MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 1349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014122	ATA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014122	ACC	2	6	2207	2212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014122	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014122	TCT	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014122	TCT	3	9	2311	2319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014122	ATA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014122	ATT	3	9	2402	2410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014122	TTA	2	6	2414	2419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014122	TTA	2	6	2433	2438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014122	TGT	2	6	2448	2453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014122	CTA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014122	TAA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014122	CTT	2	6	2634	2639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014122	ATT	2	6	2726	2731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014122	TCT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014122	TAA	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014122	ATA	2	6	2910	2915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014122	CTA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014122	TCT	2	6	3015	3020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014122	TAT	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014122	ATA	2	6	3152	3157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014122	AAC	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014122	ATT	2	6	3245	3250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014122	TCT	2	6	4768	4773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014122	ATT	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014122	ATT	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014122	AGT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014122	AAT	2	6	6607	6612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014122	TTA	2	6	13925	13930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014122	AAT	2	6	13948	13953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014122	ATA	2	6	13954	13959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014122	TAA	2	6	15276	15281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014122	TTA	2	6	15338	15343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014122	TTA	2	6	23581	23586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014122	CCT	2	6	25488	25493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014122	GTA	2	6	25557	25562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014122	TAC	2	6	25572	25577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014122	TAA	2	6	25600	25605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014122	ATT	2	6	25659	25664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014122	TAT	2	6	25914	25919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014122	TAG	2	6	26081	26086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014122	TTC	2	6	26157	26162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014122	CTT	2	6	26172	26177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014122	ATG	2	6	26194	26199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014122	TTC	2	6	26246	26251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014122	TAA	2	6	26319	26324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014122	AGT	2	6	26414	26419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014122	TAG	2	6	26505	26510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014122	ATT	2	6	26521	26526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014122	GTT	2	6	26632	26637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014122	TGG	2	6	26790	26795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014122	GTT	2	6	26862	26867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014122	ATT	2	6	26954	26959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014122	ATG	2	6	26960	26965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014122	ATT	2	6	26993	26998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014122	CAC	2	6	28529	28534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014122	AAT	2	6	28558	28563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014122	ACT	2	6	28655	28660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014122	ACT	2	6	28843	28848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014122	ATT	2	6	28937	28942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014122	GAA	2	6	29011	29016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014122	CAT	2	6	29063	29068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014122	AAG	2	6	29085	29090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014122	AGA	2	6	29099	29104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014122	CTA	2	6	29176	29181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014122	ATA	2	6	29343	29348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014122	CCA	2	6	31604	31609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014122	ATA	2	6	36781	36786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014122	GTA	2	6	36797	36802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014122	TAA	2	6	36890	36895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014122	TAT	2	6	41018	41023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014122	ATT	2	6	41049	41054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014122	CTA	2	6	41341	41346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014122	TAT	2	6	41397	41402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014122	AAT	2	6	41439	41444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014122	CAC	2	6	41460	41465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014122	TAA	2	6	41477	41482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014122	ATT	2	6	53105	53110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014122	TTG	2	6	57208	57213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014122	AGG	2	6	57237	57242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014122	CTT	2	6	57255	57260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014122	TAA	2	6	57271	57276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014122	TAA	2	6	57292	57297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014122	TAA	2	6	60279	60284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014122	AGA	2	6	60298	60303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014122	ATA	2	6	61574	61579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014122	TAT	2	6	61587	61592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014122	TTA	2	6	61608	61613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014122	ATA	2	6	66297	66302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014122	TTC	2	6	70020	70025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014122	TCA	2	6	70029	70034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014122	TAC	2	6	70093	70098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014122	TAA	2	6	71629	71634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014122	TAA	2	6	74437	74442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014122	TAA	2	6	75895	75900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014122	TCC	2	6	82662	82667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014122	GGT	2	6	82740	82745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014122	ACC	2	6	86965	86970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014122	ATT	2	6	93167	93172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014122	CAC	2	6	96934	96939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014122	AAT	2	6	96942	96947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014122	TAT	2	6	98235	98240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014122	CCT	2	6	98243	98248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014122	TTA	2	6	98309	98314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014122	TTA	2	6	98351	98356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014122	TAA	2	6	99991	99996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014122	ATT	2	6	99999	100004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014122	ATT	2	6	105438	105443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014122	TAT	2	6	105490	105495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014122	TCT	2	6	105642	105647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014122	ACA	2	6	105678	105683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014122	AAT	2	6	105711	105716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014122	ATT	2	6	105719	105724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014122	ACA	2	6	105777	105782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014122	TAG	2	6	105826	105831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014122	ACA	2	6	105858	105863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014122	ATT	2	6	106481	106486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014122	CAA	2	6	106572	106577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014122	CAA	2	6	106600	106605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014122	AAT	2	6	106745	106750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014122	ATT	2	6	106779	106784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014122	ATA	2	6	106894	106899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014122	ATT	2	6	106952	106957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014122	TTA	2	6	106993	106998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014122	ATT	2	6	108770	108775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014122	TGT	2	6	109526	109531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014122	ATT	2	6	109593	109598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014122	ATT	2	6	109623	109628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014122	AGA	2	6	109774	109779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014122	AGT	2	6	109890	109895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014122	TAT	2	6	110090	110095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014122	ACC	2	6	113425	113430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014122	ATT	3	9	115626	115634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014122	CAG	2	6	117516	117521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014122	ATC	3	9	117530	117538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014122	CCA	2	6	121647	121652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014122	ATA	2	6	121677	121682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014122	TAT	2	6	121712	121717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014122	TGA	2	6	122774	122779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014122	TAA	3	9	122813	122821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014122	GAG	2	6	122823	122828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_014122	AAT	2	6	540740	540745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_014122	ATA	2	6	540750	540755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_014122	TTA	2	6	542528	542533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_014122	TAA	2	6	589945	589950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_014122	TCA	2	6	596709	596714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_014122	CTG	2	6	596730	596735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_014122	CTT	2	6	596845	596850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_014122	CTT	2	6	596909	596914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_014122	TGG	2	6	600615	600620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_014122	AAG	2	6	605353	605358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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