MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila 2300/99 Alcoy chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014125	AATGCA	2	12	3807	3818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014125	TCGAAT	2	12	10653	10664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014125	TCCGTG	2	12	30002	30013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014125	GTTTAT	2	12	31260	31271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014125	ATTCAT	2	12	84067	84078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014125	CTTATT	2	12	99991	100002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014125	AGTTTT	2	12	133954	133965	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014125	TTAATA	2	12	143855	143866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014125	TTGCTT	2	12	228442	228453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014125	TGGAAA	2	12	231100	231111	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014125	TCAACA	2	12	240481	240492	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014125	TAATTT	2	12	253905	253916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014125	TTATTT	2	12	268877	268888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014125	ATTTTC	2	12	303002	303013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014125	ATAATT	2	12	322192	322203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014125	TGGATG	2	12	377565	377576	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014125	CATTTG	2	12	410936	410947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014125	TGAAAT	2	12	412806	412817	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014125	ATTTAA	2	12	416794	416805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014125	TCTTAT	2	12	462408	462419	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014125	CTTGGT	2	12	558888	558899	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014125	GATTAA	2	12	560057	560068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014125	TTAAAT	2	12	561183	561194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014125	TAAAAT	2	12	575456	575467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014125	TAATTA	5	30	630445	630474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014125	AGGGCA	2	12	664040	664051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014125	AATCAA	2	12	672361	672372	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014125	TTTAAA	2	12	678063	678074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014125	CATTTG	2	12	692533	692544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014125	TGAAAT	2	12	694403	694414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014125	TAAAAT	2	12	704480	704491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014125	ATTTAT	2	12	707517	707528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014125	TGGTTT	2	12	791152	791163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014125	AAATGG	2	12	956774	956785	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014125	TTTTTA	2	12	995163	995174	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014125	AATAAC	2	12	998184	998195	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014125	TCCTGT	2	12	1005919	1005930	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014125	GCCTGA	2	12	1006188	1006199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014125	AAAGAG	2	12	1078556	1078567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014125	TTTCGT	2	12	1095659	1095670	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014125	AAGTGC	2	12	1096902	1096913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014125	GAAATG	2	12	1097053	1097064	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014125	TTTTAT	2	12	1120408	1120419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014125	TTAAAA	2	12	1151134	1151145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014125	TAAATT	2	12	1177461	1177472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014125	ATGCAA	2	12	1214295	1214306	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014125	GTTCTT	2	12	1247845	1247856	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014125	TATTCT	2	12	1288136	1288147	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014125	ATTAAC	2	12	1299793	1299804	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014125	TTACTG	2	12	1301419	1301430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014125	CTGACC	2	12	1317065	1317076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014125	TGTTTT	2	12	1355466	1355477	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014125	AATTTT	2	12	1413094	1413105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014125	TTTTAT	2	12	1457556	1457567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014125	GACTTT	2	12	1478987	1478998	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014125	AAATAG	2	12	1507440	1507451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014125	AATGAT	2	12	1529121	1529132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014125	ATCATT	2	12	1530327	1530338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014125	AAATTG	2	12	1539768	1539779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014125	TAAAAA	2	12	1568390	1568401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014125	TTAAAA	2	12	1572624	1572635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014125	TAAAAA	2	12	1576554	1576565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014125	TTTTTA	2	12	1580353	1580364	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014125	AGTTTT	2	12	1587791	1587802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014125	CAGTAC	2	12	1599479	1599490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014125	AATCAT	2	12	1600619	1600630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014125	GATATT	2	12	1718342	1718353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014125	AAAATT	2	12	1757201	1757212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014125	TATTTT	2	12	1814879	1814890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014125	CGATAA	2	12	1843667	1843678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014125	GCGCTG	2	12	1844733	1844744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014125	AGTCAT	2	12	1846287	1846298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014125	AGTTAA	2	12	1894108	1894119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014125	AAAAAT	2	12	1904516	1904527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014125	AGACTT	2	12	1922017	1922028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014125	ATCAAC	2	12	1937476	1937487	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014125	AACCTC	2	12	1993299	1993310	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014125	AAAAAT	2	12	2106419	2106430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014125	TCAAAA	2	12	2143283	2143294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014125	CTTTTT	2	12	2148232	2148243	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014125	ATTTAG	2	12	2151882	2151893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014125	ACTTTT	2	12	2172307	2172318	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014125	TGTTAT	2	12	2188353	2188364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014125	TATAAT	2	12	2196946	2196957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014125	TTAAAT	2	12	2210310	2210321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014125	TCTGTA	2	12	2284263	2284274	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014125	TGACAA	2	12	2288466	2288477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014125	CTGAAT	2	12	2304667	2304678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014125	TTGCAT	2	12	2309081	2309092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014125	AAATTA	2	12	2315979	2315990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014125	ACAAAA	2	12	2316600	2316611	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014125	AATTAT	2	12	2331945	2331956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014125	TGTAAT	2	12	2333131	2333142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014125	AGTTAT	2	12	2366906	2366917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014125	TTTTTA	2	12	2404374	2404385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014125	TAAATA	2	12	2442697	2442708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014125	AATTTA	2	12	2467840	2467851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014125	ACTTTG	2	12	2509927	2509938	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014125	TATTAA	2	12	2524643	2524654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014125	ATTTTA	2	12	2588488	2588499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014125	TCAAAG	2	12	2622896	2622907	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014125	ATTTTT	2	12	2626695	2626706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014125	CGCTGG	2	12	2673955	2673966	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014125	TAAAAA	2	12	2686928	2686939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014125	GCGGGA	2	12	2692375	2692386	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014125	TTTATT	2	12	2762413	2762424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014125	AAAGAA	2	12	2824622	2824633	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014125	TTAGTC	2	12	2854208	2854219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014125	CATAAA	2	12	2908601	2908612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014125	ACCTTG	2	12	2932155	2932166	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014125	TGAATT	2	12	2960434	2960445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014125	TTGATT	2	12	2961019	2961030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014125	GACAGG	2	12	2962112	2962123	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014125	AGAAAC	2	12	3000724	3000735	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014125	TATTTG	2	12	3106234	3106245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014125	ATCAAG	2	12	3134714	3134725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014125	AAAATC	2	12	3157996	3158007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014125	TTCTGA	2	12	3166823	3166834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014125	ATAAAA	2	12	3175333	3175344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014125	TCCTTA	2	12	3198752	3198763	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014125	ATTTCA	2	12	3212275	3212286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014125	CAAATG	2	12	3214145	3214156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014125	TTATTT	2	12	3254988	3254999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014125	TCATTT	2	12	3288783	3288794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014125	CAAGGT	2	12	3307854	3307865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014125	CTTATT	2	12	3334184	3334195	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014125	CAAGGT	2	12	3369041	3369052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014125	ACATCC	2	12	3382864	3382875	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014125	CCAAGC	2	12	3385837	3385848	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014125	TATGAA	2	12	3385861	3385872	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014125	TATACC	2	12	3386871	3386882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014125	AATTAT	2	12	3394682	3394693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014125	ATTATA	2	12	3401760	3401771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014125	CTATTT	2	12	3407028	3407039	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_014125	TTTAAA	2	12	3407709	3407720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014125	TAAAAA	2	12	3431219	3431230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014125	GCTCTT	2	12	3439529	3439540	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014125	TACTGA	2	12	3441554	3441565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_014125	CTTATT	2	12	3478019	3478030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014125	CTTTTC	2	12	3516314	3516325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.