MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 1209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	GAA	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014109	AAT	2	6	171	176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014109	ATT	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014109	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014109	ATA	3	9	664	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014109	ATA	2	6	690	695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014109	ATT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014109	TAG	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014109	TAT	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014109	TAG	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014109	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014109	AAG	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014109	GCT	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014109	TAA	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014109	TTG	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014109	ATT	3	9	3968	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014109	GAA	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014109	TAT	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014109	TAA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014109	ATT	2	6	4172	4177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014109	GAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014109	ACA	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014109	ATA	2	6	7749	7754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014109	TCT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014109	TAA	2	6	8571	8576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014109	ATT	2	6	8579	8584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014109	TAT	2	6	8619	8624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014109	AAT	2	6	8625	8630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014109	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014109	ATT	2	6	9889	9894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014109	TGT	2	6	10793	10798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014109	TTC	2	6	13348	13353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014109	TAT	2	6	13376	13381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014109	AAT	2	6	13465	13470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014109	TAA	3	9	13511	13519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014109	TTC	2	6	13523	13528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014109	AAT	3	9	13666	13674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014109	CAA	2	6	13695	13700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014109	TAT	2	6	13701	13706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014109	TCT	2	6	15870	15875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014109	ATT	2	6	15879	15884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014109	ACT	2	6	15904	15909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014109	ATA	2	6	15931	15936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014109	CTA	2	6	16036	16041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014109	ATT	2	6	16975	16980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014109	AAT	2	6	17461	17466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014109	ATT	2	6	17470	17475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014109	TCA	2	6	17476	17481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014109	TTC	2	6	17558	17563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014109	ATT	2	6	17652	17657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014109	ATG	2	6	18141	18146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014109	AAT	2	6	20982	20987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014109	TCC	2	6	21023	21028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014109	ATT	2	6	21087	21092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014109	GAA	2	6	22321	22326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014109	TAT	2	6	22602	22607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014109	TGA	2	6	22613	22618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014109	TTC	2	6	22627	22632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014109	TGA	2	6	22754	22759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014109	CAA	2	6	22890	22895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014109	TTA	2	6	22913	22918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014109	TAA	2	6	23850	23855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014109	CCG	2	6	23965	23970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014109	CTT	2	6	24204	24209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014109	AGA	2	6	25046	25051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014109	ATC	2	6	25278	25283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014109	TGA	2	6	27329	27334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014109	ATT	2	6	27469	27474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014109	GGA	2	6	27495	27500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014109	ATA	2	6	28582	28587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014109	TCT	2	6	30490	30495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014109	AAT	2	6	31911	31916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014109	AAC	2	6	33330	33335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014109	TCT	2	6	33359	33364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014109	CTT	2	6	33444	33449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014109	GAA	2	6	34756	34761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014109	TAA	2	6	34802	34807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014109	TTA	2	6	34813	34818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014109	TAG	2	6	35056	35061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014109	AGA	2	6	35101	35106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014109	CAC	2	6	35243	35248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014109	GGT	2	6	35288	35293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014109	TTG	2	6	35306	35311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014109	CAA	2	6	35622	35627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014109	AGC	2	6	35672	35677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014109	TCT	2	6	35678	35683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014109	ACG	2	6	35726	35731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014109	TGA	2	6	35806	35811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014109	CCG	2	6	35834	35839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014109	ACC	2	6	35921	35926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014109	CGT	2	6	35959	35964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014109	CTC	2	6	36040	36045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014109	AGG	2	6	36057	36062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014109	ACC	2	6	36065	36070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014109	GGT	2	6	36144	36149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014109	CAT	2	6	36339	36344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014109	GCC	2	6	36414	36419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014109	TAA	2	6	36539	36544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014109	ACC	2	6	36697	36702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014109	ACT	2	6	36770	36775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014109	GAC	2	6	36858	36863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014109	CTT	2	6	36884	36889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014109	TCT	2	6	37104	37109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014109	CAG	2	6	37135	37140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014109	CTG	2	6	37147	37152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014109	ATG	2	6	37236	37241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014109	GCT	2	6	37242	37247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014109	TGA	2	6	37321	37326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014109	GTT	2	6	37332	37337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014109	ACG	2	6	37347	37352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014109	AGT	2	6	37879	37884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014109	GGA	2	6	37895	37900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014109	ACT	2	6	38070	38075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014109	CTT	2	6	38214	38219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014109	CTT	2	6	38256	38261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014109	GAA	3	9	38318	38326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014109	TTC	2	6	38339	38344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014109	GAA	2	6	38349	38354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014109	CCT	2	6	38488	38493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014109	ACC	2	6	38575	38580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014109	AGG	2	6	38676	38681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014109	CTT	2	6	38783	38788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014109	ATG	2	6	39013	39018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014109	CGT	2	6	39025	39030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014109	TCT	2	6	39061	39066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014109	CAA	2	6	39091	39096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014109	GAC	2	6	39152	39157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014109	GCA	2	6	39164	39169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014109	ACT	2	6	39368	39373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014109	CCT	2	6	39386	39391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014109	TCC	2	6	39504	39509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014109	ACC	2	6	39630	39635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014109	GCT	2	6	39694	39699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014109	CTT	2	6	39719	39724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014109	GAA	2	6	39743	39748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014109	TTC	2	6	39767	39772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014109	CTT	2	6	39803	39808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014109	CTG	2	6	39862	39867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014109	GTC	2	6	39912	39917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014109	TTG	2	6	39937	39942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014109	CTA	2	6	39965	39970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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