MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4704

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014132	CCG	2	6	127	132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014132	ATA	2	6	150	155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014132	GAG	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014132	CAA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100147
5	NC_014132	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
6	NC_014132	GGT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100147
7	NC_014132	ATG	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
8	NC_014132	TGA	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
9	NC_014132	AAG	2	6	763	768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
10	NC_014132	ATG	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
11	NC_014132	TGC	2	6	829	834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100147
12	NC_014132	TGA	2	6	1031	1036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
13	NC_014132	GAA	2	6	1127	1132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
14	NC_014132	AGA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
15	NC_014132	GAA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
16	NC_014132	GAC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100147
17	NC_014132	TTA	2	6	1654	1659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014132	CAA	2	6	1707	1712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014132	TAT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014132	TAA	2	6	1981	1986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014132	CAA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014132	TAT	2	6	2066	2071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100148
23	NC_014132	GTT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100148
24	NC_014132	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100148
25	NC_014132	TAA	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100148
26	NC_014132	GAT	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
27	NC_014132	AAG	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
28	NC_014132	ATG	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
29	NC_014132	GAA	2	6	2614	2619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
30	NC_014132	AGA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
31	NC_014132	GCA	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100148
32	NC_014132	GAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
33	NC_014132	GAT	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
34	NC_014132	AAG	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
35	NC_014132	TTG	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100148
36	NC_014132	CAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100149
37	NC_014132	CAA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100149
38	NC_014132	ATG	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100149
39	NC_014132	TTA	2	6	3490	3495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100149
40	NC_014132	TCT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100149
41	NC_014132	CAA	2	6	3532	3537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100149
42	NC_014132	AGA	2	6	3567	3572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100149
43	NC_014132	CAG	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100149
44	NC_014132	GTG	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100149
45	NC_014132	ACA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
46	NC_014132	CAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
47	NC_014132	AGA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100150
48	NC_014132	TGA	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
49	NC_014132	GAT	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
50	NC_014132	CTG	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100150
51	NC_014132	TGA	2	6	4042	4047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
52	NC_014132	CTG	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100150
53	NC_014132	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
54	NC_014132	ATT	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
55	NC_014132	ATG	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
56	NC_014132	AAC	2	6	4283	4288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
57	NC_014132	CCA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100150
58	NC_014132	GAC	2	6	4369	4374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
59	NC_014132	CAG	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
60	NC_014132	TGA	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
61	NC_014132	ATG	3	9	4716	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
62	NC_014132	ATT	2	6	4873	4878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
63	NC_014132	TTA	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
64	NC_014132	ATA	2	6	4995	5000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100150
65	NC_014132	ATT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
66	NC_014132	GAT	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
67	NC_014132	ATT	2	6	5059	5064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
68	NC_014132	CTT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100150
69	NC_014132	ACA	2	6	5174	5179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
70	NC_014132	GGC	2	6	5318	5323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100150
71	NC_014132	ACG	2	6	5393	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
72	NC_014132	AGA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100150
73	NC_014132	TGT	2	6	5413	5418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100150
74	NC_014132	AGC	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
75	NC_014132	TAT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
76	NC_014132	ATT	2	6	5695	5700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100151
77	NC_014132	CGA	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100151
78	NC_014132	GTT	2	6	5880	5885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100151
79	NC_014132	TGT	2	6	5979	5984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100151
80	NC_014132	CAA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100151
81	NC_014132	CAA	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100151
82	NC_014132	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100151
83	NC_014132	TGA	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
84	NC_014132	CAT	2	6	6256	6261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100151
85	NC_014132	TAA	2	6	6339	6344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100151
86	NC_014132	AAT	2	6	6385	6390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100151
87	NC_014132	TGA	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
88	NC_014132	GCG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100151
89	NC_014132	TGG	2	6	6653	6658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100151
90	NC_014132	ATC	2	6	6717	6722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100151
91	NC_014132	TAT	2	6	6745	6750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100151
92	NC_014132	AGA	2	6	6885	6890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100151
93	NC_014132	GTG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100151
94	NC_014132	GAG	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100151
95	NC_014132	GAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
96	NC_014132	TGA	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
97	NC_014132	TTC	2	6	7501	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100151
98	NC_014132	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
99	NC_014132	TAA	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014132	CAA	2	6	8382	8387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014132	GAA	2	6	8405	8410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014132	GAA	2	6	8451	8456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100152
103	NC_014132	CGA	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100152
104	NC_014132	ATT	2	6	8643	8648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100152
105	NC_014132	AAG	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100152
106	NC_014132	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100152
107	NC_014132	GCA	2	6	8844	8849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100152
108	NC_014132	ATT	2	6	8928	8933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100152
109	NC_014132	ATT	2	6	9129	9134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014132	CTA	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014132	AAT	2	6	9224	9229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014132	AAT	2	6	9259	9264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014132	TGC	2	6	9378	9383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014132	GAA	2	6	9390	9395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014132	AAC	2	6	9436	9441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014132	TCC	2	6	9560	9565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296100153
117	NC_014132	ATT	2	6	9585	9590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100153
118	NC_014132	AAC	2	6	9592	9597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100153
119	NC_014132	AGT	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100153
120	NC_014132	AAC	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100154
121	NC_014132	GAA	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100154
122	NC_014132	CTT	2	6	9891	9896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100154
123	NC_014132	TCA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100154
124	NC_014132	TGA	2	6	9982	9987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100154
125	NC_014132	AGA	2	6	10096	10101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100154
126	NC_014132	TAA	2	6	10203	10208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014132	ATT	2	6	10262	10267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014132	AAG	2	6	10275	10280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014132	GAC	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014132	TAA	2	6	10328	10333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014132	GTA	2	6	10369	10374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014132	TGG	2	6	10392	10397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100155
133	NC_014132	GCA	2	6	10417	10422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100155
134	NC_014132	TGG	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100155
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256	NC_014132	CTA	2	6	18339	18344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_014132	ATT	2	6	18452	18457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_014132	AAT	2	6	18528	18533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100163
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314	NC_014132	TTA	2	6	23163	23168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.