MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4701

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014131	AAAG	2	8	1167	1174	75 %	0 %	25 %	0 %	295987466
2	NC_014131	GTAC	2	8	1248	1255	25 %	25 %	25 %	25 %	295987466
3	NC_014131	ATTG	2	8	2142	2149	25 %	50 %	25 %	0 %	295987468
4	NC_014131	TGAA	2	8	2649	2656	50 %	25 %	25 %	0 %	295987469
5	NC_014131	ATTG	2	8	2674	2681	25 %	50 %	25 %	0 %	295987469
6	NC_014131	ACCA	2	8	3266	3273	50 %	0 %	0 %	50 %	295987470
7	NC_014131	TGAA	2	8	3462	3469	50 %	25 %	25 %	0 %	295987470
8	NC_014131	TGAC	2	8	4155	4162	25 %	25 %	25 %	25 %	295987471
9	NC_014131	GCTT	2	8	4183	4190	0 %	50 %	25 %	25 %	295987471
10	NC_014131	TTCT	2	8	4523	4530	0 %	75 %	0 %	25 %	295987472
11	NC_014131	GTTT	2	8	4577	4584	0 %	75 %	25 %	0 %	295987472
12	NC_014131	GAAA	2	8	5948	5955	75 %	0 %	25 %	0 %	295987473
13	NC_014131	CTCA	2	8	6105	6112	25 %	25 %	0 %	50 %	295987473
14	NC_014131	AATC	2	8	6227	6234	50 %	25 %	0 %	25 %	295987473
15	NC_014131	CTTA	2	8	7192	7199	25 %	50 %	0 %	25 %	295987474
16	NC_014131	AGTA	2	8	7257	7264	50 %	25 %	25 %	0 %	295987474
17	NC_014131	TGAA	2	8	8546	8553	50 %	25 %	25 %	0 %	295987476
18	NC_014131	ATTT	2	8	8696	8703	25 %	75 %	0 %	0 %	295987476
19	NC_014131	AAAT	2	8	9569	9576	75 %	25 %	0 %	0 %	295987476
20	NC_014131	TGAT	2	8	9599	9606	25 %	50 %	25 %	0 %	295987476
21	NC_014131	AGCT	2	8	10203	10210	25 %	25 %	25 %	25 %	295987476
22	NC_014131	CTAT	2	8	10665	10672	25 %	50 %	0 %	25 %	295987476
23	NC_014131	TCAA	2	8	10682	10689	50 %	25 %	0 %	25 %	295987476
24	NC_014131	TAAT	2	8	10895	10902	50 %	50 %	0 %	0 %	295987476
25	NC_014131	CATT	2	8	10908	10915	25 %	50 %	0 %	25 %	295987476
26	NC_014131	TTTA	2	8	11390	11397	25 %	75 %	0 %	0 %	295987476
27	NC_014131	AGAT	2	8	11481	11488	50 %	25 %	25 %	0 %	295987476
28	NC_014131	AGTA	2	8	11551	11558	50 %	25 %	25 %	0 %	295987476
29	NC_014131	AATT	2	8	11687	11694	50 %	50 %	0 %	0 %	295987476
30	NC_014131	TGGG	2	8	11818	11825	0 %	25 %	75 %	0 %	295987477
31	NC_014131	CTGC	2	8	11851	11858	0 %	25 %	25 %	50 %	295987477
32	NC_014131	GAAT	2	8	12351	12358	50 %	25 %	25 %	0 %	295987478
33	NC_014131	ATTT	2	8	12365	12372	25 %	75 %	0 %	0 %	295987478
34	NC_014131	TATT	2	8	12515	12522	25 %	75 %	0 %	0 %	295987478
35	NC_014131	AGGT	2	8	12918	12925	25 %	25 %	50 %	0 %	295987478
36	NC_014131	TTAA	2	8	12991	12998	50 %	50 %	0 %	0 %	295987478
37	NC_014131	ACAA	2	8	13057	13064	75 %	0 %	0 %	25 %	295987478
38	NC_014131	ATGA	2	8	13918	13925	50 %	25 %	25 %	0 %	295987478
39	NC_014131	AAAC	2	8	14554	14561	75 %	0 %	0 %	25 %	295987479
40	NC_014131	TTTA	2	8	14684	14691	25 %	75 %	0 %	0 %	295987479
41	NC_014131	GCGA	2	8	14726	14733	25 %	0 %	50 %	25 %	295987479
42	NC_014131	ATTA	2	8	14969	14976	50 %	50 %	0 %	0 %	295987479
43	NC_014131	CTAT	2	8	15106	15113	25 %	50 %	0 %	25 %	295987479
44	NC_014131	CAAC	2	8	15134	15141	50 %	0 %	0 %	50 %	295987479
45	NC_014131	ATGT	2	8	17012	17019	25 %	50 %	25 %	0 %	295987479
46	NC_014131	AGTT	2	8	18357	18364	25 %	50 %	25 %	0 %	295987481
47	NC_014131	ATAG	2	8	18689	18696	50 %	25 %	25 %	0 %	295987482
48	NC_014131	TAAA	2	8	18702	18709	75 %	25 %	0 %	0 %	295987482
49	NC_014131	ATTT	2	8	18998	19005	25 %	75 %	0 %	0 %	295987483
50	NC_014131	AATC	2	8	19431	19438	50 %	25 %	0 %	25 %	295987483
51	NC_014131	TTTA	2	8	19473	19480	25 %	75 %	0 %	0 %	295987483
52	NC_014131	GGAT	2	8	19539	19546	25 %	25 %	50 %	0 %	295987483
53	NC_014131	CCAA	2	8	19995	20002	50 %	0 %	0 %	50 %	295987484
54	NC_014131	AATA	2	8	20280	20287	75 %	25 %	0 %	0 %	295987484

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.