MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4719

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014133	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100282
2	NC_014133	CTA	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
3	NC_014133	TTG	2	6	592	597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100282
4	NC_014133	CAT	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
5	NC_014133	CTA	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
6	NC_014133	ACA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100282
7	NC_014133	ATC	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100283
8	NC_014133	TTG	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100283
9	NC_014133	AGC	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100283
10	NC_014133	ATC	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100284
11	NC_014133	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100284
12	NC_014133	GAA	2	6	1621	1626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100285
13	NC_014133	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100285
14	NC_014133	ATG	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100285
15	NC_014133	GAC	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100285
16	NC_014133	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100285
17	NC_014133	GTT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100285
18	NC_014133	GAA	2	6	2019	2024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100285
19	NC_014133	TAA	2	6	2262	2267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100285
20	NC_014133	GAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100286
21	NC_014133	ACC	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100286
22	NC_014133	GTT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100286
23	NC_014133	ATA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100286
24	NC_014133	AAG	2	6	3626	3631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100286
25	NC_014133	TGC	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100287
26	NC_014133	GAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
27	NC_014133	TGA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100287
28	NC_014133	TGA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100287
29	NC_014133	GAA	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
30	NC_014133	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
31	NC_014133	CAG	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100287
32	NC_014133	ATT	2	6	4326	4331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100288
33	NC_014133	ACA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100288
34	NC_014133	ATG	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
35	NC_014133	GTG	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100289
36	NC_014133	AAC	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
37	NC_014133	CAG	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
38	NC_014133	ATG	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
39	NC_014133	AGT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
40	NC_014133	TGG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100289
41	NC_014133	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296100289
42	NC_014133	CAG	3	9	5737	5745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
43	NC_014133	AGC	2	6	5750	5755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
44	NC_014133	GCG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
45	NC_014133	GCA	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
46	NC_014133	AGC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
47	NC_014133	GGC	2	6	5810	5815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
48	NC_014133	AGC	3	9	5825	5833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
49	NC_014133	GGC	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
50	NC_014133	AGC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
51	NC_014133	GCG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
52	NC_014133	AGC	3	9	5885	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
53	NC_014133	AGC	2	6	5900	5905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
54	NC_014133	GCG	2	6	5919	5924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
55	NC_014133	GCA	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
56	NC_014133	AGC	3	9	5945	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
57	NC_014133	GGC	2	6	5960	5965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
58	NC_014133	AGC	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
59	NC_014133	AAG	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100289
60	NC_014133	ACA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
61	NC_014133	GAT	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
62	NC_014133	ATG	2	6	6087	6092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
63	NC_014133	CAA	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
64	NC_014133	GTT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100289
65	NC_014133	CAA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
66	NC_014133	ACG	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
67	NC_014133	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
68	NC_014133	CTA	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100289
69	NC_014133	CTA	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100289
70	NC_014133	CAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100289
71	NC_014133	AAG	2	6	6597	6602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100289
72	NC_014133	CGA	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100290
73	NC_014133	GTC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100290
74	NC_014133	ATT	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100290
75	NC_014133	TAT	2	6	7010	7015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100290
76	NC_014133	CGT	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100290
77	NC_014133	TCA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
78	NC_014133	CAT	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
79	NC_014133	TCA	3	9	7178	7186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
80	NC_014133	AGT	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100290
81	NC_014133	ACT	2	6	7235	7240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
82	NC_014133	CAA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100290
83	NC_014133	TTG	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100290
84	NC_014133	ATT	2	6	7724	7729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100291
85	NC_014133	TTG	2	6	7810	7815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
86	NC_014133	TCA	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100291
87	NC_014133	ATC	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100291
88	NC_014133	AAC	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100291
89	NC_014133	TGA	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
90	NC_014133	TGA	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
91	NC_014133	TGT	2	6	8318	8323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
92	NC_014133	ATT	2	6	8325	8330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100291
93	NC_014133	GCA	2	6	8421	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100291
94	NC_014133	GTT	2	6	8433	8438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
95	NC_014133	TGA	2	6	8465	8470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
96	NC_014133	AAG	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100291
97	NC_014133	GTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
98	NC_014133	GCA	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100291
99	NC_014133	TGA	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100292
100	NC_014133	TAT	2	6	8652	8657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
101	NC_014133	TAT	2	6	8720	8725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
102	NC_014133	ACT	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100292
103	NC_014133	TAT	3	9	8804	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
104	NC_014133	TGT	2	6	8908	8913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100292
105	NC_014133	TGA	2	6	9100	9105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100292
106	NC_014133	AGC	2	6	9131	9136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100292
107	NC_014133	TGA	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100292
108	NC_014133	TGT	2	6	9268	9273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100292
109	NC_014133	TAA	2	6	9393	9398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100292
110	NC_014133	TAA	2	6	9937	9942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
111	NC_014133	AAT	2	6	9968	9973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
112	NC_014133	TGG	2	6	9998	10003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100293
113	NC_014133	AAG	2	6	10129	10134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100293
114	NC_014133	AAT	2	6	10260	10265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
115	NC_014133	AAT	2	6	10476	10481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
116	NC_014133	GAG	2	6	10529	10534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100293
117	NC_014133	CAT	2	6	10641	10646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100293
118	NC_014133	ATT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100293
119	NC_014133	TGG	2	6	10664	10669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100293
120	NC_014133	AGA	2	6	10670	10675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100293
121	NC_014133	TTA	2	6	10758	10763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100293
122	NC_014133	CAA	2	6	10794	10799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100294
123	NC_014133	CAA	2	6	11046	11051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100294
124	NC_014133	ACA	2	6	11260	11265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100294
125	NC_014133	ATA	2	6	11520	11525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100295
126	NC_014133	CAA	2	6	11559	11564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100295
127	NC_014133	ATA	2	6	11586	11591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100295
128	NC_014133	TAA	2	6	11629	11634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100295
129	NC_014133	GAC	2	6	12346	12351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100296
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133	NC_014133	TGA	2	6	12549	12554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100296
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245	NC_014133	TAA	2	6	21908	21913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100302

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.