MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 3761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014152	AT	3	6	190	195	50 %	50 %	0 %	0 %	296131551
2	NC_014152	TC	3	6	298	303	0 %	50 %	0 %	50 %	296131551
3	NC_014152	TA	3	6	605	610	50 %	50 %	0 %	0 %	296131551
4	NC_014152	CT	3	6	1306	1311	0 %	50 %	0 %	50 %	296131551
5	NC_014152	AT	4	8	1589	1596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014152	AC	4	8	2162	2169	50 %	0 %	0 %	50 %	296131552
7	NC_014152	CA	3	6	3169	3174	50 %	0 %	0 %	50 %	296131554
8	NC_014152	AT	3	6	3337	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	296131554
9	NC_014152	TC	3	6	3891	3896	0 %	50 %	0 %	50 %	296131554
10	NC_014152	AG	3	6	4568	4573	50 %	0 %	50 %	0 %	296131556
11	NC_014152	TA	3	6	4722	4727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014152	GA	3	6	5568	5573	50 %	0 %	50 %	0 %	296131557
13	NC_014152	GA	3	6	5669	5674	50 %	0 %	50 %	0 %	296131557
14	NC_014152	TA	3	6	6438	6443	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
15	NC_014152	AT	4	8	6775	6782	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
16	NC_014152	AT	3	6	7804	7809	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
17	NC_014152	AT	3	6	7901	7906	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
18	NC_014152	TA	3	6	7935	7940	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
19	NC_014152	TA	3	6	7954	7959	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
20	NC_014152	AT	3	6	8251	8256	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
21	NC_014152	AG	3	6	9748	9753	50 %	0 %	50 %	0 %	296131559
22	NC_014152	AC	3	6	10093	10098	50 %	0 %	0 %	50 %	296131559
23	NC_014152	TC	3	6	12724	12729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014152	GA	3	6	12774	12779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014152	TC	3	6	12828	12833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014152	GA	3	6	17869	17874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014152	CT	4	8	17949	17956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014152	GC	3	6	18038	18043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014152	AT	3	6	18364	18369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014152	TG	3	6	18668	18673	0 %	50 %	50 %	0 %	296131565
31	NC_014152	GA	3	6	18941	18946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014152	CT	3	6	19023	19028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014152	CT	3	6	19331	19336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014152	AT	3	6	20057	20062	50 %	50 %	0 %	0 %	296131566
35	NC_014152	AT	3	6	20126	20131	50 %	50 %	0 %	0 %	296131566
36	NC_014152	GA	4	8	20869	20876	50 %	0 %	50 %	0 %	296131567
37	NC_014152	AG	3	6	21743	21748	50 %	0 %	50 %	0 %	296131568
38	NC_014152	TA	3	6	22282	22287	50 %	50 %	0 %	0 %	296131569
39	NC_014152	GA	3	6	22770	22775	50 %	0 %	50 %	0 %	296131569
40	NC_014152	AT	3	6	23942	23947	50 %	50 %	0 %	0 %	296131569
41	NC_014152	TA	3	6	25156	25161	50 %	50 %	0 %	0 %	296131570
42	NC_014152	TA	3	6	25414	25419	50 %	50 %	0 %	0 %	296131570
43	NC_014152	AG	3	6	26149	26154	50 %	0 %	50 %	0 %	296131571
44	NC_014152	CT	3	6	26782	26787	0 %	50 %	0 %	50 %	296131571
45	NC_014152	AT	3	6	26810	26815	50 %	50 %	0 %	0 %	296131571
46	NC_014152	GA	3	6	26939	26944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014152	AT	3	6	27321	27326	50 %	50 %	0 %	0 %	296131572
