MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium DSM 319 chromosome

Total Repeats: 1676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014103	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702243
2	NC_014103	GCAAGA	2	12	5504	5515	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295702247
3	NC_014103	ATGCAA	2	12	7329	7340	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702248
4	NC_014103	ATTAAA	2	12	15459	15470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295702250
5	NC_014103	CCAACT	2	12	22534	22545	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295702255
6	NC_014103	AATTGA	2	12	26603	26614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295702260
7	NC_014103	GTTGAA	2	12	43466	43477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702268
8	NC_014103	AAAGAA	2	12	44297	44308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295702269
9	NC_014103	AAAGGA	2	12	53675	53686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295702280
10	NC_014103	ATATTT	2	12	56339	56350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295702285
11	NC_014103	TACAAT	2	12	59988	59999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295702289
12	NC_014103	GATGTA	2	12	60860	60871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702290
13	NC_014103	CTTACA	2	12	64445	64456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295702293
14	NC_014103	TCGCTT	2	12	67828	67839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295702296
15	NC_014103	TATCAT	2	12	80099	80110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295702308
16	NC_014103	AATACG	2	12	81346	81357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702309
17	NC_014103	GTAGGT	2	12	82573	82584	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	295702310
18	NC_014103	GAAAAG	2	12	84647	84658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295702312
19	NC_014103	GGAAAA	2	12	88495	88506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295702317
20	NC_014103	GAAAGA	2	12	89586	89597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295702317
21	NC_014103	GTGAAG	2	12	97662	97673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	295702321
22	NC_014103	TGCGTT	2	12	98529	98540	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	295702321
23	NC_014103	CAGATG	2	12	104424	104435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702326
24	NC_014103	CCAGAT	2	12	107245	107256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295702328
25	NC_014103	TCAAAA	2	12	110330	110341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	295702332
26	NC_014103	TGACTT	2	12	112152	112163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295702336
27	NC_014103	CATTTA	2	12	112685	112696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295702337
28	NC_014103	TCTGGT	2	12	112750	112761	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	295702337
29	NC_014103	GAAGCT	2	12	113283	113294	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702338
30	NC_014103	CTTGCT	2	12	114420	114431	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295702339
31	NC_014103	CTGTAG	2	12	114624	114635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295702340
32	NC_014103	GAAGTA	2	12	115536	115547	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702341
33	NC_014103	TAAAAG	2	12	122570	122581	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295702343
34	NC_014103	GCAAGA	2	12	124702	124713	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295702347
35	NC_014103	TATCAC	2	12	124720	124731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295702347
36	NC_014103	AAACAG	2	12	124884	124895	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	295702347
37	NC_014103	AGCGTG	2	12	125580	125591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	295702347
38	NC_014103	CAGTAA	2	12	128663	128674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702350
39	NC_014103	AAAGGT	2	12	128935	128946	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702350
40	NC_014103	TGATGT	2	12	129957	129968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295702352
41	NC_014103	ACTGTT	2	12	133092	133103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295702359
42	NC_014103	AGTATC	2	12	134413	134424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295702362
43	NC_014103	ACTGTA	2	12	135389	135400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295702365
44	NC_014103	AATCGA	2	12	135682	135693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702365
45	NC_014103	AAAGGT	2	12	135794	135805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702365
46	NC_014103	TAGTTG	2	12	136384	136395	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295702367
47	NC_014103	TGTTAA	2	12	137513	137524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295702370
48	NC_014103	TTGAAG	2	12	140459	140470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702373
49	NC_014103	TTAATT	2	12	145321	145332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295702380
50	NC_014103	AAGCTT	2	12	145408	145419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295702380
51	NC_014103	TATTGC	2	12	149255	149266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295702386
52	NC_014103	ATATTC	2	12	150725	150736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295702387
53	NC_014103	CGTAGG	2	12	152070	152081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	295702389
54	NC_014103	TTTGAA	2	12	152605	152616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295702390
55	NC_014103	GAATAG	2	12	153119	153130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702390
