MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	TA	3	6	65	70	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	AT	3	6	121	126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014109	AT	3	6	558	563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014109	AT	3	6	1277	1282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014109	TA	3	6	1471	1476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014109	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014109	CT	3	6	7947	7952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014109	AT	3	6	8641	8646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014109	AG	3	6	9690	9695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014109	GA	3	6	16148	16153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014109	AT	3	6	16166	16171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014109	AT	3	6	16361	16366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014109	TA	3	6	17082	17087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014109	AT	3	6	17520	17525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014109	TA	3	6	17576	17581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014109	AT	3	6	21157	21162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014109	GA	3	6	22547	22552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014109	AT	3	6	22684	22689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014109	AG	3	6	22702	22707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014109	AT	3	6	25402	25407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014109	TA	3	6	28621	28626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014109	AT	4	8	34717	34724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014109	AT	3	6	35384	35389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014109	TC	3	6	35427	35432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014109	TC	3	6	36667	36672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014109	GT	3	6	37369	37374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014109	AT	3	6	38361	38366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014109	TA	3	6	38438	38443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014109	GT	3	6	38819	38824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014109	TC	3	6	38962	38967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014109	GT	3	6	38988	38993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014109	TA	3	6	40282	40287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014109	AT	3	6	40291	40296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014109	TG	3	6	40310	40315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014109	TA	3	6	40511	40516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014109	AG	3	6	45113	45118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014109	GA	3	6	46885	46890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014109	CT	3	6	46923	46928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014109	TA	3	6	47851	47856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014109	TC	3	6	48323	48328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014109	AT	3	6	48391	48396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014109	TC	3	6	48519	48524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014109	TA	3	6	51836	51841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014109	AT	3	6	53848	53853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014109	AT	3	6	53858	53863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014109	TA	3	6	54046	54051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014109	TA	3	6	54110	54115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014109	TA	3	6	56850	56855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014109	AT	3	6	57402	57407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014109	TC	6	12	57887	57898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014109	GA	3	6	57901	57906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014109	AG	3	6	58031	58036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014109	AT	4	8	58124	58131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014109	TC	3	6	58278	58283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014109	AT	3	6	58652	58657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014109	CT	3	6	58751	58756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014109	TC	3	6	59115	59120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014109	AT	3	6	63954	63959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014109	TA	3	6	64005	64010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014109	AT	3	6	66605	66610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014109	AT	3	6	70099	70104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014109	AT	3	6	70181	70186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014109	AT	3	6	71716	71721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014109	AT	3	6	72940	72945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014109	AT	3	6	73063	73068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014109	TA	3	6	73260	73265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014109	AT	3	6	75970	75975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014109	AT	3	6	76028	76033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014109	TA	3	6	83865	83870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014109	AT	3	6	84411	84416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014109	CT	3	6	84710	84715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014109	AT	3	6	86591	86596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014109	TC	3	6	86606	86611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014109	TA	4	8	86828	86835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014109	TC	3	6	87345	87350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014109	TA	3	6	87450	87455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014109	TA	3	6	93539	93544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014109	AT	3	6	93555	93560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014109	AT	3	6	93620	93625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014109	GT	3	6	93728	93733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014109	TC	3	6	95952	95957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014109	TA	3	6	100141	100146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014109	TA	3	6	102828	102833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014109	CA	3	6	106175	106180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014109	TA	3	6	106822	106827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014109	TA	3	6	122981	122986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014109	AT	3	6	124198	124203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014109	TC	3	6	124273	124278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014109	GA	3	6	126557	126562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014109	TA	3	6	128979	128984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014109	TC	3	6	128991	128996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014109	TG	3	6	129011	129016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014109	GA	3	6	129339	129344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014109	AT	3	6	136109	136114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014109	AT	3	6	140570	140575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014109	GA	3	6	140646	140651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014109	TA	3	6	140727	140732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014109	CT	3	6	140759	140764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014109	TC	3	6	140887	140892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014109	TA	3	6	143740	143745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014109	TA	3	6	152071	152076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014109	TA	3	6	152219	152224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014109	TA	3	6	153367	153372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014109	AT	3	6	153447	153452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014109	AT	3	6	153461	153466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014109	TA	3	6	153569	153574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014109	TG	3	6	153627	153632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_014109	TA	3	6	165444	165449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014109	TA	3	6	165770	165775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014109	AT	3	6	183408	183413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014109	AT	3	6	186317	186322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014109	AT	3	6	186427	186432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014109	AT	3	6	186608	186613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014109	AT	3	6	187123	187128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014109	AT	3	6	187353	187358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014109	AT	3	6	187712	187717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014109	TC	3	6	187830	187835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014109	TC	3	6	187868	187873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014109	AT	3	6	188923	188928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014109	AT	3	6	190680	190685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014109	AT	3	6	191740	191745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014109	AT	3	6	191858	191863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014109	TA	3	6	191983	191988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014109	AT	3	6	192343	192348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014109	AT	3	6	193375	193380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014109	TA	3	6	193502	193507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014109	TA	3	6	193663	193668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014109	CT	3	6	194647	194652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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132	NC_014109	TA	3	6	201070	201075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_014109	AT	3	6	207245	207250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014109	TA	3	6	211147	211152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014109	TC	3	6	211283	211288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014109	TA	4	8	211491	211498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014109	AG	3	6	217079	217084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014109	AT	3	6	217147	217152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014109	AT	3	6	218061	218066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014109	TA	3	6	221627	221632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014109	AG	3	6	227064	227069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014109	AT	3	6	227671	227676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014109	TA	3	6	240388	240393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014109	AT	3	6	241912	241917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014109	AC	3	6	241921	241926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_014109	CT	3	6	242216	242221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014109	AT	3	6	247453	247458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014109	AT	3	6	250006	250011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_014109	TC	4	8	256259	256266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014109	AT	3	6	258099	258104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014109	CA	3	6	258380	258385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014109	AT	3	6	266616	266621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014109	CT	4	8	275374	275381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.