MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 1240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014122	CTCAT	2	10	1434	1443	20 %	40 %	0 %	40 %	296108690
2	NC_014122	AAACA	2	10	1490	1499	80 %	0 %	0 %	20 %	296108690
3	NC_014122	AGGTT	2	10	3465	3474	20 %	40 %	40 %	0 %	296108691
4	NC_014122	ATTTT	2	10	4671	4680	20 %	80 %	0 %	0 %	296108692
5	NC_014122	TTATA	2	10	4696	4705	40 %	60 %	0 %	0 %	296108692
6	NC_014122	AATTA	2	10	4901	4910	60 %	40 %	0 %	0 %	296108693
7	NC_014122	TAATC	2	10	5594	5603	40 %	40 %	0 %	20 %	296108693
8	NC_014122	GTTAA	2	10	5797	5806	40 %	40 %	20 %	0 %	296108694
9	NC_014122	TAATA	2	10	7867	7876	60 %	40 %	0 %	0 %	296108698
10	NC_014122	GGAGA	2	10	8009	8018	40 %	0 %	60 %	0 %	296108698
11	NC_014122	AAGAT	2	10	9801	9810	60 %	20 %	20 %	0 %	296108700
12	NC_014122	GGTTA	2	10	14015	14024	20 %	40 %	40 %	0 %	296108704
13	NC_014122	GAGAT	2	10	15505	15514	40 %	20 %	40 %	0 %	296108707
14	NC_014122	TTATT	2	10	17787	17796	20 %	80 %	0 %	0 %	296108709
15	NC_014122	CTCAT	2	10	18473	18482	20 %	40 %	0 %	40 %	296108710
16	NC_014122	AAATT	2	10	18986	18995	60 %	40 %	0 %	0 %	296108711
17	NC_014122	AGAAA	2	10	23555	23564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014122	AAAGA	2	10	23869	23878	80 %	0 %	20 %	0 %	296108715
19	NC_014122	GCTAA	2	10	25344	25353	40 %	20 %	20 %	20 %	296108716
20	NC_014122	TAAAT	2	10	27598	27607	60 %	40 %	0 %	0 %	296108718
21	NC_014122	GTAAT	2	10	29031	29040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014122	TAAAA	2	10	29594	29603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014122	CCCTT	2	10	31013	31022	0 %	40 %	0 %	60 %	296108721
24	NC_014122	TTATC	2	10	31779	31788	20 %	60 %	0 %	20 %	296108722
25	NC_014122	ACAAT	2	10	32176	32185	60 %	20 %	0 %	20 %	296108723
26	NC_014122	CCCCT	2	10	32438	32447	0 %	20 %	0 %	80 %	296108724
27	NC_014122	CTTCT	2	10	33258	33267	0 %	60 %	0 %	40 %	296108724
28	NC_014122	AACTT	2	10	37410	37419	40 %	40 %	0 %	20 %	296108730
29	NC_014122	AAAGG	2	10	37454	37463	60 %	0 %	40 %	0 %	296108730
30	NC_014122	AAGAG	2	10	37804	37813	60 %	0 %	40 %	0 %	296108730
31	NC_014122	ATTTT	2	10	40359	40368	20 %	80 %	0 %	0 %	296108731
32	NC_014122	GTTTT	2	10	41091	41100	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014122	ATTTT	2	10	41136	41145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014122	AACCT	2	10	41204	41213	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014122	ATTTT	2	10	41384	41393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014122	AAAAT	2	10	41466	41475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014122	ATTAT	2	10	42302	42311	40 %	60 %	0 %	0 %	296108733
38	NC_014122	GTTAG	2	10	42346	42355	20 %	40 %	40 %	0 %	296108733
39	NC_014122	TTCTT	2	10	44877	44886	0 %	80 %	0 %	20 %	296108736
40	NC_014122	TCCAT	2	10	46090	46099	20 %	40 %	0 %	40 %	296108737
41	NC_014122	AAATT	2	10	46756	46765	60 %	40 %	0 %	0 %	296108739
42	NC_014122	TTTTA	2	10	48753	48762	20 %	80 %	0 %	0 %	296108740
43	NC_014122	TTATC	2	10	50828	50837	20 %	60 %	0 %	20 %	296108743
44	NC_014122	AGTTA	2	10	53897	53906	40 %	40 %	20 %	0 %	296108746
45	NC_014122	GGATT	2	10	54145	54154	20 %	40 %	40 %	0 %	296108746
46	NC_014122	CATCT	2	10	54233	54242	20 %	40 %	0 %	40 %	296108746