48	NC_014152	GA	3	6	27492	27497	50 %	0 %	50 %	0 %	296131572
49	NC_014152	CT	3	6	28015	28020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014152	AT	3	6	28221	28226	50 %	50 %	0 %	0 %	296131573
51	NC_014152	AT	3	6	28271	28276	50 %	50 %	0 %	0 %	296131573
52	NC_014152	TC	3	6	28865	28870	0 %	50 %	0 %	50 %	296131573
53	NC_014152	GT	3	6	29127	29132	0 %	50 %	50 %	0 %	296131573
54	NC_014152	TG	3	6	29410	29415	0 %	50 %	50 %	0 %	296131574
55	NC_014152	TA	3	6	30076	30081	50 %	50 %	0 %	0 %	296131574
56	NC_014152	TG	3	6	32036	32041	0 %	50 %	50 %	0 %	296131577
57	NC_014152	GA	3	6	32250	32255	50 %	0 %	50 %	0 %	296131577
58	NC_014152	AT	3	6	33015	33020	50 %	50 %	0 %	0 %	296131578
59	NC_014152	CA	3	6	33333	33338	50 %	0 %	0 %	50 %	296131578
60	NC_014152	AT	3	6	33559	33564	50 %	50 %	0 %	0 %	296131578
61	NC_014152	AT	3	6	35182	35187	50 %	50 %	0 %	0 %	296131579
62	NC_014152	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	296131579
63	NC_014152	TC	3	6	37401	37406	0 %	50 %	0 %	50 %	296131580
64	NC_014152	AT	3	6	37921	37926	50 %	50 %	0 %	0 %	296131581
65	NC_014152	AT	3	6	38019	38024	50 %	50 %	0 %	0 %	296131581
66	NC_014152	CT	3	6	39970	39975	0 %	50 %	0 %	50 %	296131583
67	NC_014152	AT	3	6	40459	40464	50 %	50 %	0 %	0 %	296131584
68	NC_014152	CA	3	6	41024	41029	50 %	0 %	0 %	50 %	296131584
69	NC_014152	TC	3	6	44586	44591	0 %	50 %	0 %	50 %	296131587
70	NC_014152	GA	3	6	45659	45664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014152	AG	3	6	45906	45911	50 %	0 %	50 %	0 %	296131589
72	NC_014152	AT	3	6	46735	46740	50 %	50 %	0 %	0 %	296131590
73	NC_014152	CT	3	6	48222	48227	0 %	50 %	0 %	50 %	296131592
74	NC_014152	GC	3	6	48280	48285	0 %	0 %	50 %	50 %	296131592
75	NC_014152	GA	3	6	48438	48443	50 %	0 %	50 %	0 %	296131592
76	NC_014152	AG	3	6	49391	49396	50 %	0 %	50 %	0 %	296131594
77	NC_014152	TA	3	6	50270	50275	50 %	50 %	0 %	0 %	296131596
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79	NC_014152	AT	3	6	51079	51084	50 %	50 %	0 %	0 %	296131597
80	NC_014152	TA	3	6	51207	51212	50 %	50 %	0 %	0 %	296131597
81	NC_014152	CA	3	6	52974	52979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014152	TG	3	6	52990	52995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014152	GA	3	6	53314	53319	50 %	0 %	50 %	0 %	296131599
84	NC_014152	CA	3	6	53484	53489	50 %	0 %	0 %	50 %	296131599
85	NC_014152	GA	3	6	54025	54030	50 %	0 %	50 %	0 %	296131599
86	NC_014152	AT	3	6	54127	54132	50 %	50 %	0 %	0 %	296131599
87	NC_014152	AG	3	6	54366	54371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014152	AG	3	6	56280	56285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014152	AG	3	6	56780	56785	50 %	0 %	50 %	0 %	296131602
90	NC_014152	TA	3	6	57901	57906	50 %	50 %	0 %	0 %	296131604
91	NC_014152	AT	3	6	58268	58273	50 %	50 %	0 %	0 %	296131604
92	NC_014152	GA	3	6	58898	58903	50 %	0 %	50 %	0 %	296131605
93	NC_014152	TA	3	6	59766	59771	50 %	50 %	0 %	0 %	296131606
94	NC_014152	TA	3	6	59806	59811	50 %	50 %	0 %	0 %	296131606
95	NC_014152	GC	3	6	61083	61088	0 %	0 %	50 %	50 %	296131607
96	NC_014152	GC	3	6	61307	61312	0 %	0 %	50 %	50 %	296131607
97	NC_014152	AG	3	6	62107	62112	50 %	0 %	50 %	0 %	296131607
98	NC_014152	AC	3	6	63143	63148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014152	TA	3	6	63284	63289	50 %	50 %	0 %	0 %	296131609
