MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	TTTGAT	2	12	17652	17663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014150	TATAAA	2	12	22475	22486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014150	TTTATT	2	12	35366	35377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014150	TAAAAA	2	12	70004	70015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014150	CTTTTT	2	12	79846	79857	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014150	TAATAT	2	12	84008	84019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014150	GGCACA	2	12	89077	89088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014150	TTTATT	2	12	99001	99012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014150	TTATAA	2	12	115809	115820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014150	TAAAAT	2	12	115826	115837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014150	TAAAGA	2	12	121907	121918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014150	TAATTT	2	12	126476	126487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014150	TTAATT	2	12	136603	136614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014150	GCATTT	2	12	143458	143469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014150	ATTGCA	2	12	212303	212314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014150	ATTTAT	2	12	227486	227497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014150	TATAAT	2	12	227567	227578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014150	TAAAAA	2	12	232241	232252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014150	TTAATA	2	12	236423	236434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014150	TTATAT	2	12	246125	246136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014150	TATTTA	2	12	276443	276454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014150	TACAAA	2	12	281887	281898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014150	TTTTAT	2	12	282164	282175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014150	CAAAAA	2	12	286635	286646	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014150	ACGTAT	2	12	298493	298504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014150	TCAATT	2	12	304134	304145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014150	TTTATT	2	12	308714	308725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014150	TAAAAA	2	12	312436	312447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014150	TAAAAT	2	12	331745	331756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014150	CTAATA	2	12	335281	335292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014150	ATATTA	2	12	354566	354577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014150	ATAAAA	2	12	382636	382647	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014150	TTTGTT	2	12	384035	384046	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014150	TTTTAT	2	12	403280	403291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014150	TATTTT	2	12	403296	403307	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014150	TATAAT	2	12	422682	422693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014150	AAAAAT	2	12	426419	426430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014150	AATATT	2	12	428242	428253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014150	ATTTTC	2	12	428269	428280	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014150	ATAAAT	2	12	430891	430902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014150	TTTATA	2	12	457970	457981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014150	ATTTAA	2	12	462894	462905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014150	ATATTA	2	12	516983	516994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014150	ATTAAT	2	12	530431	530442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014150	ATAAAT	2	12	556728	556739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014150	ATTTTA	2	12	565501	565512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014150	AAATAA	2	12	576178	576189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014150	ATTTCA	2	12	577373	577384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014150	AATTAA	2	12	589317	589328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014150	CGCCTA	2	12	597113	597124	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014150	ATTAAA	2	12	616136	616147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014150	CTAAAA	2	12	622207	622218	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014150	TAAAAA	2	12	626716	626727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014150	TATATT	2	12	631934	631945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014150	TAAAAA	2	12	651347	651358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014150	TAAGTT	2	12	651443	651454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014150	ACTAAT	2	12	651481	651492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014150	TAAAAA	2	12	681769	681780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014150	TCTAAA	2	12	684010	684021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014150	TATATT	2	12	691496	691507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014150	TAAAAA	2	12	706778	706789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014150	AATCAA	2	12	715705	715716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014150	AAAATA	2	12	718495	718506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014150	AAATAT	2	12	720910	720921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014150	TTTTTA	2	12	739395	739406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014150	ATATAA	2	12	749557	749568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014150	ATAATT	2	12	762962	762973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014150	TTTTCT	2	12	805305	805316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014150	CTAATA	2	12	805437	805448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014150	GTATAT	2	12	808850	808861	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014150	TTATCT	2	12	829561	829572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014150	AATATA	2	12	831623	831634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014150	TAAAAA	2	12	857949	857960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014150	TAAAAA	2	12	865430	865441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014150	TTATAT	2	12	868468	868479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014150	ATTAAA	2	12	907497	907508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014150	TTTATA	2	12	909005	909016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014150	AAAATA	2	12	909046	909057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014150	AATTAT	2	12	929672	929683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014150	TAATTA	2	12	966824	966835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014150	ATAATT	2	12	975787	975798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014150	CAAAAA	2	12	979792	979803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014150	TAAAAA	2	12	983698	983709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014150	TCGCCT	2	12	1007749	1007760	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014150	TAGTAA	2	12	1013253	1013264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014150	TAAATA	2	12	1047185	1047196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014150	TCTTTT	2	12	1050866	1050877	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014150	ATAAAA	2	12	1052641	1052652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014150	AAATAA	2	12	1064964	1064975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014150	TAAAAT	2	12	1068847	1068858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014150	TTAAAA	2	12	1102969	1102980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014150	TATTTA	2	12	1106551	1106562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014150	ATAACA	2	12	1111491	1111502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014150	ATAACA	2	12	1111561	1111572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014150	ATAACA	2	12	1111631	1111642	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014150	ATAACA	2	12	1111701	1111712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014150	TCGCCT	2	12	1129503	1129514	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014150	TCGCCT	2	12	1129592	1129603	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014150	TCGCCT	2	12	1129681	1129692	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014150	TTCGCC	2	12	1129769	1129780	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014150	TCGCCT	2	12	1129859	1129870	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014150	TTCGCC	2	12	1129947	1129958	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014150	ATTTAT	2	12	1146408	1146419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014150	ATTTAT	2	12	1181003	1181014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014150	ATAAAA	2	12	1182047	1182058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014150	GAAAGT	2	12	1183143	1183154	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014150	ATTTAT	2	12	1188764	1188775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014150	ACAATT	2	12	1198561	1198572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014150	TATAAA	2	12	1198877	1198888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014150	AATTTA	2	12	1199769	1199780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014150	ACAATT	2	12	1219984	1219995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014150	ATTTTT	2	12	1221086	1221097	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014150	AGTCAA	2	12	1225070	1225081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014150	TTTATT	2	12	1238232	1238243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014150	TAATTT	2	12	1239187	1239198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014150	ATTTAA	2	12	1239453	1239464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014150	ATTTAA	2	12	1239477	1239488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014150	TTTATA	2	12	1240069	1240080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014150	TAAAAA	2	12	1243766	1243777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014150	GAAAGT	2	12	1267706	1267717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014150	AATTAT	2	12	1291103	1291114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014150	ATATAA	2	12	1298670	1298681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014150	AGTAAA	2	12	1316793	1316804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014150	TTATAA	2	12	1334298	1334309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014150	TTTATT	2	12	1347098	1347109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014150	AAAAAG	2	12	1347519	1347530	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014150	AAATAT	2	12	1347561	1347572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014150	AGAAAA	2	12	1347599	1347610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014150	ATAAAT	2	12	1359113	1359124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014150	TATAGT	2	12	1394935	1394946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014150	TTTAAA	2	12	1397477	1397488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014150	GAATTA	2	12	1399184	1399195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.