47	NC_014122	AGAAT	2	10	54441	54450	60 %	20 %	20 %	0 %	296108747
48	NC_014122	ATAAG	2	10	55620	55629	60 %	20 %	20 %	0 %	296108748
49	NC_014122	AGAGG	2	10	63327	63336	40 %	0 %	60 %	0 %	296108755
50	NC_014122	TCTCT	2	10	64191	64200	0 %	60 %	0 %	40 %	296108756
51	NC_014122	TTATC	2	10	64643	64652	20 %	60 %	0 %	20 %	296108757
52	NC_014122	ATATT	2	10	65522	65531	40 %	60 %	0 %	0 %	296108758
53	NC_014122	GATAG	2	10	66799	66808	40 %	20 %	40 %	0 %	296108760
54	NC_014122	GAAAG	2	10	68051	68060	60 %	0 %	40 %	0 %	296108762
55	NC_014122	ATTTA	2	10	70826	70835	40 %	60 %	0 %	0 %	296108765
56	NC_014122	AAAAT	2	10	71301	71310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014122	AGATG	2	10	72308	72317	40 %	20 %	40 %	0 %	296108768
58	NC_014122	AGCTA	2	10	74760	74769	40 %	20 %	20 %	20 %	296108770
59	NC_014122	TATAA	2	10	75113	75122	60 %	40 %	0 %	0 %	296108770
60	NC_014122	CTTCC	2	10	75761	75770	0 %	40 %	0 %	60 %	296108771
61	NC_014122	CTTTT	2	10	77190	77199	0 %	80 %	0 %	20 %	296108773
62	NC_014122	TATCT	2	10	77461	77470	20 %	60 %	0 %	20 %	296108773
63	NC_014122	ATTTA	2	10	77809	77818	40 %	60 %	0 %	0 %	296108773
64	NC_014122	TATAG	2	10	80789	80798	40 %	40 %	20 %	0 %	296108777
65	NC_014122	TAAAC	2	10	80990	80999	60 %	20 %	0 %	20 %	296108777
66	NC_014122	TATTG	2	10	82487	82496	20 %	60 %	20 %	0 %	296108779
67	NC_014122	AGCTA	2	10	83092	83101	40 %	20 %	20 %	20 %	296108781
68	NC_014122	CCTCT	2	10	84649	84658	0 %	40 %	0 %	60 %	296108783
69	NC_014122	AGATC	2	10	86244	86253	40 %	20 %	20 %	20 %	296108784
70	NC_014122	CCTTT	2	10	91020	91029	0 %	60 %	0 %	40 %	296108788
71	NC_014122	TTTAT	2	10	91205	91214	20 %	80 %	0 %	0 %	296108788
72	NC_014122	TAAAA	2	10	93027	93036	80 %	20 %	0 %	0 %	296108790
73	NC_014122	CTCTA	2	10	93361	93370	20 %	40 %	0 %	40 %	296108791
74	NC_014122	ACTAT	2	10	94004	94013	40 %	40 %	0 %	20 %	296108791
75	NC_014122	GGATG	2	10	94960	94969	20 %	20 %	60 %	0 %	296108792
76	NC_014122	TAAGT	2	10	95229	95238	40 %	40 %	20 %	0 %	296108792
77	NC_014122	GTATT	2	10	98210	98219	20 %	60 %	20 %	0 %	296108794
78	NC_014122	TGAGG	2	10	101127	101136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014122	TAAAA	2	10	101505	101514	80 %	20 %	0 %	0 %	296108800
80	NC_014122	AGGAG	2	10	102079	102088	40 %	0 %	60 %	0 %	296108800
81	NC_014122	AAGAG	2	10	102168	102177	60 %	0 %	40 %	0 %	296108800
82	NC_014122	AGGAG	2	10	104100	104109	40 %	0 %	60 %	0 %	296108802
83	NC_014122	ATTTT	2	10	104447	104456	20 %	80 %	0 %	0 %	296108803
84	NC_014122	AAATT	2	10	106813	106822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014122	AAAGG	2	10	107964	107973	60 %	0 %	40 %	0 %	296108806
86	NC_014122	ATTTT	2	10	109665	109674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014122	ATCCA	2	10	112641	112650	40 %	20 %	0 %	40 %	296108810
88	NC_014122	AATTC	2	10	113621	113630	40 %	40 %	0 %	20 %	296108812
89	NC_014122	TCTTT	2	10	115321	115330	0 %	80 %	0 %	20 %	296108814
90	NC_014122	TATCT	2	10	118267	118276	20 %	60 %	0 %	20 %	296108819
91	NC_014122	ACTCT	2	10	119613	119622	20 %	40 %	0 %	40 %	296108819
92	NC_014122	TCTCT	2	10	120306	120315	0 %	60 %	0 %	40 %	296108819
93	NC_014122	CCTCT	2	10	120976	120985	0 %	40 %	0 %	60 %	296108819
94	NC_014122	TATTT	2	10	123149	123158	20 %	80 %	0 %	0 %	296108821
