MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4726

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014134	TAAA	2	8	58	65	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014134	AGTT	2	8	620	627	25 %	50 %	25 %	0 %	296100304
3	NC_014134	GAAA	2	8	867	874	75 %	0 %	25 %	0 %	296100304
4	NC_014134	GAAC	2	8	937	944	50 %	0 %	25 %	25 %	296100304
5	NC_014134	AGGC	2	8	1202	1209	25 %	0 %	50 %	25 %	296100304
6	NC_014134	TTTG	2	8	1458	1465	0 %	75 %	25 %	0 %	296100304
7	NC_014134	CGTC	2	8	2399	2406	0 %	25 %	25 %	50 %	296100305
8	NC_014134	ATAG	2	8	3344	3351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014134	CTTT	2	8	3412	3419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014134	TTTG	2	8	3919	3926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014134	AACA	2	8	3997	4004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014134	GTTT	2	8	4362	4369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014134	GGCT	2	8	4638	4645	0 %	25 %	50 %	25 %	296100309
14	NC_014134	AAAG	2	8	5362	5369	75 %	0 %	25 %	0 %	296100310
15	NC_014134	AAAT	2	8	5896	5903	75 %	25 %	0 %	0 %	296100310
16	NC_014134	AGAA	2	8	6067	6074	75 %	0 %	25 %	0 %	296100310
17	NC_014134	CAAG	2	8	6295	6302	50 %	0 %	25 %	25 %	296100310
18	NC_014134	AGGT	2	8	6390	6397	25 %	25 %	50 %	0 %	296100310
19	NC_014134	ATTT	2	8	6720	6727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014134	GATA	2	8	6736	6743	50 %	25 %	25 %	0 %	296100311
21	NC_014134	AAGG	2	8	6965	6972	50 %	0 %	50 %	0 %	296100311
22	NC_014134	ATTA	2	8	7528	7535	50 %	50 %	0 %	0 %	296100312
23	NC_014134	AAAC	2	8	7981	7988	75 %	0 %	0 %	25 %	296100313
24	NC_014134	CAAT	2	8	8530	8537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014134	CTGG	2	8	8722	8729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014134	TCGG	2	8	9062	9069	0 %	25 %	50 %	25 %	296100314
27	NC_014134	CAAT	2	8	9175	9182	50 %	25 %	0 %	25 %	296100314
28	NC_014134	CATT	2	8	9216	9223	25 %	50 %	0 %	25 %	296100314
29	NC_014134	ACAA	2	8	9939	9946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014134	AAAC	2	8	10051	10058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014134	CTTG	2	8	10320	10327	0 %	50 %	25 %	25 %	296100316
32	NC_014134	TAAG	2	8	10341	10348	50 %	25 %	25 %	0 %	296100316
33	NC_014134	TCAC	2	8	10731	10738	25 %	25 %	0 %	50 %	296100316
34	NC_014134	AATG	2	8	10927	10934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014134	GACT	2	8	11218	11225	25 %	25 %	25 %	25 %	296100317
36	NC_014134	TGGT	2	8	11251	11258	0 %	50 %	50 %	0 %	296100317
37	NC_014134	CACG	2	8	11281	11288	25 %	0 %	25 %	50 %	296100317
38	NC_014134	AGCC	2	8	11384	11391	25 %	0 %	25 %	50 %	296100317
39	NC_014134	GTTC	2	8	12071	12078	0 %	50 %	25 %	25 %	296100318
40	NC_014134	GATC	2	8	12663	12670	25 %	25 %	25 %	25 %	296100319
41	NC_014134	AGTG	2	8	12830	12837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014134	AATT	2	8	12895	12902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014134	AATT	2	8	13159	13166	50 %	50 %	0 %	0 %	296100320
44	NC_014134	GACG	2	8	13662	13669	25 %	0 %	50 %	25 %	296100321
45	NC_014134	AGAA	2	8	13712	13719	75 %	0 %	25 %	0 %	296100321
46	NC_014134	CAAT	2	8	14905	14912	50 %	25 %	0 %	25 %	296100323
47	NC_014134	TAAA	2	8	14977	14984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014134	CCAA	2	8	15214	15221	50 %	0 %	0 %	50 %	296100324
49	NC_014134	TGAA	2	8	15286	15293	50 %	25 %	25 %	0 %	296100324
50	NC_014134	TGAC	2	8	16104	16111	25 %	25 %	25 %	25 %	296100326
51	NC_014134	TAAT	2	8	16480	16487	50 %	50 %	0 %	0 %	296100327
52	NC_014134	CAAG	2	8	17206	17213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014134	TTTA	2	8	17606	17613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014134	TTTG	2	8	17930	17937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014134	ATTA	2	8	18499	18506	50 %	50 %	0 %	0 %	296100329
56	NC_014134	ATAC	2	8	18976	18983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014134	AATC	2	8	19543	19550	50 %	25 %	0 %	25 %	296100331
58	NC_014134	TTTG	2	8	19716	19723	0 %	75 %	25 %	0 %	296100331
59	NC_014134	TAAA	2	8	20626	20633	75 %	25 %	0 %	0 %	296100331
60	NC_014134	TGAG	2	8	20808	20815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014134	TTTG	2	8	21662	21669	0 %	75 %	25 %	0 %	296100332
62	NC_014134	TTCT	2	8	21815	21822	0 %	75 %	0 %	25 %	296100332
63	NC_014134	GGCA	2	8	21995	22002	25 %	0 %	50 %	25 %	296100332
64	NC_014134	GCGT	2	8	23208	23215	0 %	25 %	50 %	25 %	296100334
65	NC_014134	ATAC	2	8	23402	23409	50 %	25 %	0 %	25 %	296100334
66	NC_014134	GCCA	2	8	23454	23461	25 %	0 %	25 %	50 %	296100334
67	NC_014134	ATTT	2	8	23565	23572	25 %	75 %	0 %	0 %	296100334
68	NC_014134	TTTA	3	12	23998	24009	25 %	75 %	0 %	0 %	296100335
69	NC_014134	CTAT	2	8	24158	24165	25 %	50 %	0 %	25 %	296100335
70	NC_014134	ATTT	2	8	24271	24278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014134	TCAA	2	8	24788	24795	50 %	25 %	0 %	25 %	296100336
72	NC_014134	TTGA	2	8	24892	24899	25 %	50 %	25 %	0 %	296100336
73	NC_014134	CTTT	2	8	24978	24985	0 %	75 %	0 %	25 %	296100336
74	NC_014134	TTTA	2	8	25361	25368	25 %	75 %	0 %	0 %	296100337
75	NC_014134	CTTT	2	8	25509	25516	0 %	75 %	0 %	25 %	296100337
76	NC_014134	AAAT	2	8	25625	25632	75 %	25 %	0 %	0 %	296100337
77	NC_014134	TACA	2	8	26254	26261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014134	TTTG	2	8	26267	26274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014134	ACAA	2	8	26497	26504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014134	AATA	2	8	26611	26618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014134	GACG	2	8	26717	26724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014134	GTTT	2	8	26744	26751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014134	TCAA	2	8	26817	26824	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014134	CTTG	2	8	26835	26842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014134	AGCC	2	8	27110	27117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014134	TGAA	2	8	28261	28268	50 %	25 %	25 %	0 %	296100338
87	NC_014134	TAAT	2	8	28399	28406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014134	TTGG	2	8	28625	28632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014134	AATG	2	8	29501	29508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014134	ATTG	2	8	29570	29577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.