MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 5929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014106	ATCT	2	8	176	183	25 %	50 %	0 %	25 %	295691863
2	NC_014106	TTTA	2	8	462	469	25 %	75 %	0 %	0 %	295691863
3	NC_014106	CATG	2	8	1275	1282	25 %	25 %	25 %	25 %	295691863
4	NC_014106	ATTA	2	8	1485	1492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014106	AAAG	2	8	1825	1832	75 %	0 %	25 %	0 %	295691864
6	NC_014106	TTCA	2	8	1929	1936	25 %	50 %	0 %	25 %	295691864
7	NC_014106	ATCA	2	8	2423	2430	50 %	25 %	0 %	25 %	295691864
8	NC_014106	AATT	2	8	2645	2652	50 %	50 %	0 %	0 %	295691864
9	NC_014106	TATT	2	8	2763	2770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014106	GAAG	2	8	2955	2962	50 %	0 %	50 %	0 %	295691865
11	NC_014106	AAAT	2	8	3541	3548	75 %	25 %	0 %	0 %	295691866
12	NC_014106	AAGT	2	8	3569	3576	50 %	25 %	25 %	0 %	295691866
13	NC_014106	GACT	2	8	4154	4161	25 %	25 %	25 %	25 %	295691866
14	NC_014106	GTAT	2	8	4369	4376	25 %	50 %	25 %	0 %	295691867
15	NC_014106	AAGA	2	8	5483	5490	75 %	0 %	25 %	0 %	295691867
16	NC_014106	ATCT	2	8	6483	6490	25 %	50 %	0 %	25 %	295691868
17	NC_014106	ATTG	2	8	6657	6664	25 %	50 %	25 %	0 %	295691868
18	NC_014106	CTTG	2	8	6725	6732	0 %	50 %	25 %	25 %	295691868
19	NC_014106	TCAA	2	8	7427	7434	50 %	25 %	0 %	25 %	295691868
20	NC_014106	TTGA	2	8	7725	7732	25 %	50 %	25 %	0 %	295691868
21	NC_014106	TTAA	2	8	8598	8605	50 %	50 %	0 %	0 %	295691868
22	NC_014106	AAAG	2	8	9793	9800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014106	TCTT	2	8	10293	10300	0 %	75 %	0 %	25 %	295691872
24	NC_014106	TAAA	2	8	10526	10533	75 %	25 %	0 %	0 %	295691872
25	NC_014106	ATCA	2	8	11114	11121	50 %	25 %	0 %	25 %	295691873
26	NC_014106	TAAA	3	12	11640	11651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014106	GAAT	2	8	12365	12372	50 %	25 %	25 %	0 %	295691874
28	NC_014106	ACTT	2	8	13849	13856	25 %	50 %	0 %	25 %	295691875
29	NC_014106	TTAC	2	8	14346	14353	25 %	50 %	0 %	25 %	295691875
30	NC_014106	TTAC	2	8	14629	14636	25 %	50 %	0 %	25 %	295691875
31	NC_014106	AGGA	2	8	15048	15055	50 %	0 %	50 %	0 %	295691875
32	NC_014106	GTTT	2	8	15329	15336	0 %	75 %	25 %	0 %	295691876
33	NC_014106	TGAT	2	8	15530	15537	25 %	50 %	25 %	0 %	295691877
34	NC_014106	GCTA	2	8	16573	16580	25 %	25 %	25 %	25 %	295691877
35	NC_014106	TTTC	2	8	16707	16714	0 %	75 %	0 %	25 %	295691877
36	NC_014106	CATG	2	8	18571	18578	25 %	25 %	25 %	25 %	295691879
37	NC_014106	GATG	2	8	18601	18608	25 %	25 %	50 %	0 %	295691879
38	NC_014106	TACA	2	8	19085	19092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014106	CGAT	2	8	19381	19388	25 %	25 %	25 %	25 %	295691880
40	NC_014106	TGAA	2	8	19975	19982	50 %	25 %	25 %	0 %	295691880
41	NC_014106	AAGA	2	8	20110	20117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014106	TGGT	2	8	20565	20572	0 %	50 %	50 %	0 %	295691882
43	NC_014106	GAGC	2	8	21174	21181	25 %	0 %	50 %	25 %	295691883
44	NC_014106	AGGT	2	8	21333	21340	25 %	25 %	50 %	0 %	295691883
45	NC_014106	TAAA	2	8	21503	21510	75 %	25 %	0 %	0 %	295691883
46	NC_014106	GAAG	2	8	21819	21826	50 %	0 %	50 %	0 %	295691883
47	NC_014106	AAAG	2	8	21945	21952	75 %	0 %	25 %	0 %	295691883
