MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	TTTTC	2	10	2503	2512	0 %	80 %	0 %	20 %	295698242
2	NC_014109	ATTTT	2	10	4715	4724	20 %	80 %	0 %	0 %	295698245
3	NC_014109	ATCTT	2	10	4848	4857	20 %	60 %	0 %	20 %	295698245
4	NC_014109	AAATA	2	10	5804	5813	80 %	20 %	0 %	0 %	295698247
5	NC_014109	AGGAT	2	10	5913	5922	40 %	20 %	40 %	0 %	295698247
6	NC_014109	AATTA	2	10	6259	6268	60 %	40 %	0 %	0 %	295698247
7	NC_014109	ATTTT	2	10	9023	9032	20 %	80 %	0 %	0 %	295698250
8	NC_014109	TCAAT	2	10	9263	9272	40 %	40 %	0 %	20 %	295698250
9	NC_014109	AAAAT	2	10	9303	9312	80 %	20 %	0 %	0 %	295698250
10	NC_014109	ATCCT	2	10	11720	11729	20 %	40 %	0 %	40 %	295698252
11	NC_014109	AGATA	2	10	12786	12795	60 %	20 %	20 %	0 %	295698254
12	NC_014109	AAAAT	2	10	12918	12927	80 %	20 %	0 %	0 %	295698254
13	NC_014109	AGAAA	2	10	15130	15139	80 %	0 %	20 %	0 %	295698257
14	NC_014109	TAAAA	2	10	18610	18619	80 %	20 %	0 %	0 %	295698261
15	NC_014109	AGTTT	2	10	19124	19133	20 %	60 %	20 %	0 %	295698261
16	NC_014109	GTTTT	2	10	21884	21893	0 %	80 %	20 %	0 %	295698265
17	NC_014109	AAATG	2	10	24361	24370	60 %	20 %	20 %	0 %	295698268
18	NC_014109	ATGAT	2	10	24417	24426	40 %	40 %	20 %	0 %	295698268
19	NC_014109	TTTTC	2	10	24989	24998	0 %	80 %	0 %	20 %	295698268
20	NC_014109	ATTCG	2	10	26029	26038	20 %	40 %	20 %	20 %	295698269
21	NC_014109	ATTTG	2	10	26535	26544	20 %	60 %	20 %	0 %	295698269
22	NC_014109	AAAAT	2	10	27798	27807	80 %	20 %	0 %	0 %	295698271
23	NC_014109	AAATC	2	10	28301	28310	60 %	20 %	0 %	20 %	295698271
24	NC_014109	CATTG	2	10	29512	29521	20 %	40 %	20 %	20 %	295698272
25	NC_014109	CAATC	2	10	30531	30540	40 %	20 %	0 %	40 %	295698274
26	NC_014109	TCATA	2	10	32283	32292	40 %	40 %	0 %	20 %	295698276
27	NC_014109	TAATC	2	10	34415	34424	40 %	40 %	0 %	20 %	295698278
28	NC_014109	GACTT	2	10	43158	43167	20 %	40 %	20 %	20 %	295698283
29	NC_014109	TAACT	2	10	43622	43631	40 %	40 %	0 %	20 %	295698284
30	NC_014109	TAAAT	2	10	44707	44716	60 %	40 %	0 %	0 %	295698285
31	NC_014109	ATCGA	2	10	45779	45788	40 %	20 %	20 %	20 %	295698286
32	NC_014109	CTTTT	2	10	48652	48661	0 %	80 %	0 %	20 %	295698289
33	NC_014109	ATTTT	2	10	49337	49346	20 %	80 %	0 %	0 %	295698289
34	NC_014109	GAAAA	2	10	49869	49878	80 %	0 %	20 %	0 %	295698290
35	NC_014109	AAAAT	2	10	55773	55782	80 %	20 %	0 %	0 %	295698295
36	NC_014109	ATCGA	2	10	59981	59990	40 %	20 %	20 %	20 %	295698298
37	NC_014109	ATTGA	2	10	60341	60350	40 %	40 %	20 %	0 %	295698298
38	NC_014109	TTAGT	2	10	62737	62746	20 %	60 %	20 %	0 %	295698299
39	NC_014109	TCATT	2	10	63891	63900	20 %	60 %	0 %	20 %	295698300
40	NC_014109	AGAAA	2	10	65125	65134	80 %	0 %	20 %	0 %	295698301
41	NC_014109	CCAAG	2	10	65166	65175	40 %	0 %	20 %	40 %	295698301
42	NC_014109	TCATT	2	10	65204	65213	20 %	60 %	0 %	20 %	295698301
43	NC_014109	AATTT	2	10	67102	67111	40 %	60 %	0 %	0 %	295698302
44	NC_014109	TTTCT	2	10	67223	67232	0 %	80 %	0 %	20 %	295698302
45	NC_014109	AATAC	2	10	68017	68026	60 %	20 %	0 %	20 %	295698303
46	NC_014109	TCTCT	2	10	69138	69147	0 %	60 %	0 %	40 %	295698304
