MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 7968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014152	AAGT	2	8	156	163	50 %	25 %	25 %	0 %	296131551
2	NC_014152	AATA	2	8	713	720	75 %	25 %	0 %	0 %	296131551
3	NC_014152	CAAA	2	8	822	829	75 %	0 %	0 %	25 %	296131551
4	NC_014152	TTTA	2	8	1574	1581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014152	TTGA	2	8	1897	1904	25 %	50 %	25 %	0 %	296131552
6	NC_014152	TGGA	2	8	2009	2016	25 %	25 %	50 %	0 %	296131552
7	NC_014152	TCAA	2	8	2889	2896	50 %	25 %	0 %	25 %	296131553
8	NC_014152	GTTT	2	8	3257	3264	0 %	75 %	25 %	0 %	296131554
9	NC_014152	TATT	2	8	4002	4009	25 %	75 %	0 %	0 %	296131554
10	NC_014152	TATC	2	8	4519	4526	25 %	50 %	0 %	25 %	296131556
11	NC_014152	AAAT	2	8	4596	4603	75 %	25 %	0 %	0 %	296131556
12	NC_014152	GAAA	2	8	4788	4795	75 %	0 %	25 %	0 %	296131557
13	NC_014152	CGAG	2	8	5833	5840	25 %	0 %	50 %	25 %	296131557
14	NC_014152	GAAA	2	8	6090	6097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014152	GCCA	2	8	6381	6388	25 %	0 %	25 %	50 %	296131558
16	NC_014152	GAGG	2	8	7011	7018	25 %	0 %	75 %	0 %	296131558
17	NC_014152	TAAA	2	8	7042	7049	75 %	25 %	0 %	0 %	296131558
18	NC_014152	CTTT	2	8	7888	7895	0 %	75 %	0 %	25 %	296131558
19	NC_014152	TGCC	2	8	8730	8737	0 %	25 %	25 %	50 %	296131559
20	NC_014152	GATA	2	8	9033	9040	50 %	25 %	25 %	0 %	296131559
21	NC_014152	GGAA	2	8	10737	10744	50 %	0 %	50 %	0 %	296131559
22	NC_014152	AAAG	2	8	11103	11110	75 %	0 %	25 %	0 %	296131560
23	NC_014152	CCTG	2	8	11604	11611	0 %	25 %	25 %	50 %	296131560
24	NC_014152	GGTA	2	8	11901	11908	25 %	25 %	50 %	0 %	296131560
25	NC_014152	TGAA	2	8	12647	12654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014152	TAAA	2	8	13069	13076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014152	TGCT	2	8	14839	14846	0 %	50 %	25 %	25 %	296131563
28	NC_014152	GGAA	2	8	15964	15971	50 %	0 %	50 %	0 %	296131563
29	NC_014152	TCCT	2	8	16138	16145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014152	TTTA	2	8	16296	16303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014152	AAAC	2	8	16471	16478	75 %	0 %	0 %	25 %	296131564
32	NC_014152	CGGA	2	8	17671	17678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014152	GTTA	2	8	17791	17798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014152	TGAA	2	8	18410	18417	50 %	25 %	25 %	0 %	296131565
35	NC_014152	ACCA	2	8	18890	18897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014152	TAGG	2	8	19124	19131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014152	AGGC	2	8	19226	19233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014152	TACC	2	8	20013	20020	25 %	25 %	0 %	50 %	296131566
39	NC_014152	CATA	2	8	20071	20078	50 %	25 %	0 %	25 %	296131566
40	NC_014152	AATA	2	8	20088	20095	75 %	25 %	0 %	0 %	296131566
41	NC_014152	AAGA	2	8	20501	20508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014152	TAAC	2	8	20578	20585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014152	TATT	2	8	20830	20837	25 %	75 %	0 %	0 %	296131567
44	NC_014152	GGAG	2	8	20999	21006	25 %	0 %	75 %	0 %	296131567
45	NC_014152	ACCG	2	8	21164	21171	25 %	0 %	25 %	50 %	296131568
46	NC_014152	AAAG	2	8	21654	21661	75 %	0 %	25 %	0 %	296131568
47	NC_014152	GGGA	2	8	21873	21880	25 %	0 %	75 %	0 %	296131568
