MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 3120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014106	CTT	2	6	1440	1445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014106	CTA	4	12	1473	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014106	TAA	2	6	1502	1507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014106	GGA	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014106	GTC	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014106	TAA	2	6	8760	8765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014106	AGG	2	6	8904	8909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014106	AAG	2	6	11652	11657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014106	TAA	2	6	11670	11675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014106	ATA	2	6	16965	16970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014106	AAT	2	6	16973	16978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014106	TAA	2	6	17059	17064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014106	GGA	2	6	17078	17083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014106	AAT	2	6	18036	18041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014106	GAA	2	6	18123	18128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014106	AGA	2	6	18129	18134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014106	CAA	2	6	19072	19077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014106	AGC	2	6	19136	19141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014106	TTA	2	6	20189	20194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014106	CAA	2	6	22817	22822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014106	TTA	2	6	22823	22828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014106	TAA	2	6	22928	22933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014106	TGT	2	6	22938	22943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014106	GAG	2	6	23004	23009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014106	TAT	2	6	24717	24722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014106	GAT	2	6	25572	25577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014106	TGA	2	6	26495	26500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014106	CAT	2	6	26504	26509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014106	TTA	2	6	26565	26570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014106	TAA	2	6	26697	26702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014106	ATT	2	6	26710	26715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014106	GAG	2	6	26745	26750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014106	ACT	2	6	30826	30831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014106	TCA	2	6	31748	31753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014106	ATT	2	6	33715	33720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014106	ATT	2	6	33726	33731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014106	GGA	2	6	33803	33808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014106	TAC	2	6	35668	35673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014106	CAT	2	6	37185	37190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014106	TTA	2	6	37476	37481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014106	TAA	2	6	37482	37487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014106	AAC	2	6	40359	40364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014106	TAT	2	6	42113	42118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014106	TAA	2	6	43067	43072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014106	ATC	2	6	43084	43089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014106	TTA	2	6	46485	46490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014106	GTA	2	6	46585	46590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014106	CTT	2	6	46767	46772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014106	ATT	2	6	47972	47977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014106	TTA	2	6	50053	50058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014106	TTA	2	6	52044	52049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014106	CAA	2	6	52085	52090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014106	TAT	2	6	52206	52211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014106	ATT	2	6	52248	52253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014106	GTA	2	6	52280	52285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014106	AAG	2	6	53158	53163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014106	TCT	2	6	53326	53331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014106	TTA	2	6	53338	53343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014106	TTA	2	6	53362	53367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014106	ATA	2	6	53431	53436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014106	TGA	2	6	53538	53543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014106	GAA	2	6	53678	53683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014106	AAG	2	6	54565	54570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014106	AAG	2	6	56034	56039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014106	TGG	2	6	60044	60049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014106	AGC	2	6	60081	60086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014106	AAT	2	6	60104	60109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014106	TAT	2	6	60189	60194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014106	TTG	2	6	60224	60229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014106	ATA	2	6	61469	61474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014106	GAA	2	6	61484	61489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014106	TAG	2	6	61908	61913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014106	AAT	2	6	61996	62001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014106	ACA	2	6	62060	62065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014106	GAA	2	6	62082	62087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014106	TAA	2	6	62135	62140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014106	CGA	2	6	62158	62163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014106	AAG	2	6	62222	62227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014106	GTC	2	6	62254	62259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014106	ATG	2	6	62325	62330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014106	GTA	2	6	62379	62384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014106	AAG	2	6	62439	62444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014106	GGC	2	6	62742	62747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014106	GAA	2	6	63249	63254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014106	GGC	2	6	63268	63273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014106	TGC	2	6	63393	63398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014106	GAA	2	6	63512	63517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014106	GGT	2	6	63586	63591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014106	GTC	2	6	63600	63605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014106	CCT	2	6	64073	64078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014106	GTA	2	6	64173	64178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014106	GAA	2	6	64297	64302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014106	AGG	2	6	64383	64388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014106	GAA	2	6	64583	64588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014106	ATT	2	6	64678	64683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014106	TAG	2	6	64773	64778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014106	AGC	2	6	65638	65643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014106	CAT	2	6	65644	65649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014106	CCG	2	6	65858	65863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014106	AGG	2	6	65991	65996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014106	AGG	2	6	66002	66007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014106	CAA	2	6	66041	66046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014106	GAA	2	6	66265	66270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014106	AAC	2	6	66315	66320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014106	CGG	2	6	66448	66453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014106	AGA	2	6	66678	66683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014106	TAC	2	6	66718	66723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014106	CCT	2	6	66806	66811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014106	TGG	2	6	66941	66946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014106	TCG	2	6	67057	67062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014106	CGT	2	6	67137	67142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014106	CGT	2	6	67163	67168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014106	GAG	2	6	67186	67191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014106	GTT	2	6	67240	67245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014106	AAG	2	6	67529	67534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014106	CTT	2	6	67571	67576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014106	AGT	2	6	67586	67591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014106	TGG	2	6	67592	67597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014106	GTC	2	6	67689	67694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014106	GAG	2	6	67838	67843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014106	GCT	2	6	67912	67917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014106	GAA	2	6	67955	67960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014106	TTG	2	6	67971	67976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014106	TCA	2	6	68073	68078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014106	TAA	2	6	68098	68103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014106	TTG	2	6	68145	68150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014106	ATC	2	6	68758	68763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014106	AAT	2	6	68790	68795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014106	GTT	2	6	68850	68855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014106	AAG	2	6	69115	69120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014106	TAA	2	6	69129	69134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014106	TCC	2	6	71993	71998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014106	CTT	2	6	73771	73776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014106	TCA	2	6	73878	73883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014106	CCG	2	6	73888	73893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_014106	AGT	2	6	73912	73917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014106	AAT	2	6	73956	73961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014106	ATT	2	6	74439	74444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014106	TTG	2	6	74451	74456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014106	AGG	2	6	74537	74542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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