MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 10151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	GAAT	2	8	155	162	50 %	25 %	25 %	0 %	296125059
2	NC_014150	GTAT	2	8	566	573	25 %	50 %	25 %	0 %	296125059
3	NC_014150	AAGA	2	8	1100	1107	75 %	0 %	25 %	0 %	296125059
4	NC_014150	ATTT	2	8	1468	1475	25 %	75 %	0 %	0 %	296125059
5	NC_014150	TATT	2	8	1751	1758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014150	TTTG	2	8	1907	1914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014150	AAAG	2	8	2147	2154	75 %	0 %	25 %	0 %	296125060
8	NC_014150	TAAA	2	8	2669	2676	75 %	25 %	0 %	0 %	296125060
9	NC_014150	AACA	2	8	2916	2923	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014150	ATTA	2	8	2961	2968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014150	AACA	2	8	3072	3079	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
12	NC_014150	TAAC	2	8	3167	3174	50 %	25 %	0 %	25 %	296125062
13	NC_014150	GGAA	2	8	3300	3307	50 %	0 %	50 %	0 %	296125062
14	NC_014150	AAAC	2	8	3352	3359	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
15	NC_014150	TAAT	2	8	3674	3681	50 %	50 %	0 %	0 %	296125062
16	NC_014150	CAAA	2	8	4049	4056	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
17	NC_014150	ACAA	2	8	4225	4232	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
18	NC_014150	CAAT	2	8	4260	4267	50 %	25 %	0 %	25 %	296125062
19	NC_014150	GAAA	2	8	4297	4304	75 %	0 %	25 %	0 %	296125062
20	NC_014150	CAGA	2	8	4600	4607	50 %	0 %	25 %	25 %	296125062
21	NC_014150	AATG	2	8	4671	4678	50 %	25 %	25 %	0 %	296125062
22	NC_014150	ATTA	2	8	5099	5106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014150	TATT	2	8	5552	5559	25 %	75 %	0 %	0 %	296125064
24	NC_014150	TTTA	2	8	5771	5778	25 %	75 %	0 %	0 %	296125064
25	NC_014150	TACT	2	8	5949	5956	25 %	50 %	0 %	25 %	296125064
26	NC_014150	TACT	2	8	6635	6642	25 %	50 %	0 %	25 %	296125065
27	NC_014150	TAAA	2	8	6836	6843	75 %	25 %	0 %	0 %	296125065
28	NC_014150	GCTT	2	8	7002	7009	0 %	50 %	25 %	25 %	296125065
29	NC_014150	ATTT	2	8	7055	7062	25 %	75 %	0 %	0 %	296125065
30	NC_014150	CAGA	2	8	7371	7378	50 %	0 %	25 %	25 %	296125066
31	NC_014150	CTTT	2	8	8006	8013	0 %	75 %	0 %	25 %	296125067
32	NC_014150	ATTT	2	8	8598	8605	25 %	75 %	0 %	0 %	296125067
33	NC_014150	TAAT	2	8	8826	8833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014150	TAAT	2	8	8989	8996	50 %	50 %	0 %	0 %	296125068
35	NC_014150	TTTG	2	8	9290	9297	0 %	75 %	25 %	0 %	296125068
36	NC_014150	ATAA	2	8	9549	9556	75 %	25 %	0 %	0 %	296125068
37	NC_014150	TATG	2	8	9659	9666	25 %	50 %	25 %	0 %	296125068
38	NC_014150	TGAT	2	8	9893	9900	25 %	50 %	25 %	0 %	296125068
39	NC_014150	ATTT	2	8	10248	10255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014150	GAAG	2	8	11237	11244	50 %	0 %	50 %	0 %	296125069
41	NC_014150	GTCT	2	8	11382	11389	0 %	50 %	25 %	25 %	296125069
42	NC_014150	GGTA	2	8	12771	12778	25 %	25 %	50 %	0 %	296125070
43	NC_014150	ATTT	3	12	12798	12809	25 %	75 %	0 %	0 %	296125070
44	NC_014150	AATA	2	8	12833	12840	75 %	25 %	0 %	0 %	296125070
45	NC_014150	CATT	2	8	12986	12993	25 %	50 %	0 %	25 %	296125070
46	NC_014150	TTTA	2	8	13123	13130	25 %	75 %	0 %	0 %	296125070
47	NC_014150	GTAT	2	8	13256	13263	25 %	50 %	25 %	0 %	296125070
