MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 2

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014118	TTTCCC	2	12	107617	107628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014118	CGCGAG	2	12	108692	108703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014118	CAGCGG	2	12	144760	144771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014118	CTTTCG	2	12	174468	174479	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014118	CAGCAC	2	12	192384	192395	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014118	ACGTTG	2	12	241465	241476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014118	GTGCAG	2	12	248963	248974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014118	AGCGCG	2	12	249021	249032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014118	GATATC	2	12	280532	280543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014118	GCAACG	2	12	282436	282447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014118	GCGGGG	2	12	286608	286619	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014118	GCCAAA	2	12	323470	323481	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014118	ACGGAG	2	12	336808	336819	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014118	ATTGCG	2	12	385921	385932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014118	CGCCGT	2	12	430853	430864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014118	CGCCGG	2	12	438323	438334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014118	TTGATT	2	12	444768	444779	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014118	ACGCGC	2	12	449723	449734	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014118	GAGCGG	2	12	449748	449759	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014118	CCTCCG	2	12	451711	451722	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014118	CGACGG	2	12	458720	458731	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014118	AACCAG	2	12	496374	496385	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014118	GGCGCG	2	12	542919	542930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014118	TCGGAA	2	12	598828	598839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014118	ATGCCT	2	12	602687	602698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014118	GCCGGC	2	12	621667	621678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014118	GCGCGG	2	12	631350	631361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014118	GGGAAG	2	12	659068	659079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014118	TTTCAA	2	12	678112	678123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014118	GTTCCA	2	12	689366	689377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014118	TTGTCG	2	12	690804	690815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014118	TTGAAA	2	12	700654	700665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014118	GCGGCC	2	12	751446	751457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014118	CGTTTC	2	12	753162	753173	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014118	GATCAC	2	12	763978	763989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014118	CGGCAT	2	12	817308	817319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014118	CGATGG	2	12	819229	819240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014118	TGCCGC	2	12	819481	819492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014118	TTGCGT	2	12	832246	832257	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014118	TGACAG	2	12	936224	936235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014118	ATTGAT	2	12	945652	945663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014118	AATCGC	2	12	969467	969478	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014118	GTCACG	2	12	970324	970335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014118	GCCGAC	2	12	988063	988074	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014118	GCAAAA	2	12	997109	997120	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014118	ACGAGG	2	12	1035262	1035273	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014118	ACAGCA	2	12	1035761	1035772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014118	GGCGCT	2	12	1104352	1104363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014118	TCCTGT	2	12	1120358	1120369	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014118	GACGGC	2	12	1123613	1123624	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014118	TGCGCT	2	12	1138537	1138548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014118	AGCCGC	2	12	1165317	1165328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014118	AGGCAC	2	12	1165587	1165598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014118	GCAAAG	2	12	1178426	1178437	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014118	GCTCGT	2	12	1189756	1189767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014118	GGCTCG	2	12	1197932	1197943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014118	ATCTGA	2	12	1205264	1205275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014118	TCGGCC	2	12	1216572	1216583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014118	TCTCGC	2	12	1225586	1225597	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014118	GCAGAA	2	12	1269428	1269439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014118	GCCGTC	2	12	1297407	1297418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014118	GTGCGC	2	12	1305506	1305517	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014118	GGCGCG	3	18	1354572	1354589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014118	TTCCTT	2	12	1379720	1379731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014118	ACGGCG	2	12	1478708	1478719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014118	GGCATC	2	12	1497086	1497097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014118	TTCACC	2	12	1529594	1529605	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014118	CCAGCG	2	12	1541513	1541524	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014118	ACTCCC	2	12	1554705	1554716	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014118	ACCGCG	2	12	1566107	1566118	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014118	AATGTA	2	12	1570343	1570354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014118	TCGTGC	2	12	1576456	1576467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014118	CGAATG	2	12	1591166	1591177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014118	TCAACG	2	12	1629660	1629671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014118	ACGGCG	2	12	1645453	1645464	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014118	GGGAAA	2	12	1689951	1689962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014118	CCGTTT	2	12	1696606	1696617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014118	GCGGAC	2	12	1739067	1739078	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014118	GATTGA	2	12	1740322	1740333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014118	ACATAA	2	12	1742925	1742936	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014118	ATAGCC	2	12	1747740	1747751	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014118	TGCGGC	2	12	1768023	1768034	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014118	TCGATT	2	12	1772647	1772658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014118	CGATGC	2	12	1804534	1804545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014118	TAACAT	2	12	1833234	1833245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014118	TGATGG	2	12	1937502	1937513	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014118	GATGCC	2	12	1967431	1967442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014118	GGGCTT	2	12	1968450	1968461	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014118	CGGGTG	2	12	1975751	1975762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014118	GCTCGC	2	12	2000878	2000889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014118	ACTGTC	2	12	2075889	2075900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014118	TCGATA	2	12	2076989	2077000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014118	CGCGGG	2	12	2102278	2102289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014118	GACAGC	2	12	2104262	2104273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014118	TCGTTG	2	12	2331695	2331706	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014118	GCAACG	2	12	2333609	2333620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014118	CGCAAA	2	12	2373516	2373527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014118	GTTTAG	2	12	2409193	2409204	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014118	GAGCCG	2	12	2409966	2409977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014118	TGCGGC	2	12	2481590	2481601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014118	CGCGTG	2	12	2514730	2514741	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.