MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Planctomyces limnophilus DSM 3776 chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014148	ATTCGT	2	12	353	364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014148	ACGCGG	2	12	31632	31643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014148	GCATTG	2	12	121103	121114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014148	ACTTCG	2	12	195114	195125	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014148	TAGAAT	2	12	204216	204227	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014148	CAAAGG	2	12	204654	204665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014148	TTACCA	2	12	260553	260564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014148	CTGCCA	2	12	330068	330079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014148	TTCGAC	2	12	331290	331301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014148	CCTCGA	2	12	373873	373884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014148	CGCGAA	2	12	373913	373924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014148	TATCGA	2	12	378736	378747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014148	TACGAC	2	12	435024	435035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014148	ACTTCA	2	12	466698	466709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014148	GGAGAA	2	12	498832	498843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014148	CGAGAT	2	12	519406	519417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014148	CTACAG	2	12	538891	538902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014148	AGTCGA	2	12	560131	560142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014148	AGACTC	2	12	560717	560728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014148	AGTGAT	2	12	594636	594647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014148	ATTTTG	2	12	621865	621876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014148	AAAAGT	2	12	637718	637729	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014148	GGAGTT	2	12	702653	702664	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014148	GGCACT	2	12	748418	748429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014148	TTTCCG	2	12	750461	750472	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014148	CCGCAG	2	12	756969	756980	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014148	AAAGAG	2	12	765519	765530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014148	CACGAA	2	12	777031	777042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014148	GCGAGG	2	12	777221	777232	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014148	TGCTGG	2	12	777351	777362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014148	CTCGCA	2	12	783511	783522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014148	TGAACT	2	12	839470	839481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014148	CTGGTG	2	12	943164	943175	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014148	AATTTC	2	12	954731	954742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014148	CGAGTC	2	12	983538	983549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014148	GCATTT	2	12	1035638	1035649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014148	TGTTTT	2	12	1065708	1065719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014148	CGCAAC	2	12	1068681	1068692	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014148	CAAAAA	2	12	1096638	1096649	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014148	CCAATC	2	12	1118572	1118583	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014148	GGCTGG	2	12	1146420	1146431	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014148	TCCATG	2	12	1165121	1165132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014148	CGTGAA	2	12	1166591	1166602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014148	TTTTGC	2	12	1202468	1202479	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014148	GGGAGC	2	12	1211014	1211025	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014148	TTGATG	2	12	1213954	1213965	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014148	GAATTT	2	12	1214992	1215003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014148	CTGATT	2	12	1225989	1226000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014148	TCAGGT	2	12	1292447	1292458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014148	TCATTG	2	12	1349251	1349262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014148	CAGAAG	2	12	1359890	1359901	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014148	AAACGA	2	12	1392778	1392789	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014148	CTGCAT	2	12	1394499	1394510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014148	TTCTCT	2	12	1396104	1396115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014148	CGGTCA	2	12	1405435	1405446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014148	GCGATC	2	12	1405923	1405934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014148	CTTCGG	2	12	1407371	1407382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014148	CCAGCA	2	12	1409121	1409132	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014148	TTTCAC	2	12	1409521	1409532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014148	TTCAAA	2	12	1425646	1425657	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014148	TTCAAA	2	12	1425988	1425999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014148	TTCAAA	2	12	1426249	1426260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014148	AGTTCC	2	12	1547945	1547956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014148	TGCTGT	2	12	1608754	1608765	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014148	AAAGCA	2	12	1663470	1663481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014148	TGAAGT	2	12	1680573	1680584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014148	TGAGTT	2	12	1714846	1714857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014148	GACAAT	2	12	1751274	1751285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014148	GATGGC	2	12	1757264	1757275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014148	GAACCC	2	12	1761612	1761623	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014148	AAGAGG	2	12	1849978	1849989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014148	AAACTC	2	12	1972735	1972746	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014148	ACGAAA	2	12	1974572	1974583	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014148	GCAATT	2	12	2031311	2031322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014148	GGTGAG	2	12	2067671	2067682	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014148	GTCTCT	2	12	2088564	2088575	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014148	GACTGC	2	12	2089237	2089248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014148	AACTGA	2	12	