56	NC_014103	GTATAG	2	12	160104	160115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702391
57	NC_014103	TCGAAT	2	12	161781	161792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295702394
58	NC_014103	TGTAAG	2	12	173636	173647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702403
59	NC_014103	AAGCAG	2	12	178570	178581	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295702407
60	NC_014103	AAAATT	2	12	179457	179468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295702408
61	NC_014103	GAAATT	2	12	180345	180356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295702408
62	NC_014103	TTGAAA	2	12	181707	181718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295702410
63	NC_014103	TGATTG	2	12	184256	184267	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295702412
64	NC_014103	AACAGG	2	12	193986	193997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295702421
65	NC_014103	AAATGA	2	12	197091	197102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295702424
66	NC_014103	GCTTTC	2	12	197887	197898	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295702425
67	NC_014103	ATTGCC	2	12	202946	202957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295702432
68	NC_014103	AGCTGT	2	12	224697	224708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295702451
69	NC_014103	AACTGA	2	12	225033	225044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702451
70	NC_014103	TTCCTC	2	12	227784	227795	0 %	50 %	0 %	50 %	295702453
71	NC_014103	ACAGCT	2	12	231280	231291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295702455
72	NC_014103	TTAACA	2	12	232509	232520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295702456
73	NC_014103	AAAGTA	2	12	243130	243141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295702462
74	NC_014103	AATGCA	2	12	246597	246608	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702465
75	NC_014103	TCATAT	2	12	247694	247705	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295702466
76	NC_014103	TAATAT	2	12	253643	253654	50 %	50 %	0 %	0 %	295702471
77	NC_014103	AATCGA	2	12	254970	254981	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702473
78	NC_014103	AGGAGA	2	12	259639	259650	50 %	0 %	50 %	0 %	295702475
79	NC_014103	AAATGC	2	12	263081	263092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295702478
80	NC_014103	CAGCTG	2	12	264654	264665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295702480
81	NC_014103	GTTAAA	2	12	270239	270250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295702484
82	NC_014103	ATGTAG	2	12	271105	271116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702484
83	NC_014103	ATTTGT	2	12	271513	271524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295702484
84	NC_014103	GGAAGC	2	12	271662	271673	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	295702484
85	NC_014103	TTTAGT	2	12	278290	278301	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295702489
86	NC_014103	AAGATG	2	12	278343	278354	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702489
87	NC_014103	CTATGC	2	12	281743	281754	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295702491
88	NC_014103	TATGCT	2	12	284837	284848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295702494
89	NC_014103	TAACAA	2	12	286906	286917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	295702496
90	NC_014103	TTCGGG	2	12	287621	287632	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	295702497
91	NC_014103	TCAATT	2	12	293563	293574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295702503
92	NC_014103	TCCGAT	2	12	294623	294634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295702504
93	NC_014103	GTATAC	2	12	296245	296256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295702506
94	NC_014103	ATTCCA	2	12	297137	297148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295702507
95	NC_014103	TTTAGA	2	12	303649	303660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295702513
96	NC_014103	GGAGAA	2	12	305452	305463	50 %	0 %	50 %	0 %	295702515
97	NC_014103	TCAAAC	2	12	306560	306571	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	295702516
98	NC_014103	AGAAAT	2	12	314401	314412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295702525
99	NC_014103	TGTATC	2	12	315836	315847	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295702526
100	NC_014103	AAGAAA	2	12	322253	322264	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295702531
101	NC_014103	TTGAAA	2	12	325141	325152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295702537
102	NC_014103	GGAACA	2	12	327435	327446	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295702538
103	NC_014103	TTTAGG	2	12	327578	327589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295702538
104	NC_014103	ACTTGT	2	12	330077	330088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295702538
105	NC_014103	ATCAAA	2	12	331734	331745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	295702539
106	NC_014103	CTTGCT	2	12	335513	335524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295702542
107	NC_014103	CAAGCA	2	12	340984	340995	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295702546
108	NC_014103	CGGTTC	2	12	341196	341207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295702546
109	NC_014103	CATCTA	2	12	341849	341860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295702547
110	NC_014103	TCAGCA	2	12	343879	343890	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295702548
111	NC_014103	GAATAG	2	12	347951	347962	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702553
