MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047 plasmid pECL_A

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014107	CAAGAA	2	12	2841	2852	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	295697843
2	NC_014107	TCAGGC	2	12	9156	9167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295697853
3	NC_014107	CGGCAA	2	12	13052	13063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295697858
4	NC_014107	TAGGTG	2	12	13252	13263	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	295697858
5	NC_014107	TTCATT	2	12	13294	13305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295697858
6	NC_014107	TTGATG	2	12	19145	19156	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295697866
7	NC_014107	CCCACC	2	12	20380	20391	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	295697867
8	NC_014107	GATATC	2	12	23415	23426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295697869
9	NC_014107	ACATAC	2	12	25315	25326	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	295697869
10	NC_014107	TCCATA	2	12	26684	26695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295697870
11	NC_014107	TAATTT	2	12	28765	28776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295697872
12	NC_014107	GATTGC	2	12	30208	30219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295697875
13	NC_014107	CATCGT	4	24	32043	32066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295697877
14	NC_014107	CTGGTC	2	12	34684	34695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295697881
15	NC_014107	ACCTTG	2	12	36897	36908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295697884
16	NC_014107	GACGGT	2	12	37427	37438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	295697885
17	NC_014107	TATGAA	2	12	41376	41387	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295697896
18	NC_014107	ATACGG	2	12	41472	41483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295697896
19	NC_014107	ATCTGT	2	12	45939	45950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295697903
20	NC_014107	CAGCTG	2	12	48550	48561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295697905
21	NC_014107	CCGCAA	2	12	50972	50983	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	295697907
22	NC_014107	GCTGGC	2	12	51218	51229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295697907
23	NC_014107	AAATGA	2	12	54927	54938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295697915
24	NC_014107	TACGCC	2	12	55645	55656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295697918
25	NC_014107	ACCATG	2	12	55856	55867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295697918
26	NC_014107	ACGTCA	2	12	57449	57460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295697924
27	NC_014107	GTCACC	2	12	57562	57573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295697924
28	NC_014107	AGCAGG	2	12	59083	59094	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	295697926
29	NC_014107	GCTGGG	2	12	59095	59106	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	295697926
30	NC_014107	ATGGCG	2	12	61919	61930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	295697931
31	NC_014107	GAAAGC	2	12	64228	64239	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295697935
32	NC_014107	ATAAAG	2	12	67955	67966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295697938
33	NC_014107	CCCATG	2	12	68833	68844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295697940
34	NC_014107	TTCATC	2	12	71592	71603	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	295697943
35	NC_014107	CCTGAT	2	12	81924	81935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295697957
36	NC_014107	GCGCAG	2	12	82060	82071	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	295697957
37	NC_014107	TTTGAT	2	12	82321	82332	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295697957
38	NC_014107	GTTCTG	2	12	82669	82680	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	295697958
39	NC_014107	CAGCGG	2	12	83191	83202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	295697958
40	NC_014107	GCTGGG	2	12	83353	83364	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	295697958
41	NC_014107	GCTTCG	2	12	86955	86966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295697963
42	NC_014107	ACGTCA	2	12	91328	91339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295697971
43	NC_014107	ACGTCA	2	12	94350	94361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295697977
44	NC_014107	AATTGA	2	12	95905	95916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295697979
45	NC_014107	GGCTCT	2	12	98078	98089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295697985
46	NC_014107	GCGCGA	2	12	99749	99760	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	295697988
47	NC_014107	ACGCCA	2	12	100533	100544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	295697989
48	NC_014107	CGAAAG	2	12	101103	101114	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295697989
49	NC_014107	CGGCAT	2	12	104672	104683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295697997
50	NC_014107	TATCAC	2	12	106074	106085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295697997
51	NC_014107	GGAAGC	2	12	106116	106127	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	295697997
52	NC_014107	GCAGCT	2	12	106709	106720	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295697998
53	NC_014107	TTTCCG	2	12	110946	110957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295698006
54	NC_014107	GATGCT	2	12	111504	111515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295698007
55	NC_014107	TTCTAC	2	12	113793	113804	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	295698008
56	NC_014107	TCACCG	2	12	115626	115637	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295698012
57	NC_014107	GGCAGG	2	12	116229	116240	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	295698014
58	NC_014107	AAAAAC	2	12	116732	116743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	295698014
59	NC_014107	ACGCAG	2	12	118957	118968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698015
60	NC_014107	AGCCAT	2	12	120457	120468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295698015
61	NC_014107	GCTGAA	2	12	120742	120753	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295698015
62	NC_014107	GGAAAC	2	12	129165	129176	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295698020
63	NC_014107	GGCGCT	2	12	130125	130136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295698020
64	NC_014107	CAGATG	2	12	130625	130636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295698020
65	NC_014107	CGGTGG	2	12	133658	133669	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	295698025
66	NC_014107	GCTGGC	2	12	138476	138487	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295698031
67	NC_014107	GTTCAG	2	12	140807	140818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295698033
68	NC_014107	CGTCAC	2	12	142606	142617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295698035
69	NC_014107	CTGAAC	2	12	145738	145749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295698040
70	NC_014107	GTGACG	2	12	151364	151375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	295698046
71	NC_014107	CAAAAA	2	12	152934	152945	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	295698048
72	NC_014107	TTCGAT	2	12	153112	153123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295698048
73	NC_014107	GGTGAT	2	12	154676	154687	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	295698050
74	NC_014107	TGGCGT	2	12	161998	162009	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	295698062
75	NC_014107	GCGCCC	2	12	164938	164949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698064
76	NC_014107	GGTCGG	2	12	165115	165126	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	295698064
77	NC_014107	TCCTCT	2	12	182356	182367	0 %	50 %	0 %	50 %	295698087
78	NC_014107	GCTATC	2	12	183199	183210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295698088
79	NC_014107	CTAACA	2	12	191193	191204	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	295698101
80	NC_014107	CGTAAA	2	12	191246	191257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295698101
81	NC_014107	TTGAAG	2	12	192518	192529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698103
82	NC_014107	CATTAA	2	12	195536	195547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295698108

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.