MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 1677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014106	TGATT	2	10	2127	2136	20 %	60 %	20 %	0 %	295691864
2	NC_014106	ATTTT	2	10	3459	3468	20 %	80 %	0 %	0 %	295691866
3	NC_014106	GATGA	2	10	4749	4758	40 %	20 %	40 %	0 %	295691867
4	NC_014106	TCTGG	2	10	5493	5502	0 %	40 %	40 %	20 %	295691867
5	NC_014106	CAGAC	2	10	7114	7123	40 %	0 %	20 %	40 %	295691868
6	NC_014106	AGGAA	2	10	9245	9254	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014106	AGGAC	2	10	10070	10079	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014106	ATTCA	2	10	11232	11241	40 %	40 %	0 %	20 %	295691873
9	NC_014106	CGAGG	2	10	14411	14420	20 %	0 %	60 %	20 %	295691875
10	NC_014106	CAAAA	2	10	14997	15006	80 %	0 %	0 %	20 %	295691875
11	NC_014106	AGTTA	2	10	17862	17871	40 %	40 %	20 %	0 %	295691878
12	NC_014106	TTGAT	2	10	18561	18570	20 %	60 %	20 %	0 %	295691879
13	NC_014106	AAAAC	2	10	21204	21213	80 %	0 %	0 %	20 %	295691883
14	NC_014106	AGCCT	2	10	23187	23196	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014106	TAGTT	2	10	23921	23930	20 %	60 %	20 %	0 %	295691886
16	NC_014106	GGCTT	2	10	26023	26032	0 %	40 %	40 %	20 %	295691889
17	NC_014106	TTATA	2	10	26680	26689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014106	AAATC	2	10	29264	29273	60 %	20 %	0 %	20 %	295691891
19	NC_014106	AAATC	2	10	29549	29558	60 %	20 %	0 %	20 %	295691891
20	NC_014106	AAATC	2	10	29834	29843	60 %	20 %	0 %	20 %	295691891
21	NC_014106	GAAAC	2	10	32079	32088	60 %	0 %	20 %	20 %	295691895
22	NC_014106	AGTTG	2	10	32306	32315	20 %	40 %	40 %	0 %	295691895
23	NC_014106	TAATA	2	10	35684	35693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014106	AGTTC	2	10	36592	36601	20 %	40 %	20 %	20 %	295691899
25	NC_014106	GAATC	2	10	37345	37354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014106	GATTC	2	10	37360	37369	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014106	CTTAA	2	10	37400	37409	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014106	GATCT	2	10	40058	40067	20 %	40 %	20 %	20 %	295691902
29	NC_014106	TTTTC	2	10	40111	40120	0 %	80 %	0 %	20 %	295691902
30	NC_014106	AAAAC	2	10	40256	40265	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014106	ATTTA	2	10	42700	42709	40 %	60 %	0 %	0 %	295691904
32	NC_014106	TAGTT	2	10	42955	42964	20 %	60 %	20 %	0 %	295691904
33	NC_014106	ATTTT	2	10	43323	43332	20 %	80 %	0 %	0 %	295691905
34	NC_014106	AAAAG	2	10	45665	45674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014106	GAAAA	2	10	47958	47967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014106	ATTAG	2	10	49945	49954	40 %	40 %	20 %	0 %	295691911
37	NC_014106	TTAAT	2	10	50938	50947	40 %	60 %	0 %	0 %	295691912
38	NC_014106	GTGAA	2	10	51406	51415	40 %	20 %	40 %	0 %	295691913
39	NC_014106	TCAAA	2	10	52597	52606	60 %	20 %	0 %	20 %	295691914
40	NC_014106	GTTTT	2	10	56618	56627	0 %	80 %	20 %	0 %	295691918
41	NC_014106	AGGCA	2	10	58791	58800	40 %	0 %	40 %	20 %	295691918
42	NC_014106	TAATG	2	10	60603	60612	40 %	40 %	20 %	0 %	295691920
43	NC_014106	TTTAA	2	10	62026	62035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014106	GGTAA	2	10	62792	62801	40 %	20 %	40 %	0 %	295691923