95	NC_014122	TAGGG	2	10	123257	123266	20 %	20 %	60 %	0 %	296108821
96	NC_014122	ACTTA	2	10	126560	126569	40 %	40 %	0 %	20 %	296108824
97	NC_014122	AGAAA	2	10	127048	127057	80 %	0 %	20 %	0 %	296108825
98	NC_014122	CTTCC	2	10	127221	127230	0 %	40 %	0 %	60 %	296108826
99	NC_014122	TCCAG	2	10	127612	127621	20 %	20 %	20 %	40 %	296108827
100	NC_014122	AGAAA	2	10	129319	129328	80 %	0 %	20 %	0 %	296108828
101	NC_014122	TTCCT	2	10	130326	130335	0 %	60 %	0 %	40 %	296108829
102	NC_014122	ATATC	2	10	131375	131384	40 %	40 %	0 %	20 %	296108829
103	NC_014122	TAACC	2	10	132609	132618	40 %	20 %	0 %	40 %	296108830
104	NC_014122	TAGGA	2	10	137397	137406	40 %	20 %	40 %	0 %	296108835
105	NC_014122	ATGAG	2	10	138380	138389	40 %	20 %	40 %	0 %	296108835
106	NC_014122	TATAA	2	10	138995	139004	60 %	40 %	0 %	0 %	296108836
107	NC_014122	ATTTT	2	10	139404	139413	20 %	80 %	0 %	0 %	296108836
108	NC_014122	TTAGC	2	10	149746	149755	20 %	40 %	20 %	20 %	296108847
109	NC_014122	TAAAT	2	10	150305	150314	60 %	40 %	0 %	0 %	296108848
110	NC_014122	ATTTT	2	10	150651	150660	20 %	80 %	0 %	0 %	296108848
111	NC_014122	ATTTA	2	10	151383	151392	40 %	60 %	0 %	0 %	296108849
112	NC_014122	TTTAT	2	10	152066	152075	20 %	80 %	0 %	0 %	296108850
113	NC_014122	AATTT	2	10	153289	153298	40 %	60 %	0 %	0 %	296108851
114	NC_014122	TAAAT	2	10	154147	154156	60 %	40 %	0 %	0 %	296108852
115	NC_014122	TTGGC	2	10	159310	159319	0 %	40 %	40 %	20 %	296108854
116	NC_014122	CTCTC	2	10	159607	159616	0 %	40 %	0 %	60 %	296108855
117	NC_014122	TCTCC	2	10	160004	160013	0 %	40 %	0 %	60 %	296108856
118	NC_014122	ACTTT	2	10	160406	160415	20 %	60 %	0 %	20 %	296108857
119	NC_014122	TTTAA	2	10	160907	160916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014122	ATTAA	2	10	160922	160931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014122	ATAAA	2	10	161776	161785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014122	CTATC	2	10	161788	161797	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014122	ATTTT	2	10	161886	161895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014122	TAAAT	2	10	162246	162255	60 %	40 %	0 %	0 %	296108858
125	NC_014122	CTTTC	2	10	162356	162365	0 %	60 %	0 %	40 %	296108858
126	NC_014122	ATCCT	2	10	162415	162424	20 %	40 %	0 %	40 %	296108858
127	NC_014122	GATAA	2	10	163803	163812	60 %	20 %	20 %	0 %	296108859
128	NC_014122	AGAGG	2	10	164115	164124	40 %	0 %	60 %	0 %	296108860
129	NC_014122	TATAA	2	10	164450	164459	60 %	40 %	0 %	0 %	296108860
130	NC_014122	GAAAT	2	10	164661	164670	60 %	20 %	20 %	0 %	296108860
131	NC_014122	AAATG	2	10	164971	164980	60 %	20 %	20 %	0 %	296108860
132	NC_014122	ACAGA	2	10	165060	165069	60 %	0 %	20 %	20 %	296108860
133	NC_014122	AGGGA	2	10	165530	165539	40 %	0 %	60 %	0 %	296108860
134	NC_014122	ACATT	2	10	168759	168768	40 %	40 %	0 %	20 %	296108864
135	NC_014122	TAAAA	2	10	169051	169060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014122	TTAAA	2	10	169104	169113	60 %	40 %	0 %	0 %	296108865
137	NC_014122	TATTT	2	10	169557	169566	20 %	80 %	0 %	0 %	296108865
138	NC_014122	TCTTT	2	10	170115	170124	0 %	80 %	0 %	20 %	296108865
139	NC_014122	CATCT	2	10	170142	170151	20 %	40 %	0 %	40 %	296108865
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