MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047 plasmid pECL_B

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014108	GAAGC	2	10	218	227	40 %	0 %	40 %	20 %	295698115
2	NC_014108	GAAAA	2	10	5713	5722	80 %	0 %	20 %	0 %	295698126
3	NC_014108	TTTCA	2	10	7058	7067	20 %	60 %	0 %	20 %	295698130
4	NC_014108	GAAGC	2	10	9048	9057	40 %	0 %	40 %	20 %	295698135
5	NC_014108	GTTTA	2	10	11318	11327	20 %	60 %	20 %	0 %	295698139
6	NC_014108	GGCCA	2	10	12045	12054	20 %	0 %	40 %	40 %	295698141
7	NC_014108	CAAAT	2	10	12821	12830	60 %	20 %	0 %	20 %	295698142
8	NC_014108	GCCAT	2	10	13133	13142	20 %	20 %	20 %	40 %	295698143
9	NC_014108	AGGGG	2	10	14077	14086	20 %	0 %	80 %	0 %	295698145
10	NC_014108	AGCTG	2	10	14979	14988	20 %	20 %	40 %	20 %	295698146
11	NC_014108	CGCAG	2	10	15377	15386	20 %	0 %	40 %	40 %	295698147
12	NC_014108	TGAAG	2	10	15906	15915	40 %	20 %	40 %	0 %	295698148
13	NC_014108	CGCTG	2	10	16227	16236	0 %	20 %	40 %	40 %	295698148
14	NC_014108	GAAAT	2	10	18965	18974	60 %	20 %	20 %	0 %	295698155
15	NC_014108	TTGTA	2	10	20625	20634	20 %	60 %	20 %	0 %	295698160
16	NC_014108	TTGTT	2	10	25999	26008	0 %	80 %	20 %	0 %	295698167
17	NC_014108	CTTTT	2	10	27607	27616	0 %	80 %	0 %	20 %	295698170
18	NC_014108	AAAGC	2	10	33102	33111	60 %	0 %	20 %	20 %	295698180
19	NC_014108	CTGAT	2	10	34800	34809	20 %	40 %	20 %	20 %	295698182
20	NC_014108	CCTTT	2	10	35063	35072	0 %	60 %	0 %	40 %	295698182
21	NC_014108	GCCCT	2	10	35378	35387	0 %	20 %	20 %	60 %	295698182
22	NC_014108	AAACG	2	10	37629	37638	60 %	0 %	20 %	20 %	295698183
23	NC_014108	CTCTG	2	10	39490	39499	0 %	40 %	20 %	40 %	295698184
24	NC_014108	GAAGG	2	10	40078	40087	40 %	0 %	60 %	0 %	295698184
25	NC_014108	AATCA	2	10	40666	40675	60 %	20 %	0 %	20 %	295698184
26	NC_014108	GAAAA	2	10	41439	41448	80 %	0 %	20 %	0 %	295698185
27	NC_014108	GCGAA	2	10	43873	43882	40 %	0 %	40 %	20 %	295698188
28	NC_014108	AAGAA	2	10	44311	44320	80 %	0 %	20 %	0 %	295698189
29	NC_014108	GCAAG	2	10	48834	48843	40 %	0 %	40 %	20 %	295698192
30	NC_014108	CCCTC	2	10	50507	50516	0 %	20 %	0 %	80 %	295698192
31	NC_014108	CGCAG	2	10	50589	50598	20 %	0 %	40 %	40 %	295698192
32	NC_014108	TCCCC	2	10	51803	51812	0 %	20 %	0 %	80 %	295698195
33	NC_014108	GCATT	2	10	52933	52942	20 %	40 %	20 %	20 %	295698197
34	NC_014108	CGTTG	2	10	53641	53650	0 %	40 %	40 %	20 %	295698199
35	NC_014108	GCCGC	2	10	54274	54283	0 %	0 %	40 %	60 %	295698199
36	NC_014108	ATGAA	2	10	55351	55360	60 %	20 %	20 %	0 %	295698200
37	NC_014108	CAGAA	2	10	55503	55512	60 %	0 %	20 %	20 %	295698200
38	NC_014108	TGCGT	2	10	55599	55608	0 %	40 %	40 %	20 %	295698200
39	NC_014108	ATGGG	2	10	56440	56449	20 %	20 %	60 %	0 %	295698200
40	NC_014108	GCCCC	2	10	57047	57056	0 %	0 %	20 %	80 %	295698200
41	NC_014108	TTAAA	2	10	57558	57567	60 %	40 %	0 %	0 %	295698201
42	NC_014108	ACGCA	2	10	57953	57962	40 %	0 %	20 %	40 %	295698202
43	NC_014108	AACAA	2	10	58597	58606	80 %	0 %	0 %	20 %	295698203
44	NC_014108	ACGGT	2	10	59230	59239	20 %	20 %	40 %	20 %	295698203
45	NC_014108	GTTCC	2	10	60602	60611	0 %	40 %	20 %	40 %	295698206
46	NC_014108	CTTTT	2	10	61919	61928	0 %	80 %	0 %	20 %	295698208
47	NC_014108	GGCCG	2	10	62104	62113	0 %	0 %	60 %	40 %	295698208
48	NC_014108	TTTTC	2	10	62743	62752	0 %	80 %	0 %	20 %	295698209
49	NC_014108	GTTCT	2	10	63797	63806	0 %	60 %	20 %	20 %	295698211
50	NC_014108	AGCTC	2	10	65402	65411	20 %	20 %	20 %	40 %	295698214
51	NC_014108	CTGGC	2	10	65852	65861	0 %	20 %	40 %	40 %	295698215
52	NC_014108	CGATG	2	10	67481	67490	20 %	20 %	40 %	20 %	295698218
53	NC_014108	GCATG	2	10	68054	68063	20 %	20 %	40 %	20 %	295698219
54	NC_014108	TCAGT	2	10	70228	70237	20 %	40 %	20 %	20 %	295698222
55	NC_014108	TTCAC	2	10	71316	71325	20 %	40 %	0 %	40 %	295698224
56	NC_014108	TTCGA	2	10	71867	71876	20 %	40 %	20 %	20 %	295698225
57	NC_014108	AATGA	2	10	73298	73307	60 %	20 %	20 %	0 %	295698228
58	NC_014108	CCTGG	2	10	74927	74936	0 %	20 %	40 %	40 %	295698230
59	NC_014108	TTTCC	2	10	76650	76659	0 %	60 %	0 %	40 %	295698230
60	NC_014108	CTTTT	2	10	79998	80007	0 %	80 %	0 %	20 %	295698231
61	NC_014108	GCGGG	2	10	82272	82281	0 %	0 %	80 %	20 %	295698233
62	NC_014108	GGCGC	2	10	82339	82348	0 %	0 %	60 %	40 %	295698233

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.