MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Thiomonas sp. str. 3As plasmid pTHI

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014144	G	6	6	165	170	0 %	0 %	100 %	0 %	296112159
2	NC_014144	T	6	6	1776	1781	0 %	100 %	0 %	0 %	296112160
3	NC_014144	A	6	6	3770	3775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014144	T	6	6	3923	3928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014144	C	6	6	4030	4035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_014144	C	7	7	4147	4153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_014144	C	7	7	4188	4194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_014144	C	6	6	4208	4213	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_014144	C	6	6	4227	4232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_014144	G	6	6	4259	4264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014144	A	7	7	5726	5732	100 %	0 %	0 %	0 %	296112168
12	NC_014144	T	6	6	11320	11325	0 %	100 %	0 %	0 %	296112174
13	NC_014144	A	6	6	11980	11985	100 %	0 %	0 %	0 %	296112176
14	NC_014144	T	6	6	13402	13407	0 %	100 %	0 %	0 %	296112180
15	NC_014144	C	6	6	13999	14004	0 %	0 %	0 %	100 %	296112181
16	NC_014144	T	6	6	14082	14087	0 %	100 %	0 %	0 %	296112181
17	NC_014144	C	6	6	14152	14157	0 %	0 %	0 %	100 %	296112181
18	NC_014144	C	6	6	14161	14166	0 %	0 %	0 %	100 %	296112181
19	NC_014144	A	6	6	16040	16045	100 %	0 %	0 %	0 %	296112182
20	NC_014144	C	6	6	17471	17476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_014144	T	6	6	17554	17559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014144	C	6	6	17624	17629	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_014144	C	6	6	17633	17638	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_014144	G	6	6	19127	19132	0 %	0 %	100 %	0 %	296112186
25	NC_014144	T	6	6	19189	19194	0 %	100 %	0 %	0 %	296112186
26	NC_014144	G	6	6	19550	19555	0 %	0 %	100 %	0 %	296112187
27	NC_014144	T	8	8	20097	20104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014144	T	6	6	21276	21281	0 %	100 %	0 %	0 %	296112190
29	NC_014144	C	6	6	21460	21465	0 %	0 %	0 %	100 %	296112191
30	NC_014144	T	6	6	21473	21478	0 %	100 %	0 %	0 %	296112191
31	NC_014144	T	8	8	22320	22327	0 %	100 %	0 %	0 %	296112194
32	NC_014144	A	7	7	22866	22872	100 %	0 %	0 %	0 %	296112195
33	NC_014144	A	6	6	23215	23220	100 %	0 %	0 %	0 %	296112195
34	NC_014144	A	6	6	23465	23470	100 %	0 %	0 %	0 %	296112196
35	NC_014144	G	6	6	25104	25109	0 %	0 %	100 %	0 %	296112197
36	NC_014144	G	6	6	25555	25560	0 %	0 %	100 %	0 %	296112197
37	NC_014144	T	6	6	28463	28468	0 %	100 %	0 %	0 %	296112202
38	NC_014144	A	7	7	29314	29320	100 %	0 %	0 %	0 %	296112202
39	NC_014144	G	6	6	30577	30582	0 %	0 %	100 %	0 %	296112203
40	NC_014144	G	6	6	33400	33405	0 %	0 %	100 %	0 %	296112205
41	NC_014144	T	6	6	33454	33459	0 %	100 %	0 %	0 %	296112205
42	NC_014144	T	6	6	35383	35388	0 %	100 %	0 %	0 %	296112207
43	NC_014144	A	6	6	36070	36075	100 %	0 %	0 %	0 %	296112208
44	NC_014144	A	6	6	36620	36625	100 %	0 %	0 %	0 %	296112208
45	NC_014144	C	6	6	38859	38864	0 %	0 %	0 %	100 %	296112211
46	NC_014144	T	6	6	40056	40061	0 %	100 %	0 %	0 %	296112211
47	NC_014144	G	6	6	42623	42628	0 %	0 %	100 %	0 %	296112218
48	NC_014144	C	6	6	43857	43862	0 %	0 %	0 %	100 %	296112220
49	NC_014144	T	6	6	43940	43945	0 %	100 %	0 %	0 %	296112220
50	NC_014144	C	6	6	44010	44015	0 %	0 %	0 %	100 %	296112220
51	NC_014144	C	6	6	44019	44024	0 %	0 %	0 %	100 %	296112220
52	NC_014144	A	6	6	44552	44557	100 %	0 %	0 %	0 %	296112220
53	NC_014144	C	9	9	44663	44671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_014144	C	6	6	45105	45110	0 %	0 %	0 %	100 %	296112222
55	NC_014144	G	6	6	45977	45982	0 %	0 %	100 %	0 %	296112224

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.