MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 3

Total Repeats: 656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014119	GGGC	2	8	5804	5811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014119	GGCA	2	8	9646	9653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014119	TGAG	2	8	10875	10882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014119	CCAG	2	8	11513	11520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014119	TGGA	2	8	11616	11623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014119	AAGC	2	8	11868	11875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014119	CGCC	2	8	11910	11917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_014119	TGGG	2	8	12169	12176	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014119	AACG	2	8	16554	16561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014119	TGCT	2	8	22203	22210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014119	TGCT	2	8	22216	22223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014119	TGCT	2	8	22229	22236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014119	GGTT	2	8	23450	23457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014119	TTCG	2	8	31622	31629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014119	TGCC	2	8	31656	31663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014119	TGAG	2	8	31904	31911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014119	CTGA	2	8	32287	32294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014119	CAGC	2	8	32413	32420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014119	CTCA	2	8	32968	32975	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014119	CCGT	2	8	33129	33136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014119	CCTG	2	8	33905	33912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014119	TTCG	2	8	34132	34139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014119	TGGC	2	8	34191	34198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014119	GCCC	2	8	34331	34338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014119	TGCA	2	8	34884	34891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014119	TAGA	2	8	34958	34965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014119	CGGC	2	8	35403	35410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014119	CGTC	2	8	37321	37328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014119	CCAG	2	8	40709	40716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014119	CTGG	2	8	40775	40782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014119	TCCA	2	8	46680	46687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014119	GGTG	2	8	46859	46866	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014119	ACCG	2	8	47527	47534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014119	CGTG	2	8	47574	47581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014119	GCCC	2	8	50700	50707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_014119	TGAA	2	8	50739	50746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014119	CGTT	2	8	50754	50761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014119	TGAT	2	8	54296	54303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014119	GATG	2	8	55011	55018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014119	TCGT	2	8	58358	58365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014119	CGGC	2	8	64821	64828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014119	GTCG	2	8	65113	65120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014119	AGCG	2	8	66141	66148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014119	AGCG	2	8	66216	66223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014119	GGGC	2	8	66704	66711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014119	CTGC	2	8	67087	67094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014119	CGAG	2	8	67157	67164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014119	CGTT	2	8	67381	67388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014119	TGAT	2	8	67396	67403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014119	TTTC	2	8	69130	69137	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014119	TGAT	2	8	71394	71401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014119	CCGA	2	8	90864	90871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014119	GCAG	2	8	91783	91790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014119	TTGG	2	8	91853	91860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014119	CATT	2	8	97539	97546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014119	ATCG	2	8	101756	101763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014119	CACG	2	8	108478	108485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014119	GAAT	2	8	108486	108493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014119	GATT	2	8	108499	108506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014119	CGGT	2	8	114106	114113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014119	ATCT	2	8	121006	121013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014119	TTTG	2	8	121164	121171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014119	CGCT	2	8	121493	121500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014119	GGCA	2	8	122468	122475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014119	GCCG	2	8	122477	122484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014119	ACTC	2	8	122735	122742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014119	GGCG	2	8	128959	128966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014119	ACAG	2	8	129093	129100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014119	CGGT	2	8	129624	129631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014119	CGGT	2	8	130463	130470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014119	CGTG	2	8	131244	131251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014119	CAGC	2	8	131376	131383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014119	GTCG	2	8	131509	131516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014119	GACC	2	8	131654	131661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014119	CCAT	2	8	136338	136345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014119	CTAC	2	8	140746	140753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014119	GCCG	2	8	141590	141597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014119	GCCC	2	8	141660	141667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_014119	ATCG	2	8	144646	144653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014119	GGTG	2	8	149984	149991	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014119	CGAC	2	8	150032	150039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014119	AACT	2	8	150775	150782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014119	GAAG	2	8	150841	150848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014119	TGCA	2	8	152023	152030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014119	GTCA	2	8	153053	153060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014119	AATA	2	8	153538	153545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014119	GCAG	2	8	153602	153609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014119	CGAC	2	8	154213	154220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014119	TTGG	2	8	154348	154355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014119	GGCG	2	8	154379	154386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014119	GATC	2	8	154569	154576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014119	AGCC	2	8	154708	154715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014119	AGCT	2	8	154970	154977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014119	CGTT	2	8	155098	155105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014119	CGGC	2	8	155411	155418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014119	GTCC	2	8	155625	155632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014119	AGCC	2	8	155721	155728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014119	TGGG	2	8	157141	157148	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014119	CAAA	2	8	158574	158581	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014119	CTTC	2	8	160243	160250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014119	TAAT	2	8	160298	160305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014119	CGGC	2	8	160430	160437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014119	ACGG	2	8	160470	160477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014119	TAAA	2	8	162119	162126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014119	GGTT	2	8	162186	162193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014119	CGCT	2	8	162286	162293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014119	CTTG	2	8	163649	163656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014119	CGGA	2	8	164357	164364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014119	AGCG	2	8	164761	164768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014119	CCGA	2	8	164815	164822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014119	GCGT	2	8	164873	164880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014119	