45	NC_014106	TCGTG	2	10	63609	63618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014106	GGCAG	2	10	64008	64017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014106	AAAAT	2	10	64328	64337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014106	GAGAA	2	10	64515	64524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014106	AAGGC	2	10	65917	65926	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014106	TTGAA	2	10	66427	66436	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014106	GCCAG	2	10	66759	66768	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014106	AGGAA	2	10	67611	67620	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014106	AAAGA	2	10	70296	70305	80 %	0 %	20 %	0 %	295691930
54	NC_014106	ATTGA	2	10	70592	70601	40 %	40 %	20 %	0 %	295691930
55	NC_014106	ACTGT	2	10	72628	72637	20 %	40 %	20 %	20 %	295691932
56	NC_014106	ATTTA	2	10	73069	73078	40 %	60 %	0 %	0 %	295691933
57	NC_014106	ATTTT	2	10	74250	74259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014106	ATTTA	2	10	74607	74616	40 %	60 %	0 %	0 %	295691935
59	NC_014106	AATCC	2	10	75193	75202	40 %	20 %	0 %	40 %	295691935
60	NC_014106	GATTT	2	10	76298	76307	20 %	60 %	20 %	0 %	295691936
61	NC_014106	AAAGA	2	10	76760	76769	80 %	0 %	20 %	0 %	295691936
62	NC_014106	CGAAT	2	10	78548	78557	40 %	20 %	20 %	20 %	295691938
63	NC_014106	AATGA	2	10	78674	78683	60 %	20 %	20 %	0 %	295691938
64	NC_014106	ATTCC	2	10	84593	84602	20 %	40 %	0 %	40 %	295691944
65	NC_014106	AACTA	2	10	85050	85059	60 %	20 %	0 %	20 %	295691944
66	NC_014106	ATTTA	2	10	86611	86620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014106	TTCTT	2	10	88549	88558	0 %	80 %	0 %	20 %	295691948
68	NC_014106	AACCA	2	10	92872	92881	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014106	TACTT	2	10	95316	95325	20 %	60 %	0 %	20 %	295691954
70	NC_014106	AAAAC	2	10	98075	98084	80 %	0 %	0 %	20 %	295691957
71	NC_014106	AACTT	2	10	101448	101457	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014106	AAATT	2	10	102205	102214	60 %	40 %	0 %	0 %	295691962
73	NC_014106	TTCTT	2	10	102478	102487	0 %	80 %	0 %	20 %	295691962
74	NC_014106	TTAAT	2	10	102757	102766	40 %	60 %	0 %	0 %	295691963
75	NC_014106	TAATT	2	10	103365	103374	40 %	60 %	0 %	0 %	295691964
76	NC_014106	AATTA	2	10	104314	104323	60 %	40 %	0 %	0 %	295691965
77	NC_014106	TTGTT	2	10	104649	104658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014106	TTCAT	2	10	108895	108904	20 %	60 %	0 %	20 %	295691970
79	NC_014106	ATAAA	2	10	111065	111074	80 %	20 %	0 %	0 %	295691972
80	NC_014106	ATTAA	2	10	111668	111677	60 %	40 %	0 %	0 %	295691973
81	NC_014106	TAAAA	2	10	112411	112420	80 %	20 %	0 %	0 %	295691974
82	NC_014106	CAAAA	2	10	112832	112841	80 %	0 %	0 %	20 %	295691975
83	NC_014106	ATTTT	2	10	113010	113019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014106	TTTAG	2	10	113786	113795	20 %	60 %	20 %	0 %	295691976
85	NC_014106	ATTAA	2	10	115181	115190	60 %	40 %	0 %	0 %	295691978
86	NC_014106	GTAAA	2	10	117165	117174	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014106	TAGTA	2	10	117330	117339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014106	TGATT	2	10	117921	117930	20 %	60 %	20 %	0 %	295691980
89	NC_014106	TCCTA	2	10	118285	118294	20 %	40 %	0 %	40 %	295691980
90	NC_014106	TGAGG	2	10	119006	119015	20 %	20 %	60 %	0 %	295691981
91	NC_014106	TCATT	2	10	119598	119607	20 %	60 %	0 %	20 %	295691982
92	NC_014106	GAAAA	2	10	119993	120002	80 %	0 %	20 %	0 %	295691983
93	NC_014106	ATGGA	2	10	122581	122590	40 %	20 %	40 %	0 %	295691985
94	NC_014106	TGATT	2	10	123422	123431	20 %	60 %	20 %	0 %	295691986
95	NC_014106	CTTTA	2	10	125585	125594	20 %	60 %	0 %	20 %	295691987
96	NC_014106	GAAAT	2	10	130442	130451	60 %	20 %	20 %	0 %	295691992
97	NC_014106	AAGAT	2	10	131967	131976	60 %	20 %	20 %	0 %	295691994
