MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 5883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014122	TA	3	6	918	923	50 %	50 %	0 %	0 %	296108689
2	NC_014122	AT	3	6	1259	1264	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
3	NC_014122	TC	3	6	1353	1358	0 %	50 %	0 %	50 %	296108690
4	NC_014122	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
5	NC_014122	AC	3	6	1872	1877	50 %	0 %	0 %	50 %	296108690
6	NC_014122	AT	4	8	2219	2226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014122	AT	3	6	2327	2332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014122	AT	4	8	2688	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014122	AT	3	6	2892	2897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014122	TA	3	6	3137	3142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014122	TA	3	6	3144	3149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014122	TA	3	6	3159	3164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014122	TC	3	6	3854	3859	0 %	50 %	0 %	50 %	296108691
14	NC_014122	TC	3	6	4078	4083	0 %	50 %	0 %	50 %	296108692
15	NC_014122	AG	3	6	4319	4324	50 %	0 %	50 %	0 %	296108692
16	NC_014122	AG	3	6	4366	4371	50 %	0 %	50 %	0 %	296108692
17	NC_014122	TA	3	6	4681	4686	50 %	50 %	0 %	0 %	296108692
18	NC_014122	AG	3	6	4829	4834	50 %	0 %	50 %	0 %	296108693
19	NC_014122	GA	3	6	4952	4957	50 %	0 %	50 %	0 %	296108693
20	NC_014122	TC	3	6	5002	5007	0 %	50 %	0 %	50 %	296108693
21	NC_014122	CT	3	6	5622	5627	0 %	50 %	0 %	50 %	296108694
22	NC_014122	TC	3	6	5840	5845	0 %	50 %	0 %	50 %	296108694
23	NC_014122	CT	3	6	5955	5960	0 %	50 %	0 %	50 %	296108694
24	NC_014122	TA	3	6	6063	6068	50 %	50 %	0 %	0 %	296108694
25	NC_014122	TA	4	8	6311	6318	50 %	50 %	0 %	0 %	296108694
26	NC_014122	TC	3	6	6533	6538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014122	AG	3	6	6952	6957	50 %	0 %	50 %	0 %	296108695
28	NC_014122	GA	4	8	7004	7011	50 %	0 %	50 %	0 %	296108696
29	NC_014122	TA	3	6	7182	7187	50 %	50 %	0 %	0 %	296108696
30	NC_014122	CT	3	6	7199	7204	0 %	50 %	0 %	50 %	296108696
31	NC_014122	CT	3	6	7305	7310	0 %	50 %	0 %	50 %	296108697
32	NC_014122	CT	3	6	7532	7537	0 %	50 %	0 %	50 %	296108697
33	NC_014122	AG	3	6	7596	7601	50 %	0 %	50 %	0 %	296108697
34	NC_014122	CT	3	6	7662	7667	0 %	50 %	0 %	50 %	296108697
35	NC_014122	AG	3	6	8349	8354	50 %	0 %	50 %	0 %	296108699
36	NC_014122	AG	3	6	8485	8490	50 %	0 %	50 %	0 %	296108699
37	NC_014122	GA	3	6	8513	8518	50 %	0 %	50 %	0 %	296108699
38	NC_014122	TA	3	6	8809	8814	50 %	50 %	0 %	0 %	296108699
39	NC_014122	AG	3	6	9076	9081	50 %	0 %	50 %	0 %	296108699
40	NC_014122	CT	4	8	9295	9302	0 %	50 %	0 %	50 %	296108700
41	NC_014122	AT	3	6	9525	9530	50 %	50 %	0 %	0 %	296108700
42	NC_014122	CT	3	6	9580	9585	0 %	50 %	0 %	50 %	296108700
43	NC_014122	CT	3	6	9760	9765	0 %	50 %	0 %	50 %	296108700
44	NC_014122	AT	3	6	9999	10004	50 %	50 %	0 %	0 %	296108700
45	NC_014122	GA	3	6	10095	10100	50 %	0 %	50 %	0 %	296108700
46	NC_014122	AT	3	6	10273	10278	50 %	50 %	0 %	0 %	296108700
47	NC_014122	AG	4	8	10315	10322	50 %	0 %	50 %	0 %	296108700
48	NC_014122	TA	3	6	11128	11133	50 %	50 %	0 %	0 %	296108701
49	NC_014122	AG	3	6	11188	11193	50 %	0 %	50 %	0 %	296108701
50	NC_014122	TC	3	6	11517	11522	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
51	NC_014122	GA	3	6	11788	11793	50 %	0 %	50 %	0 %	296108702
52	NC_014122	GA	3	6	12051	12056	50 %	0 %	50 %	0 %	296108702
53	NC_014122	CT	3	6	12107	12112	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
54	NC_014122	CA	3	6	12113	12118	50 %	0 %	0 %	50 %	296108702
55	NC_014122	AG	3	6	12266	12271	50 %	0 %	50 %	0 %	296108702
56	NC_014122	TC	4	8	12369	12376	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
57	NC_014122	TA	4	8	12464	12471	50 %	50 %	0 %	0 %	296108702
58	NC_014122	AT	3	6	12479	12484	50 %	50 %	0 %	0 %	296108702
59	NC_014122	TC	3	6	12497	12502	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
