	20 %	20 %	20 %	40 %	296131638
53	NC_014152	CGACC	2	10	97869	97878	20 %	0 %	20 %	60 %	296131642
54	NC_014152	AGGCA	2	10	98622	98631	40 %	0 %	40 %	20 %	296131643
55	NC_014152	GAAAA	2	10	99197	99206	80 %	0 %	20 %	0 %	296131643
56	NC_014152	TCGAC	2	10	99492	99501	20 %	20 %	20 %	40 %	296131643
57	NC_014152	ATAAA	2	10	104109	104118	80 %	20 %	0 %	0 %	296131646
58	NC_014152	ATTTA	2	10	104138	104147	40 %	60 %	0 %	0 %	296131647
59	NC_014152	ACAGG	2	10	113824	113833	40 %	0 %	40 %	20 %	296131655
60	NC_014152	TTGGT	2	10	113969	113978	0 %	60 %	40 %	0 %	296131655
61	NC_014152	CCATG	2	10	116168	116177	20 %	20 %	20 %	40 %	296131658
62	NC_014152	CAAGC	2	10	117435	117444	40 %	0 %	20 %	40 %	296131658
63	NC_014152	GAAAA	2	10	120533	120542	80 %	0 %	20 %	0 %	296131662
64	NC_014152	GACCG	2	10	126290	126299	20 %	0 %	40 %	40 %	296131667
65	NC_014152	CCAAT	2	10	127927	127936	40 %	20 %	0 %	40 %	296131668
66	NC_014152	GGCCA	2	10	130151	130160	20 %	0 %	40 %	40 %	296131670
67	NC_014152	TTGAT	2	10	133437	133446	20 %	60 %	20 %	0 %	296131672
68	NC_014152	GGTGG	2	10	134179	134188	0 %	20 %	80 %	0 %	296131673
69	NC_014152	TTTTG	2	10	134583	134592	0 %	80 %	20 %	0 %	296131673
70	NC_014152	CAGGC	2	10	135521	135530	20 %	0 %	40 %	40 %	296131673
71	NC_014152	CAGCG	2	10	137052	137061	20 %	0 %	40 %	40 %	296131674
72	NC_014152	GGAGA	2	10	137182	137191	40 %	0 %	60 %	0 %	296131675
73	NC_014152	CCCAT	2	10	139126	139135	20 %	20 %	0 %	60 %	296131677
74	NC_014152	GCTTT	2	10	142864	142873	0 %	60 %	20 %	20 %	296131680
75	NC_014152	AATTA	2	10	143335	143344	60 %	40 %	0 %	0 %	296131681
76	NC_014152	TTAAT	2	10	143995	144004	40 %	60 %	0 %	0 %	296131683
77	NC_014152	ACGGG	2	10	144656	144665	20 %	0 %	60 %	20 %	296131684
78	NC_014152	TGGGC	2	10	147917	147926	0 %	20 %	60 %	20 %	296131686
79	NC_014152	CAGTC	2	10	149683	149692	20 %	20 %	20 %	40 %	296131688
80	NC_014152	TGGGT	2	10	149923	149932	0 %	40 %	60 %	0 %	296131688
81	NC_014152	TCCGG	2	10	156060	156069	0 %	20 %	40 %	40 %	296131694
82	NC_014152	GGACA	2	10	156362	156371	40 %	0 %	40 %	20 %	296131694
83	NC_014152	ACCTT	2	10	156606	156615	20 %	40 %	0 %	40 %	296131695
84	NC_014152	ACAAT	2	10	158304	158313	60 %	20 %	0 %	20 %	296131696
85	NC_014152	TTCAT	2	10	161252	161261	20 %	60 %	0 %	20 %	296131698
86	NC_014152	CCTGA	2	10	164344	164353	20 %	20 %	20 %	40 %	296131698
87	NC_014152	TAACA	2	10	166233	166242	60 %	20 %	0 %	20 %	296131699
88	NC_014152	AACTG	2	10	167610	167619	40 %	20 %	20 %	20 %	296131701
89	NC_014152	GGGTT	2	10	168052	168061	0 %	40 %	60 %	0 %	296131702
90	NC_014152	ACCGT	2	10	170034	170043	20 %	20 %	20 %	40 %	296131703
91	NC_014152	ATTAC	2	10	171988	171997	40 %	40 %	0 %	20 %	296131705
92	NC_014152	ACCTT	2	10	174147	174156	20 %	40 %	0 %	40 %	296131707
93	NC_014152	ACCTG	2	10	177367	177376	20 %	20 %	20 %	40 %	296131710
94	NC_014152	AAGTG	2	10	177817	177826	40 %	20 %	40 %	0 %	296131711
95	NC_014152	CCGTT	2	10	182603	182612	0 %	40 %	20 %	40 %	296131716
96	NC_014152	ACTGG	2	10	184116	184125	20 %	20 %	40 %	20 %	296131717
97	NC_014152	AACCG	2	10	185080	185089	40 %	0 %	20 %	40 %	296131718
98	NC_014152	CGGTT	2	10	185454	185463	0 %	40 %	40 %	20 %	296131719
99	NC_014152	CCGGA	2	10	185637	185646	20 %	0 %	40 %	40 %	296131719
100	NC_014152	CATTA	2	10	186141	186150	40 %	40 %	0 %	20 %	296131720
101	NC_014152	CCTGG	2	10	186173	186182	0 %	20 %	40 %	40 %	296131720
102	NC_014152	TTTTA	2	10	186222	186231	20 %	80 %	0 %	0 %	296131720
103	NC_014152	AATTC	2	10	186467	186476	40 %	40 %	0 %	20 %	296131721