47	NC_014109	TTTTC	2	10	70482	70491	0 %	80 %	0 %	20 %	295698305
48	NC_014109	ATGGG	2	10	73528	73537	20 %	20 %	60 %	0 %	295698309
49	NC_014109	GAAGA	2	10	73973	73982	60 %	0 %	40 %	0 %	295698309
50	NC_014109	CAATT	2	10	74733	74742	40 %	40 %	0 %	20 %	295698309
51	NC_014109	TTTCA	2	10	75472	75481	20 %	60 %	0 %	20 %	295698309
52	NC_014109	TTGAT	2	10	79343	79352	20 %	60 %	20 %	0 %	295698312
53	NC_014109	ATATA	2	10	79806	79815	60 %	40 %	0 %	0 %	295698312
54	NC_014109	GTTAT	2	10	80218	80227	20 %	60 %	20 %	0 %	295698313
55	NC_014109	TATCA	2	10	80719	80728	40 %	40 %	0 %	20 %	295698313
56	NC_014109	TATTT	2	10	80888	80897	20 %	80 %	0 %	0 %	295698313
57	NC_014109	TTTTA	2	10	83235	83244	20 %	80 %	0 %	0 %	295698318
58	NC_014109	TTTAC	2	10	85508	85517	20 %	60 %	0 %	20 %	295698321
59	NC_014109	AAACT	2	10	86353	86362	60 %	20 %	0 %	20 %	295698322
60	NC_014109	AAAAG	2	10	88513	88522	80 %	0 %	20 %	0 %	295698325
61	NC_014109	TAACA	2	10	88817	88826	60 %	20 %	0 %	20 %	295698325
62	NC_014109	ATCAA	2	10	89926	89935	60 %	20 %	0 %	20 %	295698325
63	NC_014109	TACAA	2	10	90557	90566	60 %	20 %	0 %	20 %	295698325
64	NC_014109	TTGGA	2	10	92723	92732	20 %	40 %	40 %	0 %	295698328
65	NC_014109	TGGTT	2	10	94035	94044	0 %	60 %	40 %	0 %	295698329
66	NC_014109	TTGAT	2	10	94139	94148	20 %	60 %	20 %	0 %	295698329
67	NC_014109	AGAAA	2	10	97839	97848	80 %	0 %	20 %	0 %	295698332
68	NC_014109	TTAAT	2	10	101242	101251	40 %	60 %	0 %	0 %	295698336
69	NC_014109	AATTT	2	10	102403	102412	40 %	60 %	0 %	0 %	295698336
70	NC_014109	TATAA	2	10	103136	103145	60 %	40 %	0 %	0 %	295698337
71	NC_014109	TGAAA	2	10	103610	103619	60 %	20 %	20 %	0 %	295698337
72	NC_014109	TAATC	2	10	107657	107666	40 %	40 %	0 %	20 %	295698339
73	NC_014109	CAGAT	2	10	109330	109339	40 %	20 %	20 %	20 %	295698339
74	NC_014109	CAATT	2	10	111456	111465	40 %	40 %	0 %	20 %	295698342
75	NC_014109	AAATC	2	10	111868	111877	60 %	20 %	0 %	20 %	295698342
76	NC_014109	TGGAT	2	10	112097	112106	20 %	40 %	40 %	0 %	295698342
77	NC_014109	ATACA	2	10	113974	113983	60 %	20 %	0 %	20 %	295698344
78	NC_014109	TCTTT	2	10	114903	114912	0 %	80 %	0 %	20 %	295698344
79	NC_014109	AAAAG	2	10	117610	117619	80 %	0 %	20 %	0 %	295698346
80	NC_014109	AATCA	2	10	117874	117883	60 %	20 %	0 %	20 %	295698346
81	NC_014109	GAAAT	2	10	118511	118520	60 %	20 %	20 %	0 %	295698347
82	NC_014109	AAGAA	2	10	118527	118536	80 %	0 %	20 %	0 %	295698347
83	NC_014109	TTCGA	2	10	119925	119934	20 %	40 %	20 %	20 %	295698347
84	NC_014109	AAATT	2	10	120436	120445	60 %	40 %	0 %	0 %	295698348
85	NC_014109	TGCAA	2	10	123773	123782	40 %	20 %	20 %	20 %	295698350
86	NC_014109	AAAAT	2	10	125262	125271	80 %	20 %	0 %	0 %	295698352
87	NC_014109	ACTTT	2	10	130642	130651	20 %	60 %	0 %	20 %	295698358
88	NC_014109	TTTTA	2	10	131263	131272	20 %	80 %	0 %	0 %	295698359
89	NC_014109	TATCT	2	10	132147	132156	20 %	60 %	0 %	20 %	295698360
90	NC_014109	TTGAT	2	10	133560	133569	20 %	60 %	20 %	0 %	295698361
91	NC_014109	CTTTT	2	10	133673	133682	0 %	80 %	0 %	20 %	295698361
