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Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	ATATT	2	10	8737	8746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014150	ATATT	2	10	30161	30170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014150	TTTAA	2	10	38086	38095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014150	ATTAT	2	10	38096	38105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014150	TAAAT	2	10	42179	42188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014150	ATTTA	2	10	43489	43498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014150	TAATA	2	10	55862	55871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014150	TAAAC	2	10	61348	61357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014150	TGTTA	2	10	63411	63420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014150	TAAAT	2	10	63443	63452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014150	ATTAT	2	10	68636	68645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014150	AAAAT	2	10	72049	72058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014150	AAGTA	2	10	84127	84136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014150	TAATC	2	10	86446	86455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014150	TTTTA	2	10	86700	86709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014150	ATTTA	2	10	98968	98977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014150	AATAT	2	10	101187	101196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014150	ATAAA	2	10	106645	106654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014150	TATAA	2	10	106661	106670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014150	ATTAT	2	10	121931	121940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014150	TTTTA	2	10	136570	136579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014150	GCACA	3	15	136643	136657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014150	AGCAT	2	10	141709	141718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014150	AAAAT	2	10	143954	143963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014150	AATAT	2	10	143979	143988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014150	TAATA	2	10	171585	171594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014150	AATAT	2	10	177573	177582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014150	AAAAT	2	10	184753	184762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014150	AAAAT	2	10	184884	184893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014150	ATACT	2	10	184989	184998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014150	TATTT	2	10	186786	186795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014150	AGTAT	2	10	212188	212197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014150	TATTT	2	10	212399	212408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014150	ACTAT	2	10	212748	212757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014150	ATTTT	2	10	219656	219665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014150	ATATA	2	10	220057	220066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014150	AAAAT	2	10	220533	220542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014150	GTTAA	2	10	222716	222725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014150	TAAAA	2	10	232276	232285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014150	TTTTA	2	10	232309	232318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014150	GAGGG	2	10	233061	233070	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014150	ATATT	2	10	236322	236331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014150	TTATA	2	10	236367	236376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014150	TATTT	2	10	242295	242304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014150	TTTTA	2	10	242339	242348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014150	TTTAA	2	10	253450	253459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014150	AAAAT	2	10	253669	253678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014150	TAATA	2	10	260910	260919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014150	TTATA	2	10	268775	268784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014150	TAAAG	2	10	268851	268860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014150	TTTAT	2	10	277642	277651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014150	TACTA	2	10	278670	278679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014150	TTTAT	2	10	281919	281928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014150	TAAAA	2	10	282132	282141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014150	TAAAT	2	10	283874	283883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014150	AAAAT	2	10	286469	286478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014150	AAAAT	2	10	286516	286525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014150	ATTTT	2	10	286650	286659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014150	AAAAT	2	10	286826	286835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014150	TTAAT	2	10	290029	290038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014150	ATAAA	2	10	291863	291872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014150	ATATT	2	10	297151	297160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014150	ATATA	2	10	304223	304232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014150	ATATA	2	10	304259	304268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014150	TTTTA	3	15	304391	304405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014150	ATACA	2	10	309241	309250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014150	TATCC	2	10	312373	312382	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014150	TATAA	3	15	323487	323501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014150	TTAAT	2	10	324180	324189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014150	TAAAA	2	10	326422	326431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014150	ATATT	2	10	331033	331042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014150	CAATT	2	10	334181	334190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014150	TATAT	2	10	334222	334231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014150	TATAA	2	10	338751	338760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014150	TTTTA	2	10	341531	341540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014150	ATTTT	2	10	341547	341556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014150	AAAAT	2	10	345766	345775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014150	TTAAT	2	10	348919	348928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014150	TTTTA	2	10	354543	354552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014150	TATAT	2	10	362729	362738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014150	CTAAA	2	10	367459	367468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014150	TTATA	2	10	367477	367486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014150	CAATA	2	10	367507	367516	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014150	AAAAT	2	10	368082	368091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014150	TAAAA	2	10	370922	370931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014150	ATATA	2	10	371989	371998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014150	TTATA	2	10	373963	373972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014150	ATAGT	2	10	378974	378983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014150	AAGCA	2	10	379209	379218	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014150	ACAAT	2	10	382620	382629	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014150	GAATA	2	10	382653	382662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014150	ACTTT	2	10	391749	391758	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014150	AAAAT	2	10	394873	394882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014150	TATAT	2	10	411360	411369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014150	CTAAT	2	10	421952	421961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014150	ATTTT	2	10	424517	424526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014150	AAAAT	2	10	430968	430977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014150	AAAAT	2	10	432005	432014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014150	TAAAA	2	10	432073	432082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014150	TTATT	2	10	446042	446051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014150	