98	NC_014106	AATGG	2	10	132436	132445	40 %	20 %	40 %	0 %	295691994
99	NC_014106	ATAAG	2	10	132719	132728	60 %	20 %	20 %	0 %	295691995
100	NC_014106	CAAGT	2	10	132905	132914	40 %	20 %	20 %	20 %	295691996
101	NC_014106	TTATA	2	10	135810	135819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014106	AATTA	2	10	135886	135895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014106	ACAGA	2	10	135974	135983	60 %	0 %	20 %	20 %	295691997
104	NC_014106	ATGGC	2	10	136823	136832	20 %	20 %	40 %	20 %	295691997
105	NC_014106	TAGGA	2	10	137733	137742	40 %	20 %	40 %	0 %	295691998
106	NC_014106	TTTAC	2	10	141230	141239	20 %	60 %	0 %	20 %	295692001
107	NC_014106	TAATT	2	10	141918	141927	40 %	60 %	0 %	0 %	295692001
108	NC_014106	TGAAA	2	10	142587	142596	60 %	20 %	20 %	0 %	295692002
109	NC_014106	TTTAC	2	10	147619	147628	20 %	60 %	0 %	20 %	295692008
110	NC_014106	GATCT	2	10	149659	149668	20 %	40 %	20 %	20 %	295692011
111	NC_014106	TTGGT	2	10	150098	150107	0 %	60 %	40 %	0 %	295692011
112	NC_014106	CCTTT	2	10	153781	153790	0 %	60 %	0 %	40 %	295692015
113	NC_014106	GCTAA	2	10	155015	155024	40 %	20 %	20 %	20 %	295692015
114	NC_014106	GTATG	2	10	155116	155125	20 %	40 %	40 %	0 %	295692016
115	NC_014106	CCATT	2	10	159985	159994	20 %	40 %	0 %	40 %	295692019
116	NC_014106	TAATT	2	10	160578	160587	40 %	60 %	0 %	0 %	295692020
117	NC_014106	CTAGA	2	10	161337	161346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014106	GCACA	2	10	161386	161395	40 %	0 %	20 %	40 %	295692021
119	NC_014106	TAAAA	2	10	162592	162601	80 %	20 %	0 %	0 %	295692021
120	NC_014106	CATAT	2	10	163660	163669	40 %	40 %	0 %	20 %	295692022
121	NC_014106	CGTCC	2	10	165044	165053	0 %	20 %	20 %	60 %	295692023
122	NC_014106	CATAA	2	10	166722	166731	60 %	20 %	0 %	20 %	295692023
123	NC_014106	TTCTT	2	10	167454	167463	0 %	80 %	0 %	20 %	295692024
124	NC_014106	AAGTG	2	10	167969	167978	40 %	20 %	40 %	0 %	295692025
125	NC_014106	CTTAA	2	10	171283	171292	40 %	40 %	0 %	20 %	295692033
126	NC_014106	ATTAC	2	10	173756	173765	40 %	40 %	0 %	20 %	295692034
127	NC_014106	GTCCA	2	10	174939	174948	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014106	ATTAG	2	10	175854	175863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014106	TGGTT	2	10	177114	177123	0 %	60 %	40 %	0 %	295692038
130	NC_014106	TGATT	2	10	178666	178675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014106	TATCT	2	10	178794	178803	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014106	TAAAA	2	10	180851	180860	80 %	20 %	0 %	0 %	295692040
133	NC_014106	CTTTT	2	10	181450	181459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014106	TTTAT	2	10	182606	182615	20 %	80 %	0 %	0 %	295692042
135	NC_014106	ATGGG	2	10	182770	182779	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014106	ACTTG	2	10	190057	190066	20 %	40 %	20 %	20 %	295692050
137	NC_014106	ATTTT	2	10	190329	190338	20 %	80 %	0 %	0 %	295692051
138	NC_014106	TGATA	2	10	190484	190493	40 %	40 %	20 %	0 %	295692051
139	NC_014106	TGTTT	2	10	190998	191007	0 %	80 %	20 %	0 %	295692051
140	NC_014106	GGTTG	2	10	191306	191315	0 %	40 %	60 %	0 %	295692052
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142	NC_014106	CAATG	2	10	193760	193769	40 %	20 %	20 %	20 %	295692054
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146	NC_014106	ATGGA	2	10	197933	197942	40 %	20 %	40 %	0 %	295692057
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148	NC_014106	TACTT	2	10	200984	200993	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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