92	NC_014109	TTTGT	2	10	135577	135586	0 %	80 %	20 %	0 %	295698362
93	NC_014109	GAATT	2	10	136703	136712	40 %	40 %	20 %	0 %	295698365
94	NC_014109	TCTAT	2	10	136810	136819	20 %	60 %	0 %	20 %	295698365
95	NC_014109	TTAAA	2	10	137757	137766	60 %	40 %	0 %	0 %	295698365
96	NC_014109	TCTTT	2	10	138574	138583	0 %	80 %	0 %	20 %	295698366
97	NC_014109	AGAAA	2	10	139569	139578	80 %	0 %	20 %	0 %	295698367
98	NC_014109	GTAAA	2	10	141476	141485	60 %	20 %	20 %	0 %	295698368
99	NC_014109	AAAAT	2	10	142782	142791	80 %	20 %	0 %	0 %	295698370
100	NC_014109	AAGAA	2	10	142990	142999	80 %	0 %	20 %	0 %	295698370
101	NC_014109	TAGAA	2	10	143641	143650	60 %	20 %	20 %	0 %	295698370
102	NC_014109	ATTAG	2	10	144134	144143	40 %	40 %	20 %	0 %	295698371
103	NC_014109	ATCTT	2	10	145344	145353	20 %	60 %	0 %	20 %	295698372
104	NC_014109	ATTTT	2	10	145455	145464	20 %	80 %	0 %	0 %	295698372
105	NC_014109	CAAAT	2	10	148538	148547	60 %	20 %	0 %	20 %	295698375
106	NC_014109	TTGGA	2	10	148980	148989	20 %	40 %	40 %	0 %	295698375
107	NC_014109	TTTTA	2	10	149568	149577	20 %	80 %	0 %	0 %	295698376
108	NC_014109	CTTTC	2	10	150534	150543	0 %	60 %	0 %	40 %	295698376
109	NC_014109	TGATC	2	10	151203	151212	20 %	40 %	20 %	20 %	295698376
110	NC_014109	TCGAT	2	10	152267	152276	20 %	40 %	20 %	20 %	295698377
111	NC_014109	AAAAC	2	10	152478	152487	80 %	0 %	0 %	20 %	295698377
112	NC_014109	TCCAT	2	10	152929	152938	20 %	40 %	0 %	40 %	295698377
113	NC_014109	CATTG	2	10	154776	154785	20 %	40 %	20 %	20 %	295698381
114	NC_014109	AATAG	2	10	155932	155941	60 %	20 %	20 %	0 %	295698381
115	NC_014109	GAAAA	2	10	155987	155996	80 %	0 %	20 %	0 %	295698381
116	NC_014109	TCCAC	2	10	156510	156519	20 %	20 %	0 %	60 %	295698382
117	NC_014109	GAAAA	2	10	156590	156599	80 %	0 %	20 %	0 %	295698382
118	NC_014109	TTGAT	2	10	156841	156850	20 %	60 %	20 %	0 %	295698382
119	NC_014109	TTCGA	2	10	157217	157226	20 %	40 %	20 %	20 %	295698382
120	NC_014109	AAAAT	2	10	157489	157498	80 %	20 %	0 %	0 %	295698382
121	NC_014109	ACAAA	2	10	157955	157964	80 %	0 %	0 %	20 %	295698383
122	NC_014109	AGATA	2	10	160815	160824	60 %	20 %	20 %	0 %	295698385
123	NC_014109	ATTCT	2	10	162307	162316	20 %	60 %	0 %	20 %	295698385
124	NC_014109	TATTT	2	10	162543	162552	20 %	80 %	0 %	0 %	295698385
125	NC_014109	TGTAT	2	10	163770	163779	20 %	60 %	20 %	0 %	295698386
126	NC_014109	CTATG	2	10	166596	166605	20 %	40 %	20 %	20 %	295698389
127	NC_014109	TGGTT	2	10	168002	168011	0 %	60 %	40 %	0 %	295698390
128	NC_014109	GGATG	2	10	168444	168453	20 %	20 %	60 %	0 %	295698390
129	NC_014109	TGGAA	2	10	168610	168619	40 %	20 %	40 %	0 %	295698390
130	NC_014109	ATGGT	2	10	168841	168850	20 %	40 %	40 %	0 %	295698390
131	NC_014109	AAAAG	2	10	168918	168927	80 %	0 %	20 %	0 %	295698390
132	NC_014109	ATTTT	2	10	169286	169295	20 %	80 %	0 %	0 %	295698391
133	NC_014109	TACTG	2	10	170294	170303	20 %	40 %	20 %	20 %	295698393
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135	NC_014109	AGAAA	2	10	171713	171722	80 %	0 %	20 %	0 %	295698394
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