MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 chromosome

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014136	ACAAA	2	10	567	576	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014136	AGTAT	2	10	15341	15350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014136	ATATA	2	10	15375	15384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014136	AACAA	2	10	16534	16543	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014136	TCGCA	2	10	29063	29072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014136	ACGCT	2	10	30587	30596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014136	GCTAT	2	10	33832	33841	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014136	GAGTA	2	10	60376	60385	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014136	TATGA	2	10	69085	69094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014136	CATTA	2	10	69327	69336	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014136	GGAAA	2	10	73132	73141	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014136	TTTTA	2	10	82360	82369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014136	AAATC	2	10	87105	87114	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014136	CTAAA	2	10	92666	92675	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014136	TTCAG	2	10	93838	93847	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014136	TCAAA	2	10	94932	94941	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014136	TTAAT	2	10	102992	103001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014136	ACATG	2	10	109802	109811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014136	TACAT	2	10	113621	113630	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014136	AAATA	2	10	123027	123036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014136	TTGTA	2	10	143144	143153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014136	CTTTG	2	10	144766	144775	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014136	TTTAT	2	10	144784	144793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014136	TGATA	2	10	144867	144876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014136	TAATT	2	10	146108	146117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014136	TAAAA	2	10	156579	156588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014136	TAATT	2	10	166541	166550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014136	TCAAA	2	10	172871	172880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014136	GATAT	2	10	200727	200736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014136	TATTT	2	10	212001	212010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014136	TTTTA	2	10	242589	242598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014136	TTATT	2	10	258071	258080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014136	TATTT	2	10	258991	259000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014136	GGTGA	2	10	260983	260992	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014136	ATTTT	2	10	272680	272689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014136	TTTAT	2	10	291761	291770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014136	TAATA	2	10	296535	296544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014136	AAATA	2	10	296697	296706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014136	AAAAT	2	10	305503	305512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014136	AATAA	2	10	321912	321921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014136	TTTCA	2	10	321989	321998	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014136	AAAAT	2	10	324110	324119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014136	AAAAG	2	10	330887	330896	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014136	GAAAA	2	10	360500	360509	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014136	CTTAT	2	10	386596	386605	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014136	AGGAA	2	10	392902	392911	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014136	AAAAT	2	10	393623	393632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014136	TTTAC	2	10	409417	409426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014136	TAAAA	2	10	415659	415668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014136	TTAAT	2	10	421286	421295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014136	AAATT	2	10	455987	455996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014136	ATCTA	2	10	456015	456024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014136	TTAAT	2	10	461871	461880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014136	ACGAC	2	10	479378	479387	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014136	AGACA	2	10	484032	484041	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014136	TAATT	2	10	490434	490443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014136	CAAAA	2	10	513897	513906	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014136	TGCAA	2	10	517134	517143	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014136	TATAC	2	10	517232	517241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014136	ATTTT	2	10	523202	523211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014136	AAGAA	2	10	527892	527901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014136	TCTAT	2	10	535232	535241	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014136	TAAAA	2	10	552243	552252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014136	TTATA	2	10	570492	570501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014136	ATCTC	2	10	572173	572182	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014136	CACGA	2	10	575806	575815	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014136	TGGTA	2	10	576392	576401	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014136	TTTAG	2	10	607412	607421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014136	GAAAA	2	10	614891	614900	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014136	TTTTA	2	10	620173	620182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014136	AATTA	2	10	636965	636974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014136	ATTTA	2	10	640223	640232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014136	TCACT	2	10	640322	640331	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014136	AACTC	2	10	644864	644873	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014136	TTATA	2	10	660830	660839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014136	GTATT	2	10	665102	665111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014136	ATTTC	2	10	666786	666795	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014136	TAAGT	2	10	666940	666949	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014136	AAAAT	2	10	671456	671465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014136	TAGTT	2	10	672705	672714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014136	CTATA	2	10	676672	676681	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014136	TGATG	2	10	682991	683000	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014136	CATTT	2	10	685920	685929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014136	TTTAA	2	10	687556	687565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014136	TCAAG	2	10	697475	697484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014136	TTATA	2	10	699567	699576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014136	TGATT	2	10	711783	711792	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014136	ATATA	2	10	716380	716389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014136	ATTTA	2	10	716628	716637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014136	GATAA	2	10	718756	718765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014136	TCTCT	2	10	718835	718844	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014136	GATAT	2	10	726202	726211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014136	ATTCA	2	10	733496	733505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014136	CCAAA	2	10	737039	737048	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014136	ATTAT	2	10	737145	737154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014136	TAAAA	2	10	738514	738523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014136	TCATT	2	10	745320	745329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014136	TATTT	2	10	759959	759968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014136	CAATA	2	10	770238	770247	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014136	TTTTA	2	10	797751	797760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014136	AATAA	2	10	803913	803922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014136	CATGT	2	10	807487	807496	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014136	TTATT	2	10	812536	812545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014136	ATTAT	2	10	812621	812630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014136	GTATT	2	10	822344	822353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014136	GTCAT	2	10	826245	826254	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014136	TAAGT	2	10	830417	830426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014136	TAACA	2	10	843667	843676	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014136	AAATT	2	10	845248	845257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014136	TATAA	2	10	863534	863543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014136	TTGCT	2	10	867069	867078	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014136	TTAAT	2	10	871131	871140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014136	TCTAA	2	10	898677	898686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014136	ATGAT	2	10	901806	901815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014136	GATTA	2	10	908104	908113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014136	TTAAT	2	10	921268	921277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014136	TTAGA	2	10	922250	922259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014136	TACCA	2	10	925766	925775	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014136	TCGTG	2	10	926352	926361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014136	GTTAA	2	10	927195	927204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014136	GAGAT	2	10	929985	929994	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014136	ATAAA	2	10	934391	934400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014136	TAATT	2	10	934609	934618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014136	TGTAA	2	10	940959	940968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014136	TAAAT	2	10	958016	958025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014136	AGGAA	2	10	961154	961163	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014136	ATATT	2	10	982584	982593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014136	AATCA	2	10	990586	990595	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014136	GTATA	2	10	990604	990613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014136	GGTAA	2	10	1000990	1000999	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014136	TGGTT	2	10	1003022	1003031	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014136	ATATG	2	10	1003058	1003067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014136	AAAGA	2	10	1005598	1005607	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014136	ATTTG	2	10	1015268	1015277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014136	TTGTG	2	10	1032095	1032104	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014136	GTTCA	2	10	1032422	1032431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014136	ATAAA	2	10	1048105	1048114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014136	GAGAG	2	10	1048201	1048210	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014136	ATGAA	2	10	1049391	1049400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014136	TGACA	2	10	1051639	1051648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014136	TTTTA	2	10	1058714	1058723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014136	AAGGT	2	10	1058747	1058756	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014136	GGTTA	2	10	1062930	1062939	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014136	TTTAA	2	10	1066480	1066489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014136	CAAAA	2	10	1074109	1074118	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014136	TAGAA	2	10	1078206	1078215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014136	TTAAG	2	10	1080822	1080831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.