MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 26603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014106	TAA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691863
2	NC_014106	GCC	2	6	409	414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295691863
3	NC_014106	TGC	2	6	417	422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691863
4	NC_014106	TGG	2	6	474	479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691863
5	NC_014106	TGA	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691863
6	NC_014106	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295691863
7	NC_014106	GAT	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691863
8	NC_014106	AGG	2	6	1103	1108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295691863
9	NC_014106	CTG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691863
10	NC_014106	CTG	2	6	1331	1336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691863
11	NC_014106	AAT	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691864
12	NC_014106	TCA	2	6	1606	1611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691864
13	NC_014106	CTA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691864
14	NC_014106	AGA	2	6	1656	1661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691864
15	NC_014106	ATG	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691864
16	NC_014106	TAA	2	6	1890	1895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691864
17	NC_014106	TGC	2	6	1923	1928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691864
18	NC_014106	TCT	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295691864
19	NC_014106	AAC	2	6	2389	2394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295691864
20	NC_014106	GAA	2	6	2470	2475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691864
21	NC_014106	AGA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691864
22	NC_014106	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691865
23	NC_014106	ATT	2	6	2968	2973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691865
24	NC_014106	TCA	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691865
25	NC_014106	AAT	2	6	3282	3287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691866
26	NC_014106	CGG	2	6	3308	3313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295691866
27	NC_014106	CGG	2	6	3510	3515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295691866
28	NC_014106	AAT	2	6	3600	3605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691866
29	NC_014106	AGC	2	6	3613	3618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295691866
30	NC_014106	CGC	2	6	3683	3688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295691866
31	NC_014106	CGA	2	6	3702	3707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295691866
32	NC_014106	AGC	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295691866
33	NC_014106	ATC	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691866
34	NC_014106	TGA	2	6	3821	3826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691866
35	NC_014106	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691866
36	NC_014106	ACT	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691866
37	NC_014106	TGA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691866
38	NC_014106	GCA	2	6	3980	3985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295691866
39	NC_014106	GAT	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691866
40	NC_014106	TAC	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691866
41	NC_014106	AAT	2	6	4181	4186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691866
42	NC_014106	CAC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295691867
43	NC_014106	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691867
44	NC_014106	TGA	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691867
45	NC_014106	GAT	2	6	4512	4517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691867
46	NC_014106	GTC	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691867
47	NC_014106	GGT	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691867
48	NC_014106	CGG	2	6	4607	4612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295691867
49	NC_014106	TGG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691867
50	NC_014106	TGG	2	6	4631	4636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691867
51	NC_014106	AGT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691867
52	NC_014106	TGA	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691867
53	NC_014106	TGA	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691867
54	NC_014106	GAA	2	6	4862	4867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691867
55	NC_014106	AAG	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691867
56	NC_014106	TAT	2	6	5011	5016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691867
57	NC_014106	TGA	2	6	5018	5023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691867
58	NC_014106	ACT	2	6	5097	5102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691867
59	NC_014106	TGA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691867
60	NC_014106	AAT	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691867
61	NC_014106	CTG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691867
62	NC_014106	CTG	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691867
63	NC_014106	TCG	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691867
64	NC_014106	CGG	2	6	5591	5596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295691867
65	NC_014106	CTG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691867
66	NC_014106	GAA	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691867
67	NC_014106	ACT	2	6	6054	6059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691867
68	NC_014106	AGA	2	6	6075	6080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691867
69	NC_014106	AGG	2	6	6211	6216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295691867
70	NC_014106	ATG	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
71	NC_014106	TTG	2	6	6316	6321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691868
72	NC_014106	CGT	2	6	6366	6371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691868
73	NC_014106	AAG	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691868
74	NC_014106	TTG	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691868
75	NC_014106	TGA	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
76	NC_014106	CAA	2	6	6644	6649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295691868
77	NC_014106	ATG	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
78	NC_014106	ACA	2	6	6765	6770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295691868
79	NC_014106	TTA	2	6	6799	6804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691868
80	NC_014106	TGA	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
81	NC_014106	ATT	2	6	6894	6899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691868
82	NC_014106	GTG	2	6	6907	6912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691868
83	NC_014106	TTG	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691868
84	NC_014106	GAA	2	6	7049	7054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691868
85	NC_014106	TGA	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
86	NC_014106	GTT	2	6	7170	7175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691868
87	NC_014106	AAT	2	6	7179	7184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691868
88	NC_014106	TGG	2	6	7228	7233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691868
89	NC_014106	TTG	2	6	7237	7242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691868
90	NC_014106	TGC	2	6	7276	7281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691868
91	NC_014106	AAG	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691868
92	NC_014106	TGT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691868
93	NC_014106	TGA	2	6	7397	7402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
94	NC_014106	TGA	2	6	7475	7480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
95	NC_014106	GAA	2	6	7675	7680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691868
96	NC_014106	GTG	2	6	7813	7818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691868
