MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014120	ATAGAA	2	12	3617	3628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014120	GGGAGA	2	12	30935	30946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014120	TGTGCA	2	12	77362	77373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014120	GGGCGA	2	12	91462	91473	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014120	TCGCTA	2	12	94011	94022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014120	AGACCA	2	12	101352	101363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014120	ACGTCA	2	12	101420	101431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014120	AGCGCT	2	12	138097	138108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014120	GAGAAT	2	12	140157	140168	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014120	AAGCGC	2	12	143794	143805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014120	GGCATA	2	12	161468	161479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014120	GCCGGC	2	12	186821	186832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014120	TCAGTA	2	12	191715	191726	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014120	CGAGCT	2	12	197277	197288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014120	CGTTCG	2	12	208341	208352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014120	GCCAGA	2	12	216408	216419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014120	TCGCGC	2	12	216795	216806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014120	GTGCCC	2	12	251184	251195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014120	TTACTT	2	12	265445	265456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014120	CAGGCG	2	12	278221	278232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014120	GGCATC	2	12	286344	286355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014120	CTTCAA	2	12	291157	291168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014120	CGGAAG	2	12	291574	291585	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014120	AGCACA	2	12	292971	292982	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014120	GTCGCA	2	12	294822	294833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014120	AACTGA	2	12	301473	301484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014120	GCATCA	2	12	310901	310912	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014120	ACTGCC	2	12	316227	316238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014120	AGCGCC	2	12	322097	322108	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014120	AAAAGC	2	12	378445	378456	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014120	TGCGCA	2	12	380884	380895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014120	CGGCGT	2	12	389295	389306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014120	GCTTGC	2	12	399153	399164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014120	CGCGCA	2	12	406691	406702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014120	TCGGGC	2	12	407315	407326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014120	ATCGCA	2	12	414983	414994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014120	GCACGC	2	12	446024	446035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014120	AGCGAA	2	12	455844	455855	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014120	GAAAAG	2	12	462878	462889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014120	AGAAAA	2	12	467053	467064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.