MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4726

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014134	AAT	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014134	ATT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014134	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014134	ATT	2	6	119	124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014134	ATT	2	6	160	165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100304
6	NC_014134	GAA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
7	NC_014134	TGG	2	6	258	263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100304
8	NC_014134	TAA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
9	NC_014134	GCG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100304
10	NC_014134	CTG	2	6	434	439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100304
11	NC_014134	GAT	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
12	NC_014134	TTA	2	6	512	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100304
13	NC_014134	TCA	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100304
14	NC_014134	CAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100304
15	NC_014134	AGA	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
16	NC_014134	ACT	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100304
17	NC_014134	GTC	2	6	905	910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100304
18	NC_014134	ATG	2	6	983	988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
19	NC_014134	TGG	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100304
20	NC_014134	GAT	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
21	NC_014134	ATT	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100304
22	NC_014134	TAA	2	6	1086	1091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
23	NC_014134	TAA	2	6	1101	1106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
24	NC_014134	TAG	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
25	NC_014134	GAA	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
26	NC_014134	AAG	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
27	NC_014134	TCA	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100304
28	NC_014134	ACA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100304
29	NC_014134	GAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
30	NC_014134	CAA	2	6	1433	1438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100304
31	NC_014134	TAA	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
32	NC_014134	AAC	2	6	1610	1615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014134	ATC	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100305
34	NC_014134	TTA	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100305
35	NC_014134	TCA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100305
36	NC_014134	GTC	2	6	1822	1827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100305
37	NC_014134	CAC	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100305
38	NC_014134	GAC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100305
39	NC_014134	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100305
40	NC_014134	AGA	2	6	2363	2368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100305
41	NC_014134	CAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100305
42	NC_014134	CAG	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100305
43	NC_014134	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014134	ATA	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014134	GTC	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100306
46	NC_014134	GGT	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100306
47	NC_014134	ATT	2	6	2816	2821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100306
48	NC_014134	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100306
49	NC_014134	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100306
50	NC_014134	GAA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100306
51	NC_014134	GTT	2	6	3008	3013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100306
52	NC_014134	GAA	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100306
53	NC_014134	TTA	2	6	3104	3109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014134	TGA	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014134	AAT	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014134	TTA	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014134	TCA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014134	TTA	2	6	3368	3373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014134	GTT	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100307
60	NC_014134	AAC	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100307
61	NC_014134	TTG	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014134	TAA	2	6	3654	3659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014134	AAT	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014134	CCA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014134	TTG	2	6	3857	3862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014134	TGA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014134	AGA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014134	ATT	2	6	4038	4043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014134	CAA	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014134	TTG	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100308
71	NC_014134	CGA	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100308
72	NC_014134	TCG	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100308
73	NC_014134	TCG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014134	AAT	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014134	ATG	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014134	TAT	2	6	4452	4457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014134	CAT	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014134	CTA	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014134	ATA	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100310
80	NC_014134	TAT	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
81	NC_014134	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100310
82	NC_014134	AAC	2	6	5127	5132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100310
83	NC_014134	TGA	2	6	5236	5241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100310
84	NC_014134	AGA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100310
85	NC_014134	ACT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100310
86	NC_014134	TAT	2	6	5398	5403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
87	NC_014134	ATT	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
88	NC_014134	AGA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100310
89	NC_014134	ATT	2	6	5804	5809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
90	NC_014134	AGG	3	9	5826	5834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100310
91	NC_014134	ATC	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100310
92	NC_014134	GTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100310
93	NC_014134	TGA	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100310
94	NC_014134	TAT	2	6	6207	6212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
95	NC_014134	GAC	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100310
96	NC_014134	CGT	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100310
97	NC_014134	ATA	2	6	6551	6556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100310
98	NC_014134	TAG	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100310
99	NC_014134	CAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100311
100	NC_014134	CTG	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100311
101	NC_014134	TGA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100311
102	NC_014134	TCA	2	6	7043	7048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100312
103	NC_014134	CAA	2	6	7255	7260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100312
104	NC_014134	TTC	2	6	7298	7303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100312
105	NC_014134	CTG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100312
106	NC_014134	TAG	2	6	7342	7347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100312
107	NC_014134	GAA	3	9	7401	7409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100312
108	NC_014134	ATG	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100312
109	NC_014134	TAA	2	6	7487	7492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100312
110	NC_014134	AGA	2	6	7502	7507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100312
111	NC_014134	GGA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014134	ATC	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100313
113	NC_014134	ATC	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100313
114	NC_014134	ATG	2	6	7616	7621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100313
115	NC_014134	TAT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100313
116	NC_014134	CGA	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100313
117	NC_014134	ATT	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100313
118	NC_014134	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100313
119	NC_014134	ATT	3	9	8220	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100313
120	NC_014134	ATG	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014134	GCG	2	6	8361	8366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014134	ATT	2	6	8376	8381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014134	CAA	2	6	8438	8443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014134	TGA	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014134	GAC	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014134	CAA	2	6	8517	8522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014134	AAC	2	6	8687	8692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014134	AAT	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014134	CAC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014134	ACG	2	6	9038	9043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100314
131	NC_014134	ATC	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100314
132	NC_014134	TTA	2	6	9116	9121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100314
133	NC_014134	TCG	2	6	9321	9326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100314
134	NC_014134	TTG	2	6	9429	9434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100314
135	NC_014134	ATT	3	9	9459	9467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100314
136	NC_014134	ATT	2	6	9544	9549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014134	CTT	3	9	9576	9584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014134	CAG	2	6	9603	9608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014134	AAT	2	6	9649	9654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014134	CTG	2	6	9803	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014134	ATT	2	6	9926	9931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014134	TGG	2	6	10161	10166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100315
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151	NC_014134	ATT	2	6	10939	10944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014134	CAT	2	6	11008	11013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014134	CAT	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100317
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182	NC_014134	TCA	2	6	13423	13428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_014134	TTA	2	6	13802	13807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_014134	TGG	2	6	19402	19407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100331
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264	NC_014134	GGA	2	6	19632	19637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100331
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266	NC_014134	TAT	2	6	19800	19805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100331
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269	NC_014134	ATT	2	6	20236	20241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100331
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271	NC_014134	TAG	2	6	20312	20317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100331
272	NC_014134	TTA	2	6	20353	20358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100331
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280	NC_014134	AAT	2	6	20706	20711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014134	AAT	2	6	20734	20739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_014134	AAT	2	6	21077	21082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014134	AAT	2	6	21191	21196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100332
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330	NC_014134	ATT	2	6	23734	23739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_014134	AGG	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_014134	TAT	2	6	27443	27448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_014134	TTA	2	6	27787	27792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
381	NC_014134	TGA	2	6	27859	27864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
382	NC_014134	AAG	2	6	27868	27873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
383	NC_014134	CAA	2	6	28056	28061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100338
384	NC_014134	CAA	2	6	28110	28115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100338
385	NC_014134	ACC	2	6	28215	28220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100338
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388	NC_014134	TTA	2	6	28469	28474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_014134	AGC	2	6	28617	28622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_014134	TTC	2	6	28819	28824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100339
391	NC_014134	CCT	2	6	29070	29075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
392	NC_014134	CGG	2	6	29259	29264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_014134	AAT	2	6	29551	29556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_014134	TTG	2	6	29610	29615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.