48	NC_014106	ATTA	2	8	22006	22013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014106	CATG	2	8	22586	22593	25 %	25 %	25 %	25 %	295691884
50	NC_014106	TTTG	2	8	23300	23307	0 %	75 %	25 %	0 %	295691885
51	NC_014106	CTTG	2	8	23397	23404	0 %	50 %	25 %	25 %	295691885
52	NC_014106	ATGA	2	8	23591	23598	50 %	25 %	25 %	0 %	295691886
53	NC_014106	AAGA	2	8	23808	23815	75 %	0 %	25 %	0 %	295691886
54	NC_014106	AGTC	2	8	24054	24061	25 %	25 %	25 %	25 %	295691886
55	NC_014106	TTAA	2	8	24186	24193	50 %	50 %	0 %	0 %	295691886
56	NC_014106	GATA	2	8	24726	24733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014106	AAAC	2	8	24753	24760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014106	GGCT	2	8	24815	24822	0 %	25 %	50 %	25 %	295691887
59	NC_014106	TGGC	2	8	25195	25202	0 %	25 %	50 %	25 %	295691887
60	NC_014106	AAGA	2	8	25505	25512	75 %	0 %	25 %	0 %	295691887
61	NC_014106	CTAA	2	8	25531	25538	50 %	25 %	0 %	25 %	295691887
62	NC_014106	CTTG	2	8	26011	26018	0 %	50 %	25 %	25 %	295691889
63	NC_014106	TATC	2	8	26654	26661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014106	AATC	2	8	26944	26951	50 %	25 %	0 %	25 %	295691891
65	NC_014106	AATC	2	8	27043	27050	50 %	25 %	0 %	25 %	295691891
66	NC_014106	AATG	2	8	27553	27560	50 %	25 %	25 %	0 %	295691891
67	NC_014106	CAAT	2	8	27949	27956	50 %	25 %	0 %	25 %	295691891
68	NC_014106	TTAT	2	8	28001	28008	25 %	75 %	0 %	0 %	295691891
69	NC_014106	TATT	2	8	28170	28177	25 %	75 %	0 %	0 %	295691891
70	NC_014106	TAAA	2	8	28841	28848	75 %	25 %	0 %	0 %	295691891
71	NC_014106	AGAA	2	8	28939	28946	75 %	0 %	25 %	0 %	295691891
72	NC_014106	GACG	2	8	29095	29102	25 %	0 %	50 %	25 %	295691891
73	NC_014106	AGGC	2	8	30245	30252	25 %	0 %	50 %	25 %	295691891
74	NC_014106	ATTA	2	8	30452	30459	50 %	50 %	0 %	0 %	295691891
75	NC_014106	TAGA	2	8	30533	30540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014106	GATC	2	8	31345	31352	25 %	25 %	25 %	25 %	295691894
77	NC_014106	TATT	2	8	31405	31412	25 %	75 %	0 %	0 %	295691894
78	NC_014106	TTTA	2	8	31647	31654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014106	CCAG	2	8	31907	31914	25 %	0 %	25 %	50 %	295691895
80	NC_014106	TTGG	2	8	31946	31953	0 %	50 %	50 %	0 %	295691895
81	NC_014106	ACCA	2	8	32152	32159	50 %	0 %	0 %	50 %	295691895
82	NC_014106	TTGA	2	8	32439	32446	25 %	50 %	25 %	0 %	295691895
83	NC_014106	TACC	2	8	32629	32636	25 %	25 %	0 %	50 %	295691895
84	NC_014106	GCTT	2	8	32872	32879	0 %	50 %	25 %	25 %	295691895
85	NC_014106	CTTG	2	8	33217	33224	0 %	50 %	25 %	25 %	295691895
86	NC_014106	AAAT	2	8	33632	33639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014106	TCTT	2	8	33752	33759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014106	ATTA	2	8	33875	33882	50 %	50 %	0 %	0 %	295691896
89	NC_014106	TGCC	2	8	33884	33891	0 %	25 %	25 %	50 %	295691896
90	NC_014106	ATTT	2	8	34062	34069	25 %	75 %	0 %	0 %	295691896
91	NC_014106	AGCC	2	8	34148	34155	25 %	0 %	25 %	50 %	295691896
92	NC_014106	TAGA	2	8	34303	34310	50 %	25 %	25 %	0 %	295691896
93	NC_014106	CTTG	2	8	34787	34794	0 %	50 %	25 %	25 %	295691896
94	NC_014106	AATA	2	8	34839	34846	75 %	25 %	0 %	0 %	295691896
