MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4719

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014133	AATT	2	8	24	31	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014133	CACT	2	8	89	96	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014133	ATAA	2	8	257	264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014133	TAAT	3	12	271	282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014133	TATT	2	8	283	290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014133	GTGA	2	8	460	467	25 %	25 %	50 %	0 %	296100282
7	NC_014133	GCAC	2	8	743	750	25 %	0 %	25 %	50 %	296100282
8	NC_014133	AATC	2	8	1142	1149	50 %	25 %	0 %	25 %	296100283
9	NC_014133	TGGT	2	8	1326	1333	0 %	50 %	50 %	0 %	296100284
10	NC_014133	CAAT	2	8	1577	1584	50 %	25 %	0 %	25 %	296100285
11	NC_014133	AATC	2	8	2088	2095	50 %	25 %	0 %	25 %	296100285
12	NC_014133	GTGA	2	8	2470	2477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014133	CTTA	2	8	2648	2655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014133	GATA	2	8	2852	2859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014133	ATTT	2	8	2874	2881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014133	GAAA	2	8	3203	3210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014133	TAGT	2	8	4394	4401	25 %	50 %	25 %	0 %	296100288
18	NC_014133	TATT	2	8	4561	4568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014133	GCAG	2	8	5732	5739	25 %	0 %	50 %	25 %	296100289
20	NC_014133	TAAA	2	8	7345	7352	75 %	25 %	0 %	0 %	296100290
21	NC_014133	TGTA	2	8	7377	7384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014133	AATT	2	8	7393	7400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014133	GAAA	2	8	7706	7713	75 %	0 %	25 %	0 %	296100291
24	NC_014133	AGTT	2	8	7781	7788	25 %	50 %	25 %	0 %	296100291
25	NC_014133	TGCG	2	8	7855	7862	0 %	25 %	50 %	25 %	296100291
26	NC_014133	TTGA	2	8	7959	7966	25 %	50 %	25 %	0 %	296100291
27	NC_014133	AATT	2	8	8233	8240	50 %	50 %	0 %	0 %	296100291
28	NC_014133	GGCA	2	8	8452	8459	25 %	0 %	50 %	25 %	296100291
29	NC_014133	TAAT	2	8	8761	8768	50 %	50 %	0 %	0 %	296100292
30	NC_014133	GTAC	2	8	8786	8793	25 %	25 %	25 %	25 %	296100292
31	NC_014133	GTAA	2	8	8898	8905	50 %	25 %	25 %	0 %	296100292
32	NC_014133	GTTT	2	8	8935	8942	0 %	75 %	25 %	0 %	296100292
33	NC_014133	AATT	2	8	9196	9203	50 %	50 %	0 %	0 %	296100292
34	NC_014133	AGTG	2	8	10274	10281	25 %	25 %	50 %	0 %	296100293
35	NC_014133	CGGG	2	8	10866	10873	0 %	0 %	75 %	25 %	296100294
36	NC_014133	GTGA	2	8	10923	10930	25 %	25 %	50 %	0 %	296100294
37	NC_014133	CCCA	2	8	11122	11129	25 %	0 %	0 %	75 %	296100294
38	NC_014133	AGCA	2	8	12967	12974	50 %	0 %	25 %	25 %	296100296
39	NC_014133	GAAA	2	8	13053	13060	75 %	0 %	25 %	0 %	296100296
40	NC_014133	CTCA	2	8	13210	13217	25 %	25 %	0 %	50 %	296100296
41	NC_014133	ATTA	2	8	13329	13336	50 %	50 %	0 %	0 %	296100296
42	NC_014133	ATTC	2	8	13521	13528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014133	TGAA	2	8	13930	13937	50 %	25 %	25 %	0 %	296100297
44	NC_014133	CATC	2	8	13978	13985	25 %	25 %	0 %	50 %	296100297
45	NC_014133	TTTA	2	8	14071	14078	25 %	75 %	0 %	0 %	296100297
46	NC_014133	CTTT	2	8	14098	14105	0 %	75 %	0 %	25 %	296100297
47	NC_014133	TAAT	2	8	14302	14309	50 %	50 %	0 %	0 %	296100297
48	NC_014133	ACAA	2	8	14938	14945	75 %	0 %	0 %	25 %	296100297
49	NC_014133	ACAA	2	8	15121	15128	75 %	0 %	0 %	25 %	296100298
50	NC_014133	CAAA	2	8	15136	15143	75 %	0 %	0 %	25 %	296100298
51	NC_014133	ACAA	2	8	15211	15218	75 %	0 %	0 %	25 %	296100298
52	NC_014133	ACAA	2	8	15245	15252	75 %	0 %	0 %	25 %	296100298
53	NC_014133	ACAA	2	8	15428	15435	75 %	0 %	0 %	25 %	296100298
54	NC_014133	ACAA	2	8	15524	15531	75 %	0 %	0 %	25 %	296100298
55	NC_014133	TGGC	2	8	16268	16275	0 %	25 %	50 %	25 %	296100299
56	NC_014133	ATTT	2	8	16728	16735	25 %	75 %	0 %	0 %	296100299
57	NC_014133	AAGC	2	8	17241	17248	50 %	0 %	25 %	25 %	296100299
58	NC_014133	AAGC	2	8	17364	17371	50 %	0 %	25 %	25 %	296100299
59	NC_014133	CGAT	2	8	17501	17508	25 %	25 %	25 %	25 %	296100299
60	NC_014133	TGAA	2	8	18088	18095	50 %	25 %	25 %	0 %	296100299
61	NC_014133	CAAG	2	8	18110	18117	50 %	0 %	25 %	25 %	296100299
62	NC_014133	AGTC	2	8	18352	18359	25 %	25 %	25 %	25 %	296100299
63	NC_014133	AGCT	2	8	18547	18554	25 %	25 %	25 %	25 %	296100299
64	NC_014133	TTGA	2	8	19089	19096	25 %	50 %	25 %	0 %	296100300
65	NC_014133	ATAG	2	8	20533	20540	50 %	25 %	25 %	0 %	296100301
66	NC_014133	TACG	2	8	20561	20568	25 %	25 %	25 %	25 %	296100301
67	NC_014133	ATAG	2	8	21118	21125	50 %	25 %	25 %	0 %	296100301
68	NC_014133	TACG	2	8	21146	21153	25 %	25 %	25 %	25 %	296100301
69	NC_014133	TGTT	2	8	21377	21384	0 %	75 %	25 %	0 %	296100301
70	NC_014133	AATT	2	8	21684	21691	50 %	50 %	0 %	0 %	296100302

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.