TTAAA	2	10	447625	447634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014150	ATATT	2	10	460931	460940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014150	TATAA	2	10	465644	465653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014150	GAATA	2	10	477239	477248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014150	AAACA	2	10	477896	477905	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014150	AGAAA	2	10	481180	481189	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014150	TATAA	2	10	483887	483896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014150	TAAAT	2	10	485953	485962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014150	TTAAA	2	10	496026	496035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014150	ATATA	2	10	499929	499938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014150	TACTA	2	10	503970	503979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014150	TAAAA	2	10	517145	517154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014150	TATAA	2	10	525606	525615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014150	TTATA	2	10	525703	525712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014150	GTATT	2	10	527929	527938	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014150	GAATA	2	10	530489	530498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014150	ATATA	2	10	534061	534070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014150	TAGCT	2	10	534092	534101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014150	ATATA	2	10	535494	535503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014150	TAAAA	2	10	536341	536350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014150	TAATT	2	10	547510	547519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014150	ATTTT	2	10	552842	552851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014150	TATCA	2	10	554527	554536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014150	TAATA	2	10	559914	559923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014150	CTTCA	2	10	565409	565418	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014150	AATAT	2	10	565571	565580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014150	ATATA	2	10	567253	567262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014150	TTATA	2	10	568743	568752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014150	ATAAA	2	10	577948	577957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014150	TAACA	2	10	587620	587629	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014150	GGCTC	2	10	597292	597301	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014150	TAAGA	2	10	598832	598841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014150	AATAA	2	10	599076	599085	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014150	TTTTA	2	10	599209	599218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014150	TATAA	2	10	599311	599320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014150	TTTAA	2	10	611706	611715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014150	TATAC	2	10	617889	617898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014150	ATAAA	2	10	620404	620413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014150	TTGGC	18	90	624204	624293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014150	TATAA	2	10	624346	624355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014150	TATAA	2	10	624469	624478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014150	TTTAT	2	10	627872	627881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014150	ATTAT	2	10	630294	630303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014150	TATAT	2	10	631760	631769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014150	ATTTA	2	10	634506	634515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014150	TTTAA	2	10	634673	634682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014150	TACTA	2	10	639827	639836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014150	TAAAT	2	10	643309	643318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014150	ATCAT	2	10	655269	655278	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014150	TATAA	2	10	656135	656144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014150	GTATT	2	10	656280	656289	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_014150	TAATA	2	10	668549	668558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014150	TATAA	2	10	668645	668654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014150	AAAAT	2	10	668720	668729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014150	ATTAT	2	10	679940	679949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014150	ATTAA	2	10	680309	680318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014150	TTAAA	2	10	680777	680786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014150	TTAAT	2	10	680793	680802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_014150	TATAA	2	10	680825	680834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014150	AAATT	2	10	684951	684960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014150	TTTAA	2	10	687060	687069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014150	ATTTT	2	10	689414	689423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014150	TATAT	2	10	717335	717344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014150	ATTTA	2	10	740615	740624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_014150	ATTTT	2	10	750433	750442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_014150	TTTAA	2	10	763357	763366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014150	TTAAA	2	10	775993	776002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014150	TTTAA	2	10	776404	776413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014150	ATTAT	2	10	781940	781949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014150	ATTAA	2	10	807097	807106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014150	TGATT	44	220	810696	810915	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014150	TATAT	2	10	816567	816576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_014150	TTAAT	2	10	829513	829522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_014150	ATATT	2	10	833946	833955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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207	NC_014150	AGCAT	2	10	886938	886947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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235	NC_014150	ATATA	2	10	1021973	1021982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_014150	AAAAT	2	10	1069882	1069891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_014150	TATTT	2	10	1195369	1195378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_014150	ATTAA	2	10	1236343	1236352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014150	ATTAA	2	10	1238136	1238145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014150	ATTTT	2	10	1238981	1238990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_014150	AAATT	2	10	1243351	1243360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014150	AAAAT	2	10	1243586	1243595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_014150	TTTAA	2	10	1674720	1674729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_014150	ATTTA	2	10	1687576	1687585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_014150	ATTTT	2	10	1694373	1694382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_014150	ATTTT	2	10	1695581	1695590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_014150	TATTT	2	10	1710251	1710260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_014150	GTAAA	2	10	1714906	1714915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_014150	AATAA	2	10	1719636	1719645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_014150	TAATT	2	10	1719655	1719664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_014150	ATTAT	2	10	1726813	1726822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_014150	TAAAA	2	10	1726994	1727003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_014150	TAAAT	2	10	1733380	1733389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_014150	TGCCT	2	10	1735794	1735803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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494	NC_014150	ATTTT	2	10	1772932	1772941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014150	TATAA	2	10	1811590	1811599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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