MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047 chromosome

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014121	TCTCCC	2	12	43968	43979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014121	AGGGAG	2	12	45004	45015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014121	GAAACG	2	12	50130	50141	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014121	CTCCCT	2	12	104521	104532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014121	CACGAT	2	12	117630	117641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014121	TTAAAA	2	12	145699	145710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014121	CTCCCT	2	12	184828	184839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014121	CTCCCT	2	12	184868	184879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014121	TCTCCC	2	12	229208	229219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014121	TCTCCC	2	12	276379	276390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014121	AGAGGG	2	12	301328	301339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014121	ATGTTG	2	12	328816	328827	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014121	GTCTTT	2	12	331656	331667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014121	AGGGAG	2	12	340264	340275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014121	GGGAGA	2	12	360574	360585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014121	AGGGAG	2	12	369543	369554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014121	TCTCCC	2	12	386033	386044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014121	TAAAAC	2	12	408255	408266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014121	GTGTAT	2	12	415581	415592	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014121	ATGCCA	2	12	427006	427017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014121	TTCAGC	2	12	428348	428359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014121	TGCGGG	2	12	458387	458398	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014121	ATGAAT	2	12	479264	479275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014121	AACAGA	2	12	487770	487781	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014121	AACCGT	2	12	505746	505757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014121	ATGCCA	2	12	507372	507383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014121	TGTTTC	2	12	590369	590380	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014121	GCTGGT	2	12	647292	647303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014121	GGCGAT	2	12	647640	647651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014121	GATCCC	2	12	655845	655856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014121	GGGAGA	2	12	668163	668174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014121	AAGGAT	2	12	681141	681152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014121	GCTGGC	2	12	689137	689148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014121	ATCATT	2	12	715502	715513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014121	TCTCCC	2	12	718792	718803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014121	GGGAGA	2	12	727596	727607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014121	GCCCTG	2	12	733053	733064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014121	TCTCCC	2	12	749864	749875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014121	AATGAT	2	12	770864	770875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014121	TCATTA	2	12	803406	803417	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014121	GATACG	2	12	837277	837288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014121	TTTTTA	2	12	896751	896762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014121	AGGGAG	2	12	937739	937750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014121	AGGGAG	2	12	958912	958923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014121	GCAGTA	2	12	970748	970759	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014121	GGGAGA	2	12	971162	971173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014121	TCTCCC	2	12	977883	977894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014121	CTGCGG	2	12	1156994	1157005	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014121	AAATGT	2	12	1204801	1204812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014121	CTCCCT	2	12	1248146	1248157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014121	GGGGAA	2	12	1305705	1305716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014121	TGTCGC	2	12	1307683	1307694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014121	TCTCCC	2	12	1310907	1310918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014121	TCATCC	2	12	1322975	1322986	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014121	GAGGTT	2	12	1355903	1355914	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014121	TGTATA	2	12	1369972	1369983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014121	TAACTT	2	12	1405240	1405251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014121	ATATTT	2	12	1406401	1406412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014121	CAGAAA	2	12	1442128	1442139	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014121	TGTGGT	2	12	1480248	1480259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014121	TTTTAT	2	12	1497009	1497020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014121	ATATTG	2	12	1539000	1539011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014121	AAGCGC	2	12	1544329	1544340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014121	TTCACC	2	12	1560533	1560544	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014121	TTTTCT	2	12	1578920	1578931	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014121	TATTTT	2	12	1598498	1598509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014121	CAAGGT	2	12	1600242	1600253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014121	GTAAAT	2	12	1602707	1602718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014121	GCGAGA	2	12	1605567	1605578	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014121	ATAAAA	2	12	1644614	1644625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014121	TAATAT	2	12	1697504	1697515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014121	ATCATT	2	12	1700498	1700509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014121	AGATGC	2	12	1737097	1737108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014121	GAAGGA	2	12	1779991	1780002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014121	GCAATA	2	12	1809036	1809047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014121	CAGCCA	2	12	1827364	1827375	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014121	ATGCGA	2	12	1829541	1829552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014121	ATCTTG	2	12	1880455	1880466	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014121	GCTAAC	2	12	1919519	1919530	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014121	TGCTGT	2	12	1919572	1919583	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014121	GTGATC	2	12	1932173	1932184	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014121	TCCTGA	2	12	1938690	1938701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014121	GCAACA	2	12	2047652	