100	NC_014152	AG	3	6	64393	64398	50 %	0 %	50 %	0 %	296131610
101	NC_014152	AG	3	6	64613	64618	50 %	0 %	50 %	0 %	296131610
102	NC_014152	AG	3	6	66769	66774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014152	AG	3	6	66869	66874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014152	AC	3	6	68696	68701	50 %	0 %	0 %	50 %	296131614
105	NC_014152	AG	3	6	69529	69534	50 %	0 %	50 %	0 %	296131615
106	NC_014152	AT	3	6	69643	69648	50 %	50 %	0 %	0 %	296131615
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108	NC_014152	GA	3	6	71288	71293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014152	CT	4	8	71367	71374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014152	AG	3	6	71853	71858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014152	CT	3	6	71878	71883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014152	AT	4	8	72398	72405	50 %	50 %	0 %	0 %	296131618
113	NC_014152	GT	3	6	72690	72695	0 %	50 %	50 %	0 %	296131618
114	NC_014152	AG	3	6	75461	75466	50 %	0 %	50 %	0 %	296131621
115	NC_014152	AT	3	6	75677	75682	50 %	50 %	0 %	0 %	296131621
116	NC_014152	AT	3	6	76634	76639	50 %	50 %	0 %	0 %	296131622
117	NC_014152	GC	3	6	77127	77132	0 %	0 %	50 %	50 %	296131622
118	NC_014152	TA	3	6	77606	77611	50 %	50 %	0 %	0 %	296131623
119	NC_014152	AG	3	6	78813	78818	50 %	0 %	50 %	0 %	296131625
120	NC_014152	AG	3	6	80119	80124	50 %	0 %	50 %	0 %	296131627
121	NC_014152	AG	3	6	80327	80332	50 %	0 %	50 %	0 %	296131627
122	NC_014152	AT	3	6	80358	80363	50 %	50 %	0 %	0 %	296131627
123	NC_014152	TA	4	8	80943	80950	50 %	50 %	0 %	0 %	296131628
124	NC_014152	AG	3	6	81984	81989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014152	GA	3	6	82139	82144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014152	CA	3	6	82226	82231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014152	AG	3	6	83558	83563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014152	AC	3	6	83632	83637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014152	AC	3	6	83802	83807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014152	TC	3	6	84129	84134	0 %	50 %	0 %	50 %	296131630
131	NC_014152	GA	3	6	85491	85496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014152	AG	3	6	86322	86327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014152	GA	3	6	86507	86512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014152	CA	3	6	86767	86772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014152	GA	3	6	86896	86901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014152	GC	3	6	86910	86915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014152	GA	3	6	86916	86921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014152	GA	3	6	88230	88235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014152	AC	3	6	88432	88437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014152	TA	3	6	88528	88533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014152	AT	3	6	88929	88934	50 %	50 %	0 %	0 %	296131631
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144	NC_014152	GA	3	6	90847	90852	50 %	0 %	50 %	0 %	296131633
145	NC_014152	AG	3	6	92226	92231	50 %	0 %	50 %	0 %	296131634
146	NC_014152	TG	3	6	92745	92750	0 %	50 %	50 %	0 %	296131635
147	NC_014152	AG	3	6	93769	93774	50 %	0 %	50 %	0 %	296131637
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