MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014122	TAAAAT	2	12	2973	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014122	CCTTTT	2	12	15244	15255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014122	ATTTAA	2	12	26887	26898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014122	GTTTTT	2	12	40935	40946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014122	TAAAAA	2	12	105756	105767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014122	CATATA	2	12	105887	105898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014122	GGTTTT	2	12	109704	109715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014122	GCTAAC	2	12	161754	161765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014122	TTATAA	2	12	175629	175640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014122	AAAATT	2	12	175818	175829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014122	TATAAT	2	12	193358	193369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014122	TAAAAT	2	12	204270	204281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014122	TTAAAG	2	12	224099	224110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014122	ATTTTT	2	12	251446	251457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014122	AAAAAT	2	12	282601	282612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014122	AATAGA	2	12	283759	283770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014122	TTTATT	2	12	286555	286566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014122	TTTAAA	2	12	308969	308980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014122	ATTTTT	2	12	325484	325495	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014122	TAAAAA	2	12	377717	377728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014122	ATATTT	2	12	400188	400199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014122	ATTAAC	2	12	414500	414511	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014122	TATTTT	2	12	422056	422067	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014122	AATGAA	2	12	531883	531894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014122	ATGAAG	2	12	534827	534838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014122	AAGAAA	2	12	563645	563656	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014122	TATTTG	2	12	599059	599070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014122	ATTTTT	2	12	604594	604605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014122	AAATAT	2	12	620615	620626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014122	TTAATG	2	12	644616	644627	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014122	ATTAAA	2	12	658881	658892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014122	TAAATT	2	12	658896	658907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014122	TACTAT	2	12	686156	686167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014122	AAAAGA	2	12	689849	689860	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014122	TTAAAT	2	12	693334	693345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014122	TAAAAT	2	12	696116	696127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014122	AAAAAC	2	12	716709	716720	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014122	TTTTTA	2	12	722484	722495	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014122	AAAATT	2	12	781141	781152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014122	TATCCA	2	12	821138	821149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014122	AAAAAC	2	12	827143	827154	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014122	GTTTTT	2	12	834359	834370	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014122	AAAAAT	2	12	879845	879856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014122	GGTTTT	2	12	881555	881566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014122	AGTAAA	2	12	885833	885844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014122	AAAAAG	2	12	982297	982308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014122	TATCCA	2	12	982799	982810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014122	AAAATT	2	12	983718	983729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014122	ATCAAT	2	12	1039100	1039111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014122	TTTAGT	2	12	1058922	1058933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014122	TAAAAT	2	12	1132107	1132118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014122	TTATAT	2	12	1132361	1132372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014122	AATTAT	2	12	1132392	1132403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014122	ATGGAT	2	12	1135082	1135093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014122	CCGGGA	2	12	1155603	1155614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014122	ATAGTT	2	12	1177686	1177697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014122	CTTTTT	2	12	1181971	1181982	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014122	AATTTT	2	12	1183525	1183536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014122	ATTTTT	2	12	1184811	1184822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014122	ATGATA	2	12	1247296	1247307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014122	AAAATT	2	12	1248516	1248527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014122	ACAAAA	2	12	1270269	1270280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014122	TCTACC	2	12	1275889	1275900	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014122	ATAATT	2	12	1275931	1275942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014122	AAAATT	2	12	1276673	1276684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014122	GTTTTT	2	12	1295393	1295404	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014122	ATTTAA	2	12	1298607	1298618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014122	ATATTA	2	12	1314677	1314688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014122	ATGGAT	2	12	1318537	1318548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014122	TATCCA	2	12	1320421	1320432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014122	AATTTT	2	12	1321177	1321188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014122	AAATCT	2	12	1325117	1325128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014122	TATATT	2	12	1326482	1326493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.