48	NC_014152	TGGA	2	8	22004	22011	25 %	25 %	50 %	0 %	296131569
49	NC_014152	CAAA	2	8	22018	22025	75 %	0 %	0 %	25 %	296131569
50	NC_014152	GTTT	2	8	22521	22528	0 %	75 %	25 %	0 %	296131569
51	NC_014152	GGAA	2	8	22604	22611	50 %	0 %	50 %	0 %	296131569
52	NC_014152	TATG	2	8	23401	23408	25 %	50 %	25 %	0 %	296131569
53	NC_014152	AAAG	2	8	23923	23930	75 %	0 %	25 %	0 %	296131569
54	NC_014152	CAGG	2	8	24036	24043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014152	CAGG	2	8	24063	24070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014152	TTAT	2	8	24186	24193	25 %	75 %	0 %	0 %	296131570
57	NC_014152	TCTT	2	8	24575	24582	0 %	75 %	0 %	25 %	296131570
58	NC_014152	TTAT	2	8	24709	24716	25 %	75 %	0 %	0 %	296131570
59	NC_014152	TGCC	2	8	24895	24902	0 %	25 %	25 %	50 %	296131570
60	NC_014152	TGAA	2	8	25570	25577	50 %	25 %	25 %	0 %	296131570
61	NC_014152	AAAT	2	8	25641	25648	75 %	25 %	0 %	0 %	296131570
62	NC_014152	TGAC	2	8	25730	25737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014152	TGGT	2	8	25850	25857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014152	CTGG	2	8	26313	26320	0 %	25 %	50 %	25 %	296131571
65	NC_014152	CGGG	2	8	27080	27087	0 %	0 %	75 %	25 %	296131572
66	NC_014152	TAAC	2	8	27089	27096	50 %	25 %	0 %	25 %	296131572
67	NC_014152	TCAG	2	8	27360	27367	25 %	25 %	25 %	25 %	296131572
68	NC_014152	GAAA	2	8	27399	27406	75 %	0 %	25 %	0 %	296131572
69	NC_014152	ATGA	2	8	27610	27617	50 %	25 %	25 %	0 %	296131572
70	NC_014152	AAAT	2	8	28023	28030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014152	GTCT	2	8	28118	28125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014152	TGTA	2	8	28418	28425	25 %	50 %	25 %	0 %	296131573
73	NC_014152	AATG	2	8	28876	28883	50 %	25 %	25 %	0 %	296131573
74	NC_014152	GATT	2	8	29016	29023	25 %	50 %	25 %	0 %	296131573
75	NC_014152	TGAT	2	8	29374	29381	25 %	50 %	25 %	0 %	296131574
76	NC_014152	TAAA	2	8	29467	29474	75 %	25 %	0 %	0 %	296131574
77	NC_014152	ATGG	2	8	29871	29878	25 %	25 %	50 %	0 %	296131574
78	NC_014152	TCAT	2	8	31146	31153	25 %	50 %	0 %	25 %	296131575
79	NC_014152	GCCG	2	8	31235	31242	0 %	0 %	50 %	50 %	296131575
80	NC_014152	AACG	2	8	31545	31552	50 %	0 %	25 %	25 %	296131576
81	NC_014152	AAAT	2	8	31737	31744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014152	TGTT	2	8	32015	32022	0 %	75 %	25 %	0 %	296131577
83	NC_014152	AGCA	2	8	32336	32343	50 %	0 %	25 %	25 %	296131577
84	NC_014152	ATTG	2	8	32466	32473	25 %	50 %	25 %	0 %	296131577
85	NC_014152	TTTC	2	8	32654	32661	0 %	75 %	0 %	25 %	296131578
86	NC_014152	GGTT	2	8	33714	33721	0 %	50 %	50 %	0 %	296131578
87	NC_014152	TTTG	2	8	33728	33735	0 %	75 %	25 %	0 %	296131578
88	NC_014152	GATC	2	8	33743	33750	25 %	25 %	25 %	25 %	296131578
89	NC_014152	TTCC	2	8	34046	34053	0 %	50 %	0 %	50 %	296131578
90	NC_014152	TGCA	2	8	34687	34694	25 %	25 %	25 %	25 %	296131579
91	NC_014152	TGCT	2	8	35287	35294	0 %	50 %	25 %	25 %	296131579
92	NC_014152	CTTT	2	8	35532	35539	0 %	75 %	0 %	25 %	296131579
93	NC_014152	TGAT	2	8	36526	36533	25 %	50 %	25 %	0 %	296131580
94	NC_014152	ATGC	2	8	37093	37100	25 %	25 %	25 %	25 %	296131580
95	NC_014152	AAGG	2	8	37501	37508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014152	TTGT	3	12	37568	37579	0 %	75 %	25 %	0 %	296131581
