MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 2150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	ATGT	2	8	276	283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	AACT	2	8	320	327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014109	TCAA	2	8	622	629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014109	GTAA	2	8	755	762	50 %	25 %	25 %	0 %	295698241
5	NC_014109	TAAA	2	8	1349	1356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014109	TCAA	2	8	1589	1596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014109	GATC	2	8	1799	1806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014109	AGAT	2	8	1829	1836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014109	TAGG	2	8	1845	1852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014109	ATTA	2	8	2022	2029	50 %	50 %	0 %	0 %	295698242
11	NC_014109	AGAA	2	8	2055	2062	75 %	0 %	25 %	0 %	295698242
12	NC_014109	TTTC	2	8	2239	2246	0 %	75 %	0 %	25 %	295698242
13	NC_014109	AATA	2	8	2726	2733	75 %	25 %	0 %	0 %	295698242
14	NC_014109	TATC	2	8	2906	2913	25 %	50 %	0 %	25 %	295698243
15	NC_014109	TGAT	2	8	3234	3241	25 %	50 %	25 %	0 %	295698243
16	NC_014109	GATC	2	8	3781	3788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014109	TTGA	2	8	3923	3930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014109	AAAT	2	8	4081	4088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014109	TTTC	2	8	4650	4657	0 %	75 %	0 %	25 %	295698245
20	NC_014109	TCAT	2	8	4688	4695	25 %	50 %	0 %	25 %	295698245
21	NC_014109	GTTA	2	8	4953	4960	25 %	50 %	25 %	0 %	295698245
22	NC_014109	GAAG	2	8	5149	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	295698246
23	NC_014109	GAAA	2	8	5162	5169	75 %	0 %	25 %	0 %	295698246
24	NC_014109	AATC	2	8	5369	5376	50 %	25 %	0 %	25 %	295698246
25	NC_014109	ATAG	2	8	5565	5572	50 %	25 %	25 %	0 %	295698247
26	NC_014109	ATCC	2	8	5694	5701	25 %	25 %	0 %	50 %	295698247
27	NC_014109	TCTG	3	12	6130	6141	0 %	50 %	25 %	25 %	295698247
28	NC_014109	AAAG	2	8	6207	6214	75 %	0 %	25 %	0 %	295698247
29	NC_014109	CAAG	2	8	6431	6438	50 %	0 %	25 %	25 %	295698247
30	NC_014109	TCAG	2	8	6812	6819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014109	AATG	2	8	7394	7401	50 %	25 %	25 %	0 %	295698248
32	NC_014109	ATGA	2	8	7527	7534	50 %	25 %	25 %	0 %	295698248
33	NC_014109	ATTT	2	8	7697	7704	25 %	75 %	0 %	0 %	295698248
34	NC_014109	TAAA	2	8	7847	7854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014109	ATCA	2	8	7860	7867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014109	AAAT	2	8	8290	8297	75 %	25 %	0 %	0 %	295698249
37	NC_014109	TTGA	2	8	8314	8321	25 %	50 %	25 %	0 %	295698249
38	NC_014109	TATC	2	8	8331	8338	25 %	50 %	0 %	25 %	295698249
39	NC_014109	GATA	2	8	8380	8387	50 %	25 %	25 %	0 %	295698249
40	NC_014109	AAAT	2	8	8650	8657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014109	GAAA	2	8	8701	8708	75 %	0 %	25 %	0 %	295698250
42	NC_014109	AACA	2	8	9150	9157	75 %	0 %	0 %	25 %	295698250
43	NC_014109	TAAT	2	8	9519	9526	50 %	50 %	0 %	0 %	295698250
44	NC_014109	AATC	2	8	9564	9571	50 %	25 %	0 %	25 %	295698250
45	NC_014109	TGAT	2	8	9775	9782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014109	TTTA	2	8	9788	9795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014109	TCAT	2	8	10108	10115	25 %	50 %	0 %	25 %	295698251
48	NC_014109	CATT	2	8	10241	10248	25 %	50 %	0 %	25 %	295698251
