MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4701

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014131	TAT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014131	GCT	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014131	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014131	TAC	2	6	216	221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014131	TTA	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014131	TTG	2	6	338	343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014131	AAC	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014131	TTA	2	6	392	397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014131	GAA	3	9	468	476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014131	AGC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014131	TGA	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014131	CAT	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014131	ATA	2	6	890	895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014131	AGA	2	6	956	961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014131	AGT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014131	ATT	2	6	990	995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
17	NC_014131	TTA	3	9	1077	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
18	NC_014131	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987466
19	NC_014131	ATC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987466
20	NC_014131	AAG	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987466
21	NC_014131	ATA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
22	NC_014131	ATA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
23	NC_014131	TAG	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987466
24	NC_014131	GAA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
25	NC_014131	ATG	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987467
26	NC_014131	AGA	2	6	1805	1810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
27	NC_014131	ATA	2	6	1852	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
28	NC_014131	AAT	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
29	NC_014131	TGA	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
30	NC_014131	AGT	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
31	NC_014131	ATA	2	6	2336	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
32	NC_014131	AGA	2	6	2376	2381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987468
33	NC_014131	AAT	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
34	NC_014131	AAT	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
35	NC_014131	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987469
36	NC_014131	AAT	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
37	NC_014131	TGA	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
38	NC_014131	GAT	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
39	NC_014131	ACA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987469
40	NC_014131	TGA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014131	GCT	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987470
42	NC_014131	TCT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987470
43	NC_014131	TTG	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987470
44	NC_014131	AGC	2	6	3819	3824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987470
45	NC_014131	TCC	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295987471
46	NC_014131	CTT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987471
47	NC_014131	CTA	2	6	4414	4419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014131	AAC	2	6	4599	4604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987472
49	NC_014131	AAT	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014131	TAT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014131	ATT	2	6	4728	4733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014131	CCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014131	ATA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014131	AGG	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014131	GAG	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014131	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
57	NC_014131	CGT	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
58	NC_014131	TGA	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987473
59	NC_014131	AAG	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
60	NC_014131	TGC	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
61	NC_014131	GAA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
62	NC_014131	AGA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
63	NC_014131	GAA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
64	NC_014131	GAC	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987473
65	NC_014131	TCA	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014131	TAA	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014131	CAC	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014131	TAT	2	6	6512	6517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014131	TAT	2	6	6572	6577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014131	CAA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014131	GTC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987474
72	NC_014131	ATA	2	6	6859	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
73	NC_014131	AAT	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
74	NC_014131	GAC	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987474
75	NC_014131	GAA	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987474
76	NC_014131	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987474
77	NC_014131	GAT	2	6	7572	7577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987474
78	NC_014131	GAT	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987474
79	NC_014131	AAG	2	6	7627	7632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987474
80	NC_014131	TTG	2	6	7701	7706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987474
81	NC_014131	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987475
82	NC_014131	TAG	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987475
83	NC_014131	AAC	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
84	NC_014131	CAA	3	9	8317	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
85	NC_014131	AGA	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
86	NC_014131	AAC	2	6	8394	8399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
87	NC_014131	AGA	2	6	8400	8405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
88	NC_014131	TAA	2	6	8406	8411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987475
89	NC_014131	AGA	2	6	8421	8426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
90	NC_014131	TGG	2	6	8473	8478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295987475
91	NC_014131	CTG	2	6	8514	8519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014131	ATA	2	6	8522	8527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
93	NC_014131	GAA	2	6	8529	8534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
94	NC_014131	AAG	2	6	8831	8836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
95	NC_014131	TGA	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
96	NC_014131	ACA	2	6	8959	8964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987476
97	NC_014131	ATA	2	6	9002	9007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
98	NC_014131	AAT	2	6	9067	9072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
99	NC_014131	TGA	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
100	NC_014131	ATA	2	6	9110	9115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
101	NC_014131	TAA	2	6	9399	9404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
102	NC_014131	AAT	2	6	9448	9453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
103	NC_014131	AAT	2	6	9460	9465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
104	NC_014131	ATG	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
105	NC_014131	AAG	2	6	9646	9651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
106	NC_014131	ATG	2	6	9653	9658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
107	NC_014131	ATT	2	6	9694	9699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
108	NC_014131	ACA	2	6	9910	9915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987476
109	NC_014131	GCT	2	6	9921	9926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987476
110	NC_014131	CAA	2	6	10053	10058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987476
111	NC_014131	TGA	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
112	NC_014131	CAT	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987476
113	NC_014131	GAT	2	6	10390	10395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
114	NC_014131	ATT	2	6	10506	10511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
115	NC_014131	ATG	2	6	10541	10546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
116	NC_014131	TAA	2	6	10605	10610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
117	NC_014131	ATT	3	9	10618	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
118	NC_014131	CTA	2	6	10733	10738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987476
119	NC_014131	ATT	2	6	10779	10784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
120	NC_014131	TCA	2	6	10838	10843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987476
121	NC_014131	TAT	2	6	10929	10934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
122	NC_014131	ATG	2	6	10973	10978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
123	NC_014131	ATA	2	6	11099	11104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
124	NC_014131	AGT	2	6	11157	11162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
125	NC_014131	ATA	2	6	11303	11308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
126	NC_014131	AAT	2	6	11347	11352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
127	NC_014131	AGT	2	6	11421	11426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
128	NC_014131	ACG	2	6	11632	11637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987476
129	NC_014131	CAC	2	6	11643	11648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295987476
130	NC_014131	TAG	2	6	11726	11731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987477
131	NC_014131	ATT	2	6	11761	11766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987477
132	NC_014131	TTA	2	6	11918	11923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987477
133	NC_014131	CAT	2	6	11982	11987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987477
134	NC_014131	TAT	2	6	11989	11994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987477
135	NC_014131	TGA	2	6	12054	12059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987477
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248	NC_014131	ATT	2	6	20570	20575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_014131	CAA	2	6	20826	20831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_014131	GAA	2	6	20849	20854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014131	TGA	2	6	20914	20919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_014131	TGA	2	6	21010	21015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.