104	NC_014152	AAATT	2	10	187835	187844	60 %	40 %	0 %	0 %	296131721
105	NC_014152	ATAAA	2	10	194498	194507	80 %	20 %	0 %	0 %	296131725
106	NC_014152	AATAA	2	10	197069	197078	80 %	20 %	0 %	0 %	296131727
107	NC_014152	AGGCA	2	10	202189	202198	40 %	0 %	40 %	20 %	296131735
108	NC_014152	GAAAA	2	10	202764	202773	80 %	0 %	20 %	0 %	296131735
109	NC_014152	TCGAC	2	10	203059	203068	20 %	20 %	20 %	40 %	296131735
110	NC_014152	AGGGG	2	10	204413	204422	20 %	0 %	80 %	0 %	296131737
111	NC_014152	AATTT	2	10	209037	209046	40 %	60 %	0 %	0 %	296131740
112	NC_014152	GATTC	2	10	210541	210550	20 %	40 %	20 %	20 %	296131743
113	NC_014152	TCTGT	2	10	210996	211005	0 %	60 %	20 %	20 %	296131744
114	NC_014152	GAAAG	2	10	217835	217844	60 %	0 %	40 %	0 %	296131748
115	NC_014152	TTTAC	2	10	218145	218154	20 %	60 %	0 %	20 %	296131748
116	NC_014152	AGTCA	2	10	218586	218595	40 %	20 %	20 %	20 %	296131749
117	NC_014152	TGGAA	2	10	218614	218623	40 %	20 %	40 %	0 %	296131749
118	NC_014152	AAAGC	2	10	218773	218782	60 %	0 %	20 %	20 %	296131749
119	NC_014152	GGGTT	2	10	220770	220779	0 %	40 %	60 %	0 %	296131750
120	NC_014152	CGGCC	2	10	224603	224612	0 %	0 %	40 %	60 %	296131755
121	NC_014152	CCCGA	2	10	227581	227590	20 %	0 %	20 %	60 %	296131759
122	NC_014152	AAATA	2	10	228245	228254	80 %	20 %	0 %	0 %	296131759
123	NC_014152	TTTGG	2	10	228823	228832	0 %	60 %	40 %	0 %	296131760
124	NC_014152	GGTTT	2	10	229460	229469	0 %	60 %	40 %	0 %	296131760
125	NC_014152	CCCTG	2	10	229817	229826	0 %	20 %	20 %	60 %	296131760
126	NC_014152	AGCGG	2	10	230057	230066	20 %	0 %	60 %	20 %	296131761
127	NC_014152	AGCTG	2	10	243905	243914	20 %	20 %	40 %	20 %	296131773
128	NC_014152	TGGAA	2	10	251797	251806	40 %	20 %	40 %	0 %	296131776
129	NC_014152	TTTGT	2	10	253822	253831	0 %	80 %	20 %	0 %	296131777
130	NC_014152	TTCAA	2	10	256289	256298	40 %	40 %	0 %	20 %	296131780
131	NC_014152	AAAGA	2	10	256333	256342	80 %	0 %	20 %	0 %	296131780
132	NC_014152	CCGGC	2	10	257184	257193	0 %	0 %	40 %	60 %	296131780
133	NC_014152	TTCAG	2	10	258423	258432	20 %	40 %	20 %	20 %	296131781
134	NC_014152	CAGGT	2	10	259515	259524	20 %	20 %	40 %	20 %	296131781
135	NC_014152	AGGCC	2	10	262097	262106	20 %	0 %	40 %	40 %	296131784
136	NC_014152	TACCG	2	10	263714	263723	20 %	20 %	20 %	40 %	296131785
137	NC_014152	GAAGA	2	10	263874	263883	60 %	0 %	40 %	0 %	296131785
138	NC_014152	TGAGT	2	10	267256	267265	20 %	40 %	40 %	0 %	296131787
139	NC_014152	AGATA	2	10	268885	268894	60 %	20 %	20 %	0 %	296131789
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142	NC_014152	CCAGT	2	10	277801	277810	20 %	20 %	20 %	40 %	296131799
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150	NC_014152	TCTTA	2	10	289501	289510	20 %	60 %	0 %	20 %	296131809
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153	NC_014152	CGGTA	2	10	293053	293062	20 %	20 %	40 %	20 %	296131812
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253	NC_014152	TGTGT	2	10	460846	460855	0 %	60 %	40 %	0 %	296131988
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258	NC_014152	GCTTG	2	10	463629	463638	0 %	40 %	40 %	20 %	296131991
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261	NC_014152	GGGAA	2	10	469859	469868	40 %	0 %	60 %	0 %	296132001
262	NC_014152	GTCAG	2	10	470413	470422	20 %	20 %	40 %	20 %	296132002
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264	NC_014152	TGGCC	2	10	472377	472386	0 %	20 %	40 %	40 %	296132004
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