MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 chromosome

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014136	AACATA	2	12	15312	15323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014136	TACTTA	2	12	15328	15339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014136	AAATAA	2	12	60410	60421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014136	AAATTT	2	12	100841	100852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014136	TTTAAA	2	12	115872	115883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014136	TCAAAC	2	12	146263	146274	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014136	CATATC	2	12	158738	158749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014136	TTATAA	2	12	206035	206046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014136	TTATTT	2	12	306873	306884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014136	AATTTA	2	12	321851	321862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014136	GATCCT	2	12	328052	328063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014136	TTTAAA	2	12	353992	354003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014136	TTCAAA	2	12	373246	373257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014136	AATTAA	2	12	383800	383811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014136	ATAAAA	2	12	399394	399405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014136	TTATAA	2	12	400786	400797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014136	ATGACT	2	12	400834	400845	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014136	ATAATG	2	12	434331	434342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014136	TCAAAT	2	12	511075	511086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014136	TAATAT	2	12	547497	547508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014136	CACTTC	2	12	572107	572118	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014136	TCGCTT	2	12	574296	574307	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014136	ATTTAT	2	12	592237	592248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014136	ATTATC	2	12	593173	593184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014136	TATTTA	2	12	594803	594814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014136	GATTTT	2	12	637014	637025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014136	ACAATA	2	12	699606	699617	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014136	AATTAA	2	12	770382	770393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014136	TTATAT	2	12	787471	787482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014136	TTAATT	2	12	838831	838842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014136	TATTTT	2	12	841433	841444	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014136	AACTGT	2	12	850813	850824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014136	AAGCGA	2	12	927860	927871	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014136	GAAGTG	2	12	930049	930060	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014136	TAAACA	2	12	956877	956888	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014136	CATTTA	2	12	1019154	1019165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014136	TTAATC	2	12	1020338	1020349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014136	TATTTT	2	12	1031831	1031842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014136	CTATTG	2	12	1034707	1034718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014136	ACAAAT	2	12	1039663	1039674	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014136	TATGAA	2	12	1077439	1077450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014136	TAATTT	2	12	1087045	1087056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014136	AATCGT	2	12	1104369	1104380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014136	AAGCGA	2	12	1129006	1129017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014136	GAAGTG	2	12	1131195	1131206	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014136	CAATCT	2	12	1135483	1135494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014136	TATAAA	2	12	1153004	1153015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014136	TTTTTA	2	12	1163873	1163884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014136	TAAATA	2	12	1173064	1173075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014136	TGTTAA	2	12	1190617	1190628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014136	AACTGA	2	12	1203064	1203075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014136	ACAAAA	2	12	1246181	1246192	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014136	AAGCGA	2	12	1260184	1260195	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014136	GAAGTG	2	12	1262373	1262384	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014136	TAAAAT	2	12	1272912	1272923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014136	ATGTGT	2	12	1303528	1303539	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014136	TTAAAA	2	12	1317487	1317498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014136	AAATCA	2	12	1323849	1323860	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014136	TAGTAA	2	12	1325997	1326008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014136	GTAGAC	2	12	1369399	1369410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014136	ATTAAT	2	12	1412994	1413005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014136	ATTAAG	2	12	1442889	1442900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014136	CTTATA	2	12	1502712	1502723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014136	TAATTT	2	12	1504807	1504818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014136	TTATGC	2	12	1534248	1534259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014136	TCATAA	2	12	1547124	1547135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014136	AATTAA	2	12	1567146	1567157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014136	GTTTAT	2	12	1569755	1569766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014136	TTTTTA	2	12	1649089	1649100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014136	AAATTG	2	12	1689060	1689071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014136	TACAAA	2	12	1689244	1689255	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014136	TTAATA	2	12	1731085	1731096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014136	TCATGT	2	12	1813931	1813942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014136	AAAAGA	2	12	1859371	1859382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014136	TTAAAA	2	12	1939080	1939091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.