CACG	2	8	180214	180221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014119	GGCG	2	8	184972	184979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014119	GCGG	2	8	186244	186251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014119	GGGC	2	8	187769	187776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014119	GTGG	2	8	187789	187796	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014119	GCCT	2	8	194833	194840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014119	CGCA	2	8	194940	194947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014119	GGCC	2	8	202235	202242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014119	GCGG	2	8	202521	202528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014119	TGGA	2	8	202670	202677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014119	CGAT	2	8	202725	202732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014119	CATG	2	8	204216	204223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014119	TCGG	2	8	209222	209229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014119	TTGC	2	8	209323	209330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014119	GCAT	2	8	209592	209599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014119	CGAC	2	8	209633	209640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014119	GCCG	2	8	211010	211017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014119	CAGA	2	8	211536	211543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014119	TTGG	2	8	218124	218131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014119	CAGT	2	8	226119	226126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014119	TTTG	2	8	232906	232913	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014119	CATC	2	8	234456	234463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014119	TCAA	2	8	249853	249860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014119	TCGG	2	8	249965	249972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014119	CAGC	3	12	250277	250288	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014119	GACG	2	8	250503	250510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014119	CGGC	2	8	251458	251465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014119	AGCA	2	8	251497	251504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014119	TTTA	2	8	252203	252210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014119	GCGA	2	8	256109	256116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014119	CGTG	2	8	256315	256322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014119	CTTC	2	8	256738	256745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014119	AGCG	2	8	261049	261056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014119	ATCT	2	8	261129	261136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014119	ATCC	2	8	261420	261427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014119	GCAG	2	8	261626	261633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014119	TGAT	2	8	264825	264832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014119	GGCG	2	8	265898	265905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014119	AACG	2	8	266048	266055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014119	GACA	2	8	266606	266613	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014119	ACCT	2	8	267164	267171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014119	GTGC	2	8	269277	269284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_014119	TGCA	2	8	270441	270448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014119	TTTA	2	8	271788	271795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014119	GCCC	2	8	271941	271948	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
157	NC_014119	TGAC	2	8	271985	271992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_014119	GGCA	2	8	272243	272250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_014119	AGCG	2	8	272308	272315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_014119	ACGA	2	8	272399	272406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_014119	ACGG	2	8	272606	272613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_014119	GAAC	2	8	272760	272767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_014119	GGAA	2	8	273029	273036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014119	CGAT	2	8	273497	273504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_014119	CATG	2	8	274988	274995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_014119	CATC	2	8	275171	275178	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_014119	GGCC	2	8	276030	276037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_014119	ACCG	2	8	289686	289693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_014119	AGGA	2	8	296105	296112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014119	TATT	2	8	296147	296154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014119	GCGA	2	8	296434	296441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
172	NC_014119	CGCT	2	8	296748	296755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
173	NC_014119	TTGG	2	8	296863	296870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014119	TCCG	2	8	297702	297709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
175	NC_014119	CTGG	2	8	297790	297797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_014119	GATC	2	8	298383	298390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_014119	ACGA	2	8	298445	298452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_014119	GTTG	2	8	298532	298539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014119	TTTC	2	8	298649	298656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_014119	CTCG	2	8	307116	307123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
181	NC_014119	GCGA	2	8	307222	307229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
182	NC_014119	TCGC	2	8	307321	307328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
183	NC_014119	CGGC	2	8	307496	307503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
184	NC_014119	TCGC	2	8	307603	307610	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_014119	CACG	2	8	307771	307778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
186	NC_014119	GTGC	2	8	307939	307946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
187	NC_014119	TTTC	2	8	308286	308293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
188	NC_014119	GTGC	2	8	311300	311307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_014119	CTCG	2	8	314193	314200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
190	NC_014119	GCGA	2	8	315043	315050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
191	NC_014119	TGAG	2	8	319772	319779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014119	CGAG	2	8	319941	319948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
193	NC_014119	ACCG	2	8	319960	319967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
194	NC_014119	ATGG	2	8	320072	320079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014119	TCCT	2	8	326596	326603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
196	NC_014119	TTGG	2	8	326629	326636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_014119	AGGA	2	8	326706	326713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_014119	GACG	2	8	335772	335779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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209	NC_014119	CACT	2	8	345599	345606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
210	NC_014119	ACGC	2	8	346162	346169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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225	NC_014119	TCGA	2	8	375713	375720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_014119	GCCG	2	8	384341	384348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
234	NC_014119	GCTC	2	8	384645	384652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
235	NC_014119	GCCG	2	8	385038	385045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
236	NC_014119	TCGC	2	8	385632	385639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
237	NC_014119	GCCC	2	8	385817	385824	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
238	NC_014119	ACCG	2	8	386654	386661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
239	NC_014119	GGCT	2	8	386713	386720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
240	NC_014119	CGCA	2	8	387467	387474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
241	NC_014119	CACG	2	8	387837	387844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
242	NC_014119	AACG	2	8	392350	392357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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252	NC_014119	AGTC	2	8	429141	429148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_014119	TATT	2	8	485111	485118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_014119	ATCG	2	8	866657	866664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
463	NC_014119	ACAA	2	8	871681	871688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_014119	CGTC	2	8	916777	916784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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