60	NC_014122	CT	5	10	12552	12561	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
61	NC_014122	CT	3	6	12796	12801	0 %	50 %	0 %	50 %	296108703
62	NC_014122	TC	3	6	12836	12841	0 %	50 %	0 %	50 %	296108703
63	NC_014122	AT	3	6	13166	13171	50 %	50 %	0 %	0 %	296108703
64	NC_014122	CT	3	6	13268	13273	0 %	50 %	0 %	50 %	296108703
65	NC_014122	CA	3	6	13592	13597	50 %	0 %	0 %	50 %	296108703
66	NC_014122	AG	3	6	14042	14047	50 %	0 %	50 %	0 %	296108704
67	NC_014122	GA	3	6	14049	14054	50 %	0 %	50 %	0 %	296108704
68	NC_014122	GA	4	8	14460	14467	50 %	0 %	50 %	0 %	296108704
69	NC_014122	AT	3	6	14692	14697	50 %	50 %	0 %	0 %	296108704
70	NC_014122	AT	3	6	15107	15112	50 %	50 %	0 %	0 %	296108706
71	NC_014122	TA	3	6	15282	15287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75	NC_014122	AG	3	6	16471	16476	50 %	0 %	50 %	0 %	296108708
76	NC_014122	AT	3	6	16482	16487	50 %	50 %	0 %	0 %	296108708
77	NC_014122	AG	3	6	16596	16601	50 %	0 %	50 %	0 %	296108708
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84	NC_014122	TA	3	6	18222	18227	50 %	50 %	0 %	0 %	296108710
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89	NC_014122	TA	3	6	18874	18879	50 %	50 %	0 %	0 %	296108710
90	NC_014122	TC	3	6	18978	18983	0 %	50 %	0 %	50 %	296108711
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92	NC_014122	AT	3	6	19093	19098	50 %	50 %	0 %	0 %	296108711
93	NC_014122	TA	3	6	19842	19847	50 %	50 %	0 %	0 %	296108711
94	NC_014122	TA	3	6	20403	20408	50 %	50 %	0 %	0 %	296108712
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96	NC_014122	TC	3	6	20865	20870	0 %	50 %	0 %	50 %	296108712
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98	NC_014122	AT	3	6	21988	21993	50 %	50 %	0 %	0 %	296108714
99	NC_014122	AT	3	6	22884	22889	50 %	50 %	0 %	0 %	296108714
100	NC_014122	AT	4	8	23519	23526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_014122	AG	3	6	24283	24288	50 %	0 %	50 %	0 %	296108715
104	NC_014122	TA	4	8	24398	24405	50 %	50 %	0 %	0 %	296108715
105	NC_014122	AG	3	6	24556	24561	50 %	0 %	50 %	0 %	296108715
106	NC_014122	AT	3	6	24573	24578	50 %	50 %	0 %	0 %	296108715
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108	NC_014122	GA	4	8	24969	24976	50 %	0 %	50 %	0 %	296108716
109	NC_014122	AG	3	6	25086	25091	50 %	0 %	50 %	0 %	296108716
110	NC_014122	TA	3	6	25101	25106	50 %	50 %	0 %	0 %	296108716
111	NC_014122	AG	3	6	25118	25123	50 %	0 %	50 %	0 %	296108716
112	NC_014122	GA	3	6	25233	25238	50 %	0 %	50 %	0 %	296108716
113	NC_014122	TA	3	6	25561	25566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014122	AT	3	6	26218	26223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014122	AT	3	6	26334	26339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014122	TA	3	6	26382	26387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014122	TA	3	6	26582	26587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014122	AT	3	6	27120	27125	50 %	50 %	0 %	0 %	296108718
119	NC_014122	AT	4	8	27245	27252	50 %	50 %	0 %	0 %	296108718
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122	NC_014122	AT	3	6	28354	28359	50 %	50 %	0 %	0 %	296108718
123	NC_014122	TA	3	6	28373	28378	50 %	50 %	0 %	0 %	296108718
124	NC_014122	AT	3	6	28550	28555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014122	CT	3	6	28632	28637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014122	AT	3	6	28745	28750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014122	AT	3	6	28874	28879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014122	AT	3	6	28923	28928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014122	AT	3	6	29039	29044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_014122	TA	3	6	29868	29873	50 %	50 %	0 %	0 %	296108720
132	NC_014122	CT	3	6	30074	30079	0 %	50 %	0 %	50 %	296108720
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