2047663	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014121	ATCAAT	2	12	2101619	2101630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014121	TATAGG	2	12	2111682	2111693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014121	GCACCA	2	12	2112081	2112092	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014121	AACCGT	2	12	2112210	2112221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014121	CCACCG	2	12	2112303	2112314	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014121	TGCCGT	2	12	2112546	2112557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014121	CCAGAT	2	12	2112771	2112782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014121	CTGGTA	2	12	2115109	2115120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014121	GTCACC	2	12	2115530	2115541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014121	CTGCGC	2	12	2116777	2116788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014121	ACGGTG	2	12	2117510	2117521	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014121	GTGCCG	2	12	2118371	2118382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014121	GTCACG	2	12	2118413	2118424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014121	ACGGTC	2	12	2119415	2119426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014121	CGCTCA	2	12	2119608	2119619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014121	GTGCCG	2	12	2120168	2120179	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014121	GTCACG	2	12	2120210	2120221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014121	GTCACG	2	12	2121515	2121526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014121	ACGCTG	2	12	2126186	2126197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014121	GGTGAC	2	12	2126602	2126613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014121	CGGTCA	2	12	2126646	2126657	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014121	GCTCAG	2	12	2127241	2127252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014121	TTTTGT	2	12	2128546	2128557	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014121	GGGAGA	2	12	2142660	2142671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014121	TTTCTC	2	12	2205655	2205666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014121	CAAAAA	2	12	2224931	2224942	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014121	CTTTTC	2	12	2269229	2269240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014121	AAGGTT	2	12	2323384	2323395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014121	GATACC	2	12	2340291	2340302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014121	GCTTCG	2	12	2348618	2348629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014121	GCTAAT	2	12	2348752	2348763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014121	AAATAT	2	12	2349146	2349157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014121	TCCTGG	2	12	2369489	2369500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014121	TTTGCC	2	12	2371848	2371859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014121	AATAAC	2	12	2402489	2402500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014121	AAGACT	2	12	2408674	2408685	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014121	TCAGGT	2	12	2431772	2431783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014121	GCGCTT	2	12	2483002	2483013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014121	AGGGAG	2	12	2508808	2508819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014121	AGTACT	2	12	2524987	2524998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014121	ATGCAG	2	12	2536560	2536571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014121	TCGCTT	2	12	2545344	2545355	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014121	GCATTT	2	12	2581912	2581923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014121	AACAAT	2	12	2627880	2627891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014121	TTATTT	2	12	2641312	2641323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014121	TTAACG	2	12	2641479	2641490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014121	ATTTTC	2	12	2647262	2647273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014121	AGGGAG	2	12	2683604	2683615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014121	ATAAAA	2	12	2704408	2704419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014121	CGAGAT	2	12	2750658	2750669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014121	GGGAGA	2	12	2820529	2820540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014121	AGGGAG	2	12	2841777	2841788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014121	TGCGCA	2	12	2905277	2905288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014121	GGGAGA	2	12	2935179	2935190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014121	CGGGCG	2	12	2985066	2985077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014121	AGGGAG	2	12	2996084	2996095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014121	CATTTT	2	12	3003146	3003157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014121	AGGGAG	2	12	3009949	3009960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014121	CACGGC	2	12	3029758	3029769	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_014121	CGGCAT	2	12	3129716	3129727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014121	GGTGCA	2	12	3135820	3135831	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014121	TAAAAA	2	12	3138549	3138560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014121	CTCCCT	2	12	3144843	3144854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_014121	AGGGAG	2	12	3160086	3160097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014121	AAGGAA	2	12	3162546	3162557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014121	AGGGAG	2	12	3173932	3173943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014121	ATTTGC	2	12	3179339	3179350	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_014121	CTCCCT	2	12	3181752	3181763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_014121	CCAGTA	2	12	3224047	3224058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014121	AGGGAG	2	12	3232299	3232310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014121	GATGCG	2	12	3244387	3244398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_014121	TGTATA	2	12	3244653	3244664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014121	ACCAGG	2	12	3278568	3278579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_014121	GATTCG	2	12	3387815	3387826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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234	NC_014121	AGGGAG	2	12	4914989	4915000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
235	NC_014121	GGGAGA	2	12	4928207	4928218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_014121	AGGGAG	2	12	4977533	4977544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_014121	GCGCTT	2	12	5196559	5196570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_014121	CGTTTC	2	12	5219511	5219522	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_014121	TGAGTA	2	12	5279754	5279765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
242	NC_014121	TGTTCC	2	12	5281704	5281715	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.