2089689	2089700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014148	GATCAT	2	12	2097613	2097624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014148	ATCGAG	2	12	2103341	2103352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014148	TCGATC	2	12	2116414	2116425	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014148	AGGGAT	2	12	2119728	2119739	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014148	GAAAAT	2	12	2123524	2123535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014148	TTGCCT	2	12	2125799	2125810	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014148	GGTCAA	2	12	2125822	2125833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014148	CAAAGC	2	12	2253442	2253453	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014148	ACTCGA	2	12	2285935	2285946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014148	ACGGCA	2	12	2296541	2296552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014148	CCAAGC	2	12	2416074	2416085	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014148	AACATC	2	12	2603544	2603555	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014148	TCAGCA	2	12	2633009	2633020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014148	GATTGT	2	12	2734781	2734792	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014148	ACTTCA	2	12	2777213	2777224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014148	GAAACA	2	12	2782217	2782228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014148	AAACAG	2	12	2836110	2836121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014148	TCACGT	2	12	2894501	2894512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014148	AAATCA	2	12	2895344	2895355	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014148	CAAGTC	2	12	2964616	2964627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014148	GAATTC	2	12	2986173	2986184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014148	TGTCGC	2	12	3044933	3044944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014148	CATTTT	2	12	3064406	3064417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014148	ATCGAA	2	12	3144219	3144230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014148	CCCGCT	2	12	3171714	3171725	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014148	CATCGA	2	12	3239699	3239710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014148	CAAATC	2	12	3285505	3285516	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014148	TATTCA	2	12	3311696	3311707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014148	CCGAAA	2	12	3314057	3314068	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014148	AAACCC	2	12	3406310	3406321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014148	ACTGAA	2	12	3461949	3461960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014148	CAACTC	2	12	3539079	3539090	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014148	GTTGAA	2	12	3566973	3566984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014148	TGATTG	2	12	3580589	3580600	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014148	TCTCGT	2	12	3602519	3602530	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014148	ATCGAT	2	12	3605491	3605502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014148	TTGAAA	2	12	3652181	3652192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014148	CAGATA	2	12	3746384	3746395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014148	ATTTCA	2	12	3762760	3762771	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014148	GTGTTT	2	12	3940256	3940267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014148	GAATCA	2	12	3961416	3961427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014148	GTTCAA	2	12	4091213	4091224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014148	AAATGC	2	12	4107734	4107745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014148	CTACTT	2	12	4125516	4125527	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014148	CACAGA	2	12	4138466	4138477	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014148	ATCGAG	2	12	4146398	4146409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014148	GACTCA	2	12	4149970	4149981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014148	CAAAGC	2	12	4158007	4158018	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014148	GATCAC	2	12	4184663	4184674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014148	CCTGTT	2	12	4208055	4208066	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014148	GAAAAC	2	12	4215823	4215834	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014148	CAGAAC	2	12	4224669	4224680	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014148	TCGGGG	2	12	4377151	4377162	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014148	CACTGT	2	12	4430090	4430101	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014148	CTTTTC	2	12	4454010	4454021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014148	TCGTGA	2	12	4474866	4474877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_014148	TCAGGA	2	12	4524320	4524331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014148	TGGAGC	2	12	4538002	4538013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014148	TTCTCC	2	12	4539562	4539573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014148	TGAAAA	2	12	4612460	4612471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014148	ATCGGC	2	12	4749140	4749151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014148	CGACCA	2	12	4763442	4763453	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014148	TGTCCG	2	12	4817919	4817930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014148	ACTGGA	2	12	4843575	4843586	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_014148	AAATTC	2	12	4849044	4849055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_014148	TTCTCC	2	12	4854257	4854268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014148	GAGGTC	3	18	4888569	4888586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014148	CCCAAG	2	12	4901116	4901127	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014148	TCTGCG	2	12	4947096	4947107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_014148	TTCTCT	2	12	4971478	4971489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_014148	GGATTC	2	12	4983664	4983675	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_014148	CACCAA	2	12	5054193	5054204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014148	TTTCTG	2	12	5124471	5124482	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_014148	TTTCGC	2	12	5146082	5146093	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_014148	ATCCAT	2	12	5341339	5341350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_014148	TTCTCC	2	12	5382120	5382131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_014148	GTTTTT	2	12	5413306	5413317	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.