48	NC_014150	ATTA	2	8	13296	13303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014150	TTAA	2	8	13448	13455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014150	ATTT	2	8	13501	13508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014150	TAAA	2	8	13870	13877	75 %	25 %	0 %	0 %	296125071
52	NC_014150	TTTG	2	8	15296	15303	0 %	75 %	25 %	0 %	296125072
53	NC_014150	TAAA	2	8	15555	15562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014150	GAAA	2	8	15623	15630	75 %	0 %	25 %	0 %	296125073
55	NC_014150	ACAA	2	8	15846	15853	75 %	0 %	0 %	25 %	296125073
56	NC_014150	TCTT	2	8	16073	16080	0 %	75 %	0 %	25 %	296125073
57	NC_014150	TCTT	2	8	16611	16618	0 %	75 %	0 %	25 %	296125073
58	NC_014150	ATTT	2	8	17641	17648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014150	ATGA	2	8	17875	17882	50 %	25 %	25 %	0 %	296125075
60	NC_014150	TATT	2	8	17902	17909	25 %	75 %	0 %	0 %	296125075
61	NC_014150	TCAG	2	8	18525	18532	25 %	25 %	25 %	25 %	296125075
62	NC_014150	AATG	2	8	18946	18953	50 %	25 %	25 %	0 %	296125075
63	NC_014150	TAAA	2	8	18974	18981	75 %	25 %	0 %	0 %	296125075
64	NC_014150	CTTT	2	8	19606	19613	0 %	75 %	0 %	25 %	296125075
65	NC_014150	AGGC	2	8	19709	19716	25 %	0 %	50 %	25 %	296125075
66	NC_014150	TTTA	2	8	19797	19804	25 %	75 %	0 %	0 %	296125076
67	NC_014150	ATTT	2	8	20162	20169	25 %	75 %	0 %	0 %	296125076
68	NC_014150	AAAT	2	8	21252	21259	75 %	25 %	0 %	0 %	296125077
69	NC_014150	ATTA	2	8	21677	21684	50 %	50 %	0 %	0 %	296125078
70	NC_014150	TTTC	2	8	21895	21902	0 %	75 %	0 %	25 %	296125078
71	NC_014150	TCTT	2	8	22543	22550	0 %	75 %	0 %	25 %	296125079
72	NC_014150	ATTA	2	8	22927	22934	50 %	50 %	0 %	0 %	296125079
73	NC_014150	TGAG	2	8	22976	22983	25 %	25 %	50 %	0 %	296125079
74	NC_014150	TATT	2	8	23174	23181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014150	TTTA	2	8	23293	23300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014150	ATTT	2	8	23400	23407	25 %	75 %	0 %	0 %	296125080
77	NC_014150	CAGA	2	8	23411	23418	50 %	0 %	25 %	25 %	296125080
78	NC_014150	TTTG	2	8	23944	23951	0 %	75 %	25 %	0 %	296125080
79	NC_014150	ATTA	2	8	25042	25049	50 %	50 %	0 %	0 %	296125080
80	NC_014150	TACT	2	8	25126	25133	25 %	50 %	0 %	25 %	296125081
81	NC_014150	ATGT	2	8	25707	25714	25 %	50 %	25 %	0 %	296125081
82	NC_014150	TCAT	2	8	26946	26953	25 %	50 %	0 %	25 %	296125081
83	NC_014150	ATGA	2	8	27027	27034	50 %	25 %	25 %	0 %	296125081
84	NC_014150	TAAT	2	8	27138	27145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014150	TTTA	2	8	27215	27222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014150	TAAT	2	8	27236	27243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014150	TTTC	2	8	27349	27356	0 %	75 %	0 %	25 %	296125082
88	NC_014150	TGAA	2	8	27393	27400	50 %	25 %	25 %	0 %	296125082
89	NC_014150	CTTC	2	8	27570	27577	0 %	50 %	0 %	50 %	296125082
90	NC_014150	AGAA	2	8	27664	27671	75 %	0 %	25 %	0 %	296125082
91	NC_014150	TTGT	2	8	28474	28481	0 %	75 %	25 %	0 %	296125082
92	NC_014150	TTTA	2	8	28562	28569	25 %	75 %	0 %	0 %	296125082
93	NC_014150	CTTC	2	8	28716	28723	0 %	50 %	0 %	50 %	296125082
94	NC_014150	CATA	2	8	29127	29134	50 %	25 %	0 %	25 %	296125082
95	NC_014150	TGTT	2	8	29387	29394	0 %	75 %	25 %	0 %	296125082