95	NC_014106	AGGA	2	8	34887	34894	50 %	0 %	50 %	0 %	295691897
96	NC_014106	AATT	2	8	34972	34979	50 %	50 %	0 %	0 %	295691897
97	NC_014106	AAGC	2	8	35471	35478	50 %	0 %	25 %	25 %	295691898
98	NC_014106	GCTA	2	8	35848	35855	25 %	25 %	25 %	25 %	295691899
99	NC_014106	TTTC	2	8	36612	36619	0 %	75 %	0 %	25 %	295691899
100	NC_014106	CAAT	2	8	36737	36744	50 %	25 %	0 %	25 %	295691899
101	NC_014106	ATTC	2	8	36857	36864	25 %	50 %	0 %	25 %	295691899
102	NC_014106	GTGA	2	8	37693	37700	25 %	25 %	50 %	0 %	295691900
103	NC_014106	AGTT	2	8	37741	37748	25 %	50 %	25 %	0 %	295691900
104	NC_014106	CTTT	2	8	38336	38343	0 %	75 %	0 %	25 %	295691901
105	NC_014106	ATAA	2	8	38475	38482	75 %	25 %	0 %	0 %	295691901
106	NC_014106	CTTT	2	8	39229	39236	0 %	75 %	0 %	25 %	295691902
107	NC_014106	TGAC	2	8	39405	39412	25 %	25 %	25 %	25 %	295691902
108	NC_014106	GCTG	2	8	39745	39752	0 %	25 %	50 %	25 %	295691902
109	NC_014106	TGGC	2	8	39758	39765	0 %	25 %	50 %	25 %	295691902
110	NC_014106	CAAA	2	8	40218	40225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014106	GATT	2	8	40386	40393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014106	ATAG	2	8	40877	40884	50 %	25 %	25 %	0 %	295691903
113	NC_014106	CAGC	2	8	41236	41243	25 %	0 %	25 %	50 %	295691903
114	NC_014106	AGCC	2	8	41365	41372	25 %	0 %	25 %	50 %	295691903
115	NC_014106	CTTG	2	8	41401	41408	0 %	50 %	25 %	25 %	295691903
116	NC_014106	TTGC	2	8	41695	41702	0 %	50 %	25 %	25 %	295691903
117	NC_014106	ATCT	2	8	41944	41951	25 %	50 %	0 %	25 %	295691903
118	NC_014106	ATGC	2	8	41995	42002	25 %	25 %	25 %	25 %	295691903
119	NC_014106	AATA	2	8	42081	42088	75 %	25 %	0 %	0 %	295691903
120	NC_014106	AGAA	2	8	43092	43099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014106	ACAA	2	8	43116	43123	75 %	0 %	0 %	25 %	295691905
122	NC_014106	AACT	2	8	43284	43291	50 %	25 %	0 %	25 %	295691905
123	NC_014106	CCAA	2	8	43849	43856	50 %	0 %	0 %	50 %	295691906
124	NC_014106	ATTA	2	8	45721	45728	50 %	50 %	0 %	0 %	295691908
125	NC_014106	TCTT	2	8	45953	45960	0 %	75 %	0 %	25 %	295691908
126	NC_014106	CTTT	2	8	46433	46440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014106	AACC	2	8	46737	46744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014106	TAAT	2	8	47066	47073	50 %	50 %	0 %	0 %	295691909
129	NC_014106	TTAG	2	8	47099	47106	25 %	50 %	25 %	0 %	295691909
130	NC_014106	AATA	2	8	47734	47741	75 %	25 %	0 %	0 %	295691910
131	NC_014106	GTTG	2	8	48448	48455	0 %	50 %	50 %	0 %	295691911
132	NC_014106	CTTG	2	8	48544	48551	0 %	50 %	25 %	25 %	295691911
133	NC_014106	ATTT	2	8	48626	48633	25 %	75 %	0 %	0 %	295691911
134	NC_014106	GCTT	2	8	49022	49029	0 %	50 %	25 %	25 %	295691911
135	NC_014106	AAAT	2	8	49321	49328	75 %	25 %	0 %	0 %	295691911
136	NC_014106	GAAC	2	8	49670	49677	50 %	0 %	25 %	25 %	295691911
137	NC_014106	GAAA	2	8	50038	50045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014106	TTCG	2	8	50277	50284	0 %	50 %	25 %	25 %	295691912
139	NC_014106	TTAA	2	8	51006	51013	50 %	50 %	0 %	0 %	295691913
140	NC_014106	GTGG	2	8	51112	51119	0 %	25 %	75 %	0 %	295691913
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