97	NC_014106	CTT	2	6	7901	7906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295691868
98	NC_014106	AAG	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691868
99	NC_014106	AGT	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
100	NC_014106	TTA	2	6	8071	8076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691868
101	NC_014106	CGA	2	6	8165	8170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295691868
102	NC_014106	ACT	2	6	8187	8192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691868
103	NC_014106	CTG	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691868
104	NC_014106	TGA	2	6	8348	8353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
105	NC_014106	ATC	2	6	8490	8495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691868
106	NC_014106	ATG	2	6	8506	8511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
107	NC_014106	TAC	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691868
108	NC_014106	GTA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691868
109	NC_014106	GAA	3	9	8652	8660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691868
110	NC_014106	AAT	2	6	8698	8703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691868
111	NC_014106	CAT	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691869
112	NC_014106	ACA	2	6	8975	8980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295691869
113	NC_014106	GGT	2	6	9025	9030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691869
114	NC_014106	CGT	2	6	9061	9066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691869
115	NC_014106	CTG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691869
116	NC_014106	TTG	2	6	9285	9290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691870
117	NC_014106	TAC	2	6	9319	9324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691870
118	NC_014106	CAG	2	6	9435	9440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295691870
119	NC_014106	ATA	2	6	9513	9518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691870
120	NC_014106	GTT	3	9	9548	9556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691870
121	NC_014106	TGG	2	6	9610	9615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691870
122	NC_014106	AAT	2	6	9668	9673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691870
123	NC_014106	TAA	2	6	9700	9705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691870
124	NC_014106	AAT	2	6	9713	9718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691870
125	NC_014106	TGA	2	6	9763	9768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691870
126	NC_014106	CAA	2	6	9818	9823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295691871
127	NC_014106	AGA	2	6	9824	9829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691871
128	NC_014106	CGT	4	12	9836	9847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691871
129	NC_014106	CGT	2	6	9947	9952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691871
130	NC_014106	AGA	2	6	10136	10141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691872
131	NC_014106	CTT	2	6	10172	10177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295691872
132	NC_014106	TCA	2	6	10303	10308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691872
133	NC_014106	GCC	2	6	10311	10316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295691872
134	NC_014106	ACA	2	6	10326	10331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295691872
135	NC_014106	ATA	2	6	10363	10368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691872
136	NC_014106	TGG	2	6	10411	10416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691872
137	NC_014106	TTG	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691872
138	NC_014106	GAT	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691872
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142	NC_014106	ATT	2	6	10880	10885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691873
143	NC_014106	ATA	2	6	10941	10946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691873
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145	NC_014106	TAA	2	6	11194	11199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691873
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150	NC_014106	TGG	2	6	11407	11412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691873
151	NC_014106	AAG	2	6	11426	11431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691873
152	NC_014106	ATA	2	6	11768	11773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691874
153	NC_014106	ATG	2	6	11912	11917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691874
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163	NC_014106	TAA	2	6	12459	12464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691874
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252	NC_014106	TTG	2	6	18675	18680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691879
253	NC_014106	GTT	2	6	18685	18690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691879
254	NC_014106	TGA	2	6	18883	18888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691879
255	NC_014106	TAT	2	6	18928	18933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691879
256	NC_014106	GTT	2	6	18941	18946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691879
257	NC_014106	GAT	2	6	18976	18981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691879
258	NC_014106	TGA	2	6	19009	19014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691879
259	NC_014106	AGA	2	6	19192	19197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691880
260	NC_014106	GTA	2	6	19207	19212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691880
261	NC_014106	TGG	2	6	19220	19225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691880
262	NC_014106	TAA	2	6	19301	19306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691880
263	NC_014106	CTT	2	6	19466	19471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295691880
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266	NC_014106	GAT	2	6	19554	19559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691880
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268	NC_014106	TGA	2	6	19685	19690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691880
269	NC_014106	ATG	2	6	19717	19722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691880
270	NC_014106	TTG	2	6	19882	19887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691880
271	NC_014106	GAT	2	6	19908	19913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691880
272	NC_014106	TGA	2	6	19937	19942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295691880
273	NC_014106	AAC	2	6	19947	19952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295691880
274	NC_014106	CTG	2	6	19996	20001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295691880
275	NC_014106	AAG	2	6	20260	20265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691881
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278	NC_014106	AGA	2	6	20696	20701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295691882
279	NC_014106	CTT	2	6	20815	20820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295691883
280	NC_014106	TTA	2	6	20874	20879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295691883
281	NC_014106	TAA	2	6	21038	21043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295691883
282	NC_014106	TCA	2	6	21084	21089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295691883
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284	NC_014106	GTT	2	6	21124	21129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691883
285	NC_014106	GCG	2	6	21233	21238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295691883
286	NC_014106	TGT	2	6	21246	21251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691883
287	NC_014106	GGT	2	6	21295	21300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691883
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289	NC_014106	TGG	2	6	21387	21392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295691883
290	NC_014106	GCC	2	6	21482	21487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295691883
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375	NC_014106	TGT	2	6	28437	28442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295691891
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