49	NC_014109	CTGA	2	8	10823	10830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014109	CTTG	2	8	11204	11211	0 %	50 %	25 %	25 %	295698252
51	NC_014109	CTTT	2	8	11428	11435	0 %	75 %	0 %	25 %	295698252
52	NC_014109	CAGA	3	12	11501	11512	50 %	0 %	25 %	25 %	295698252
53	NC_014109	TGGA	2	8	11940	11947	25 %	25 %	50 %	0 %	295698252
54	NC_014109	CTAT	2	8	12070	12077	25 %	50 %	0 %	25 %	295698252
55	NC_014109	GATT	2	8	12266	12273	25 %	50 %	25 %	0 %	295698253
56	NC_014109	TTTC	2	8	12473	12480	0 %	75 %	0 %	25 %	295698253
57	NC_014109	CTTC	2	8	12486	12493	0 %	50 %	0 %	50 %	295698253
58	NC_014109	ATGA	2	8	12947	12954	50 %	25 %	25 %	0 %	295698254
59	NC_014109	GAAA	2	8	12985	12992	75 %	0 %	25 %	0 %	295698254
60	NC_014109	AATT	2	8	13319	13326	50 %	50 %	0 %	0 %	295698255
61	NC_014109	ATTT	2	8	13554	13561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014109	ATCA	2	8	13711	13718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014109	GATC	2	8	13855	13862	25 %	25 %	25 %	25 %	295698256
64	NC_014109	ATCA	2	8	14402	14409	50 %	25 %	0 %	25 %	295698256
65	NC_014109	GAAA	2	8	15397	15404	75 %	0 %	25 %	0 %	295698257
66	NC_014109	TTTC	2	8	15580	15587	0 %	75 %	0 %	25 %	295698257
67	NC_014109	TAAT	2	8	15614	15621	50 %	50 %	0 %	0 %	295698257
68	NC_014109	CCTA	2	8	15791	15798	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014109	TATC	2	8	15806	15813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014109	GATC	2	8	15837	15844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014109	TTGA	2	8	16047	16054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014109	TTTA	2	8	16287	16294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014109	TACT	2	8	16882	16889	25 %	50 %	0 %	25 %	295698258
74	NC_014109	ATTG	2	8	17016	17023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014109	AGTT	2	8	17319	17326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014109	CATA	2	8	17364	17371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014109	GAAA	2	8	17906	17913	75 %	0 %	25 %	0 %	295698259
78	NC_014109	AATA	2	8	17926	17933	75 %	25 %	0 %	0 %	295698259
79	NC_014109	AATA	2	8	18400	18407	75 %	25 %	0 %	0 %	295698261
80	NC_014109	AGGA	2	8	18822	18829	50 %	0 %	50 %	0 %	295698261
81	NC_014109	GAAA	2	8	19334	19341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014109	TCCA	2	8	19762	19769	25 %	25 %	0 %	50 %	295698262
83	NC_014109	AAGT	2	8	19887	19894	50 %	25 %	25 %	0 %	295698262
84	NC_014109	AATT	2	8	20041	20048	50 %	50 %	0 %	0 %	295698262
85	NC_014109	ATTG	2	8	20089	20096	25 %	50 %	25 %	0 %	295698262
86	NC_014109	TGAA	2	8	20108	20115	50 %	25 %	25 %	0 %	295698262
87	NC_014109	TTCA	2	8	20371	20378	25 %	50 %	0 %	25 %	295698262
88	NC_014109	AAGA	3	12	20839	20850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014109	TAAA	2	8	20953	20960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014109	ATTT	2	8	21145	21152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014109	GTAA	2	8	21407	21414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014109	GCAA	2	8	21608	21615	50 %	0 %	25 %	25 %	295698264
93	NC_014109	TGAT	2	8	21708	21715	25 %	50 %	25 %	0 %	295698264
94	NC_014109	AGGA	2	8	21903	21910	50 %	0 %	50 %	0 %	295698265
95	NC_014109	TTAA	2	8	22494	22501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014109	CAAT	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	295698267
97	NC_014109	ATGA	2	8	24134	24141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014109	ATCT	2	8	24449	24456	25 %	50 %	0 %	25 %	295698268
