MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4726

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014134	AAT	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014134	ATT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014134	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014134	ATT	2	6	119	124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014134	AAC	2	6	1610	1615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014134	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014134	ATA	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014134	TTA	2	6	3104	3109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014134	TGA	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014134	AAT	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014134	TTA	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014134	TCA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014134	TTA	2	6	3368	3373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014134	TTG	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014134	TAA	2	6	3654	3659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014134	AAT	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014134	CCA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014134	TTG	2	6	3857	3862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014134	TGA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014134	AGA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014134	ATT	2	6	4038	4043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014134	CAA	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014134	TCG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014134	AAT	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014134	ATG	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014134	TAT	2	6	4452	4457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014134	CAT	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014134	CTA	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014134	GGA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014134	ATG	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014134	GCG	2	6	8361	8366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014134	ATT	2	6	8376	8381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014134	CAA	2	6	8438	8443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014134	TGA	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014134	GAC	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014134	CAA	2	6	8517	8522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014134	AAC	2	6	8687	8692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014134	AAT	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014134	CAC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014134	ATT	2	6	9544	9549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014134	CTT	3	9	9576	9584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014134	CAG	2	6	9603	9608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014134	AAT	2	6	9649	9654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014134	CTG	2	6	9803	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014134	ATT	2	6	9926	9931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014134	AAT	2	6	10885	10890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014134	ATT	2	6	10939	10944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014134	CAT	2	6	11008	11013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014134	TAT	2	6	12709	12714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014134	ACC	2	6	13362	13367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014134	TCA	2	6	13423	13428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014134	TAA	2	6	13796	13801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014134	TTA	2	6	13802	13807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014134	AGG	2	6	13818	13823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014134	GGA	2	6	14417	14422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014134	ATT	2	6	15068	15073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014134	CTC	2	6	15091	15096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014134	TAG	2	6	15112	15117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014134	AAG	2	6	16313	16318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014134	TAA	2	6	16371	16376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014134	ACT	2	6	17123	17128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014134	TAA	2	6	17145	17150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014134	TGG	2	6	17222	17227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014134	TTG	2	6	17254	17259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014134	GTT	2	6	17334	17339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014134	AGT	2	6	17351	17356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014134	ACT	2	6	17360	17365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014134	TTA	2	6	17456	17461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014134	AAC	2	6	17469	17474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014134	ATT	2	6	17573	17578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014134	GTA	2	6	18010	18015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014134	ATG	2	6	18053	18058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014134	ATT	2	6	18069	18074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014134	TGT	2	6	19079	19084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014134	AAT	2	6	20706	20711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014134	AAT	2	6	20734	20739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014134	AAG	2	6	20873	20878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014134	ATG	2	6	20888	20893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014134	TAA	2	6	20979	20984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014134	AAT	2	6	21051	21056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014134	AAT	2	6	21077	21082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014134	GTG	2	6	23671	23676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014134	ATT	2	6	23688	23693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014134	ATT	2	6	23734	23739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014134	AGG	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014134	GAG	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014134	ATG	2	6	24322	24327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014134	AGA	2	6	24338	24343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014134	ATA	2	6	24370	24375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014134	ACT	2	6	24420	24425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014134	ACC	2	6	24491	24496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014134	GCT	2	6	24502	24507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014134	TGC	2	6	24579	24584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014134	TAT	2	6	26186	26191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014134	TAA	2	6	26203	26208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014134	CCA	2	6	26227	26232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014134	TAT	2	6	26288	26293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014134	ACA	2	6	26294	26299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014134	TGT	2	6	26309	26314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014134	ACT	2	6	26468	26473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014134	GTA	2	6	26519	26524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014134	TTC	2	6	26790	26795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014134	CTT	2	6	26852	26857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014134	AAT	4	12	26905	26916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014134	TGT	2	6	26936	26941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014134	GAA	2	6	27231	27236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014134	ACG	2	6	27261	27266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014134	TAA	2	6	27323	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014134	ATT	2	6	27349	27354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014134	CTG	2	6	27384	27389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014134	TAT	2	6	27443	27448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014134	ATA	2	6	27636	27641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014134	TTA	2	6	27718	27723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014134	TTG	2	6	27765	27770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014134	TTA	2	6	27787	27792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014134	TGA	2	6	27859	27864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014134	AAG	2	6	27868	27873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014134	TTA	2	6	28469	28474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014134	AGC	2	6	28617	28622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014134	CCT	2	6	29070	29075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014134	CGG	2	6	29259	29264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014134	AAT	2	6	29551	29556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014134	TTG	2	6	29610	29615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.