96	NC_014150	ATTA	2	8	30116	30123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014150	ATTT	2	8	30143	30150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014150	TTTA	2	8	30187	30194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014150	TAAA	2	8	30215	30222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014150	GTTT	2	8	30410	30417	0 %	75 %	25 %	0 %	296125083
101	NC_014150	AATG	2	8	30805	30812	50 %	25 %	25 %	0 %	296125083
102	NC_014150	TTTA	2	8	31302	31309	25 %	75 %	0 %	0 %	296125083
103	NC_014150	ATTT	2	8	31385	31392	25 %	75 %	0 %	0 %	296125083
104	NC_014150	ATTA	2	8	31606	31613	50 %	50 %	0 %	0 %	296125083
105	NC_014150	TTTA	2	8	32371	32378	25 %	75 %	0 %	0 %	296125085
106	NC_014150	AAAT	2	8	32495	32502	75 %	25 %	0 %	0 %	296125085
107	NC_014150	ACTA	2	8	32937	32944	50 %	25 %	0 %	25 %	296125087
108	NC_014150	TGAA	2	8	33185	33192	50 %	25 %	25 %	0 %	296125087
109	NC_014150	TAAT	2	8	33533	33540	50 %	50 %	0 %	0 %	296125088
110	NC_014150	AAGT	2	8	33686	33693	50 %	25 %	25 %	0 %	296125088
111	NC_014150	TATT	2	8	34040	34047	25 %	75 %	0 %	0 %	296125089
112	NC_014150	AAAG	2	8	34399	34406	75 %	0 %	25 %	0 %	296125090
113	NC_014150	TTGT	2	8	34715	34722	0 %	75 %	25 %	0 %	296125090
114	NC_014150	TAAA	2	8	35876	35883	75 %	25 %	0 %	0 %	296125091
115	NC_014150	CTTT	2	8	35939	35946	0 %	75 %	0 %	25 %	296125091
116	NC_014150	TAAA	2	8	35987	35994	75 %	25 %	0 %	0 %	296125091
117	NC_014150	ATAC	2	8	36112	36119	50 %	25 %	0 %	25 %	296125091
118	NC_014150	AAAT	2	8	36771	36778	75 %	25 %	0 %	0 %	296125091
119	NC_014150	TTTG	2	8	36864	36871	0 %	75 %	25 %	0 %	296125092
120	NC_014150	TAAT	2	8	37379	37386	50 %	50 %	0 %	0 %	296125092
121	NC_014150	ATCA	2	8	37509	37516	50 %	25 %	0 %	25 %	296125093
122	NC_014150	TATT	2	8	38034	38041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014150	TTTA	2	8	38146	38153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014150	TACA	2	8	38416	38423	50 %	25 %	0 %	25 %	296125094
125	NC_014150	GAAA	2	8	39612	39619	75 %	0 %	25 %	0 %	296125094
126	NC_014150	TATG	2	8	39911	39918	25 %	50 %	25 %	0 %	296125094
127	NC_014150	AAAG	2	8	40149	40156	75 %	0 %	25 %	0 %	296125094
128	NC_014150	AAAG	2	8	40437	40444	75 %	0 %	25 %	0 %	296125094
129	NC_014150	TTAT	2	8	40631	40638	25 %	75 %	0 %	0 %	296125094
130	NC_014150	ATTA	2	8	41045	41052	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
131	NC_014150	ATTT	2	8	41464	41471	25 %	75 %	0 %	0 %	296125094
132	NC_014150	GTAT	2	8	41477	41484	25 %	50 %	25 %	0 %	296125094
133	NC_014150	AGAT	2	8	41506	41513	50 %	25 %	25 %	0 %	296125094
134	NC_014150	ATAA	2	8	41742	41749	75 %	25 %	0 %	0 %	296125094
135	NC_014150	ACAA	2	8	42147	42154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014150	ATTA	2	8	42192	42199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014150	TAAA	2	8	42350	42357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014150	TATT	2	8	42612	42619	25 %	75 %	0 %	0 %	296125095
139	NC_014150	AGCA	2	8	42662	42669	50 %	0 %	25 %	25 %	296125095
140	NC_014150	TTCT	2	8	43165	43172	0 %	75 %	0 %	25 %	296125095
141	NC_014150	CAAG	2	8	43206	43213	50 %	0 %	25 %	25 %	296125095
142	NC_014150	TATT	2	8	44153	44160	25 %	75 %	0 %	0 %	296125096
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