97	NC_014152	GGAT	2	8	37707	37714	25 %	25 %	50 %	0 %	296131581
98	NC_014152	TACC	2	8	39092	39099	25 %	25 %	0 %	50 %	296131581
99	NC_014152	CCGA	2	8	39255	39262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014152	CAAT	2	8	39281	39288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014152	GCTG	2	8	39417	39424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014152	AGCA	2	8	39909	39916	50 %	0 %	25 %	25 %	296131582
103	NC_014152	GATG	2	8	40307	40314	25 %	25 %	50 %	0 %	296131583
104	NC_014152	GGAG	2	8	40351	40358	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014152	CGAA	2	8	40438	40445	50 %	0 %	25 %	25 %	296131584
106	NC_014152	CGGG	2	8	42007	42014	0 %	0 %	75 %	25 %	296131585
107	NC_014152	ATTT	2	8	42841	42848	25 %	75 %	0 %	0 %	296131586
108	NC_014152	AAAG	2	8	43930	43937	75 %	0 %	25 %	0 %	296131586
109	NC_014152	CCGG	2	8	44953	44960	0 %	0 %	50 %	50 %	296131588
110	NC_014152	GATG	2	8	45519	45526	25 %	25 %	50 %	0 %	296131588
111	NC_014152	GTTG	2	8	45640	45647	0 %	50 %	50 %	0 %	296131588
112	NC_014152	AGGT	2	8	45985	45992	25 %	25 %	50 %	0 %	296131589
113	NC_014152	TGAA	2	8	47118	47125	50 %	25 %	25 %	0 %	296131591
114	NC_014152	TTAA	2	8	47298	47305	50 %	50 %	0 %	0 %	296131592
115	NC_014152	CCGG	2	8	47448	47455	0 %	0 %	50 %	50 %	296131592
116	NC_014152	ACCT	2	8	47598	47605	25 %	25 %	0 %	50 %	296131592
117	NC_014152	CTGG	2	8	47682	47689	0 %	25 %	50 %	25 %	296131592
118	NC_014152	GTAT	2	8	47871	47878	25 %	50 %	25 %	0 %	296131592
119	NC_014152	CAGG	2	8	48056	48063	25 %	0 %	50 %	25 %	296131592
120	NC_014152	CCGT	2	8	48689	48696	0 %	25 %	25 %	50 %	296131593
121	NC_014152	CATG	2	8	51301	51308	25 %	25 %	25 %	25 %	296131597
122	NC_014152	AAGC	2	8	51527	51534	50 %	0 %	25 %	25 %	296131597
123	NC_014152	CCTG	2	8	51903	51910	0 %	25 %	25 %	50 %	296131597
124	NC_014152	GGCA	2	8	52176	52183	25 %	0 %	50 %	25 %	296131597
125	NC_014152	AAGA	2	8	52597	52604	75 %	0 %	25 %	0 %	296131598
126	NC_014152	GAAG	2	8	53013	53020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014152	TAAT	2	8	53041	53048	50 %	50 %	0 %	0 %	296131599
128	NC_014152	GAAA	2	8	53087	53094	75 %	0 %	25 %	0 %	296131599
129	NC_014152	CAGG	2	8	53450	53457	25 %	0 %	50 %	25 %	296131599
130	NC_014152	GATA	2	8	53696	53703	50 %	25 %	25 %	0 %	296131599
131	NC_014152	TTTG	2	8	53936	53943	0 %	75 %	25 %	0 %	296131599
132	NC_014152	AATT	2	8	54216	54223	50 %	50 %	0 %	0 %	296131599
133	NC_014152	AAAG	2	8	54360	54367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014152	GGAA	2	8	54373	54380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014152	GGGA	2	8	54960	54967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014152	TCGC	2	8	55523	55530	0 %	25 %	25 %	50 %	296131601
137	NC_014152	TATT	2	8	56456	56463	25 %	75 %	0 %	0 %	296131602
138	NC_014152	TTTG	2	8	56680	56687	0 %	75 %	25 %	0 %	296131602
139	NC_014152	CCCT	2	8	57159	57166	0 %	25 %	0 %	75 %	296131603
140	NC_014152	AGGA	2	8	57265	57272	50 %	0 %	50 %	0 %	296131603
141	NC_014152	GCCC	2	8	57430	57437	0 %	0 %	25 %	75 %	296131603
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143	NC_014152	GCCG	2	8	57924	57931	0 %	0 %	50 %	50 %	296131604
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