99	NC_014109	GATT	2	8	24562	24569	25 %	50 %	25 %	0 %	295698268
100	NC_014109	ACTA	2	8	24589	24596	50 %	25 %	0 %	25 %	295698268
101	NC_014109	AAAG	2	8	24697	24704	75 %	0 %	25 %	0 %	295698268
102	NC_014109	CTTT	2	8	24953	24960	0 %	75 %	0 %	25 %	295698268
103	NC_014109	AACT	2	8	25036	25043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014109	TTAA	2	8	25139	25146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014109	GATG	2	8	25203	25210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014109	GGTA	2	8	25438	25445	25 %	25 %	50 %	0 %	295698269
107	NC_014109	AGAA	2	8	25629	25636	75 %	0 %	25 %	0 %	295698269
108	NC_014109	ATTT	2	8	25959	25966	25 %	75 %	0 %	0 %	295698269
109	NC_014109	ATAA	2	8	26453	26460	75 %	25 %	0 %	0 %	295698269
110	NC_014109	GGAA	2	8	26518	26525	50 %	0 %	50 %	0 %	295698269
111	NC_014109	AAAG	2	8	26549	26556	75 %	0 %	25 %	0 %	295698269
112	NC_014109	TCAA	2	8	26665	26672	50 %	25 %	0 %	25 %	295698270
113	NC_014109	TAAA	2	8	27272	27279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014109	TATT	2	8	27283	27290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014109	AGAT	2	8	27669	27676	50 %	25 %	25 %	0 %	295698271
116	NC_014109	AAAG	2	8	27960	27967	75 %	0 %	25 %	0 %	295698271
117	NC_014109	ATAG	2	8	28178	28185	50 %	25 %	25 %	0 %	295698271
118	NC_014109	AATT	2	8	28186	28193	50 %	50 %	0 %	0 %	295698271
119	NC_014109	AAAT	2	8	28465	28472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014109	ATTC	2	8	28496	28503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014109	ATCT	2	8	28540	28547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014109	TAAA	2	8	29348	29355	75 %	25 %	0 %	0 %	295698272
123	NC_014109	ATTG	2	8	29824	29831	25 %	50 %	25 %	0 %	295698273
124	NC_014109	ATTG	2	8	29911	29918	25 %	50 %	25 %	0 %	295698273
125	NC_014109	TTCA	2	8	30101	30108	25 %	50 %	0 %	25 %	295698273
126	NC_014109	AATT	2	8	30849	30856	50 %	50 %	0 %	0 %	295698274
127	NC_014109	TTAT	2	8	31103	31110	25 %	75 %	0 %	0 %	295698274
128	NC_014109	AAGA	2	8	31433	31440	75 %	0 %	25 %	0 %	295698274
129	NC_014109	GATC	2	8	31529	31536	25 %	25 %	25 %	25 %	295698274
130	NC_014109	TTTC	2	8	31693	31700	0 %	75 %	0 %	25 %	295698274
131	NC_014109	CGAA	2	8	31759	31766	50 %	0 %	25 %	25 %	295698274
132	NC_014109	AAAT	2	8	31790	31797	75 %	25 %	0 %	0 %	295698274
133	NC_014109	ATTA	2	8	32017	32024	50 %	50 %	0 %	0 %	295698275
134	NC_014109	ATAA	2	8	32431	32438	75 %	25 %	0 %	0 %	295698276
135	NC_014109	CTTT	2	8	32529	32536	0 %	75 %	0 %	25 %	295698276
136	NC_014109	ATTG	2	8	33086	33093	25 %	50 %	25 %	0 %	295698276
137	NC_014109	GATC	2	8	33190	33197	25 %	25 %	25 %	25 %	295698276
138	NC_014109	TAAA	2	8	33300	33307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014109	CTAA	2	8	33385	33392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014109	AATC	2	8	33402	33409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014109	TGAA	2	8	33451	33458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014109	TAAT	2	8	33634	33641	50 %	50 %	0 %	0 %	295698277
143	NC_014109	GAAT	2	8	33826	33833	50 %	25 %	25 %	0 %	295698277
144	NC_014109	TAGA	2	8	33979	33986	50 %	25 %	25 %	0 %	295698278
145	NC_014109	GTTT	2	8	34199	34206	0 %	75 %	25 %	0 %	295698278
146	NC_014109	GAAG	2	8	34560	34567	50 %	0 %	50 %	0 %	295698278
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