MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4704

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014132	GAAA	2	8	1232	1239	75 %	0 %	25 %	0 %	296100147
2	NC_014132	AATC	2	8	1511	1518	50 %	25 %	0 %	25 %	296100147
3	NC_014132	TGAA	2	8	2104	2111	50 %	25 %	25 %	0 %	296100148
4	NC_014132	TTTA	2	8	2245	2252	25 %	75 %	0 %	0 %	296100148
5	NC_014132	CAAG	2	8	2255	2262	50 %	0 %	25 %	25 %	296100148
6	NC_014132	AATC	2	8	2477	2484	50 %	25 %	0 %	25 %	296100148
7	NC_014132	GTGA	2	8	2688	2695	25 %	25 %	50 %	0 %	296100148
8	NC_014132	AAAC	2	8	3505	3512	75 %	0 %	0 %	25 %	296100149
9	NC_014132	TGAT	2	8	3723	3730	25 %	50 %	25 %	0 %	296100149
10	NC_014132	CTGG	2	8	4419	4426	0 %	25 %	50 %	25 %	296100150
11	NC_014132	AATA	2	8	4621	4628	75 %	25 %	0 %	0 %	296100150
12	NC_014132	CCCT	2	8	4922	4929	0 %	25 %	0 %	75 %	296100150
13	NC_014132	TGAT	2	8	5271	5278	25 %	50 %	25 %	0 %	296100150
14	NC_014132	AAAG	2	8	5667	5674	75 %	0 %	25 %	0 %	296100151
15	NC_014132	GAAT	2	8	6171	6178	50 %	25 %	25 %	0 %	296100151
16	NC_014132	GATT	2	8	6375	6382	25 %	50 %	25 %	0 %	296100151
17	NC_014132	CAAA	2	8	6605	6612	75 %	0 %	0 %	25 %	296100151
18	NC_014132	AATT	2	8	7022	7029	50 %	50 %	0 %	0 %	296100151
19	NC_014132	CTAC	2	8	7366	7373	25 %	25 %	0 %	50 %	296100151
20	NC_014132	ATGA	2	8	7435	7442	50 %	25 %	25 %	0 %	296100151
21	NC_014132	AGTT	2	8	9008	9015	25 %	50 %	25 %	0 %	296100152
22	NC_014132	GAAA	2	8	9509	9516	75 %	0 %	25 %	0 %	296100153
23	NC_014132	TTCT	2	8	10767	10774	0 %	75 %	0 %	25 %	296100155
24	NC_014132	TCAT	2	8	10865	10872	25 %	50 %	0 %	25 %	296100155
25	NC_014132	AGAT	2	8	10931	10938	50 %	25 %	25 %	0 %	296100155
26	NC_014132	TAAC	2	8	11129	11136	50 %	25 %	0 %	25 %	296100155
27	NC_014132	TTGC	2	8	11342	11349	0 %	50 %	25 %	25 %	296100156
28	NC_014132	AAAT	2	8	12100	12107	75 %	25 %	0 %	0 %	296100157
29	NC_014132	GAAA	2	8	12196	12203	75 %	0 %	25 %	0 %	296100158
30	NC_014132	GTAT	2	8	12412	12419	25 %	50 %	25 %	0 %	296100158
31	NC_014132	TACT	2	8	12571	12578	25 %	50 %	0 %	25 %	296100158
32	NC_014132	CTTA	2	8	13082	13089	25 %	50 %	0 %	25 %	296100158
33	NC_014132	CACG	2	8	13263	13270	25 %	0 %	25 %	50 %	296100158
34	NC_014132	GAAA	2	8	13394	13401	75 %	0 %	25 %	0 %	296100158
35	NC_014132	GTGA	2	8	13812	13819	25 %	25 %	50 %	0 %	296100159
36	NC_014132	ATTA	2	8	14082	14089	50 %	50 %	0 %	0 %	296100159
37	NC_014132	CCTT	2	8	14973	14980	0 %	50 %	0 %	50 %	296100160
38	NC_014132	TTAA	2	8	15390	15397	50 %	50 %	0 %	0 %	296100160
39	NC_014132	TGGG	2	8	16672	16679	0 %	25 %	75 %	0 %	296100161
40	NC_014132	TTCT	2	8	16754	16761	0 %	75 %	0 %	25 %	296100161
41	NC_014132	TAAA	2	8	16766	16773	75 %	25 %	0 %	0 %	296100161
42	NC_014132	CTTT	2	8	16895	16902	0 %	75 %	0 %	25 %	296100161
43	NC_014132	TCAA	2	8	17469	17476	50 %	25 %	0 %	25 %	296100162
44	NC_014132	TGAG	2	8	18617	18624	25 %	25 %	50 %	0 %	296100163
45	NC_014132	GATG	2	8	18651	18658	25 %	25 %	50 %	0 %	296100163
46	NC_014132	ATGA	2	8	18826	18833	50 %	25 %	25 %	0 %	296100163
47	NC_014132	AAAG	2	8	18841	18848	75 %	0 %	25 %	0 %	296100163
48	NC_014132	GTTA	2	8	19177	19184	25 %	50 %	25 %	0 %	296100163
49	NC_014132	TTTA	2	8	19849	19856	25 %	75 %	0 %	0 %	296100164
50	NC_014132	ATTT	2	8	20242	20249	25 %	75 %	0 %	0 %	296100164
51	NC_014132	ATTC	2	8	20392	20399	25 %	50 %	0 %	25 %	296100164
52	NC_014132	TGGT	2	8	20650	20657	0 %	50 %	50 %	0 %	296100164
53	NC_014132	TTAT	2	8	20741	20748	25 %	75 %	0 %	0 %	296100164
54	NC_014132	TGGA	2	8	20946	20953	25 %	25 %	50 %	0 %	296100165
55	NC_014132	ATTG	2	8	21436	21443	25 %	50 %	25 %	0 %	296100165
56	NC_014132	GGTA	2	8	21612	21619	25 %	25 %	50 %	0 %	296100165
57	NC_014132	TTGG	2	8	21734	21741	0 %	50 %	50 %	0 %	296100165
58	NC_014132	CATT	2	8	22613	22620	25 %	50 %	0 %	25 %	296100166
59	NC_014132	ATTA	3	12	22798	22809	50 %	50 %	0 %	0 %	296100166
60	NC_014132	AATA	2	8	23007	23014	75 %	25 %	0 %	0 %	296100167

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.