112	NC_014103	TTCTTT	2	12	348181	348192	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295702553
113	NC_014103	ACAAGC	2	12	350482	350493	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295702555
114	NC_014103	ACAATA	2	12	351463	351474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	295702556
115	NC_014103	TAATGG	2	12	356927	356938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702561
116	NC_014103	TCACCA	2	12	358520	358531	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295702564
117	NC_014103	ATCTCA	2	12	362188	362199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295702568
118	NC_014103	TTTCAT	2	12	364088	364099	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295702570
119	NC_014103	TTAAAA	2	12	366767	366778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295702573
120	NC_014103	GACGAA	2	12	367705	367716	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295702573
121	NC_014103	GATGAA	2	12	387164	387175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702593
122	NC_014103	TAATAG	2	12	391180	391191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295702596
123	NC_014103	ATGAGC	2	12	392015	392026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702596
124	NC_014103	AGAAAA	2	12	407134	407145	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295702606
125	NC_014103	GAAATA	2	12	416457	416468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295702615
126	NC_014103	ATTAGG	2	12	418774	418785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295702617
127	NC_014103	TAATTG	2	12	422082	422093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295702619
128	NC_014103	AGCCTA	2	12	425366	425377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295702622
129	NC_014103	TTTTAA	2	12	427013	427024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295702624
130	NC_014103	CAGCGT	2	12	430943	430954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295702627
131	NC_014103	CTGTTT	2	12	431666	431677	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	295702628
132	NC_014103	TTATGT	2	12	436992	437003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295702633
133	NC_014103	AAAAGG	2	12	437830	437841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295702634
134	NC_014103	AAGGAA	2	12	439673	439684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295702635
135	NC_014103	GTTCTT	2	12	445862	445873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	295702636
136	NC_014103	TTCTGT	2	12	448065	448076	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	295702638
137	NC_014103	TTAAAA	2	12	449422	449433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295702639
138	NC_014103	CAGCAA	2	12	450006	450017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295702639
139	NC_014103	CAAATC	2	12	450151	450162	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	295702639
140	NC_014103	GGTTAT	2	12	451568	451579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295702641
141	NC_014103	TACGGA	2	12	451583	451594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702641
142	NC_014103	AGCTGA	2	12	452824	452835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702644
143	NC_014103	AAACGA	2	12	453283	453294	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	295702644
144	NC_014103	AGTGAA	2	12	458652	458663	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295702650
145	NC_014103	AAACCA	2	12	460543	460554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295702651
146	NC_014103	AATGGC	2	12	464709	464720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702654
147	NC_014103	ACAGTG	2	12	468637	468648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295702657
148	NC_014103	TCTTTT	2	12	470383	470394	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295702659
149	NC_014103	TCTGCT	2	12	478404	478415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295702669
150	NC_014103	TTTCAA	2	12	478663	478674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295702669
151	NC_014103	CTTCTA	2	12	481073	481084	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	295702672
152	NC_014103	AAATAA	2	12	490515	490526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	295702683
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154	NC_014103	AGCAAG	2	12	492308	492319	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295702684
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199	NC_014103	CAGCGT	2	12	679626	679637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295702848
200	NC_014103	TCTTTG	2	12	680452	680463	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	295702849
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217	NC_014103	AAAGTA	2	12	718724	718735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295702888
218	NC_014103	AAGCGG	2	12	721152	721163	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	295702891
219	NC_014103	ATTGTT	2	12	725239	725250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295702894
220	NC_014103	ATTGAT	2	12	731279	731290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295702900
221	NC_014103	AAGAAA	2	12	731603	731614	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295702900
222	NC_014103	TTTAAT	2	12	734704	734715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295702903
223	NC_014103	GTTTCC	2	12	735535	735546	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295702904
224	NC_014103	GCAACG	2	12	736026	736037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295702905
225	NC_014103	AAATGA	2	12	737046	737057	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295702906
226	NC_014103	ATTCCA	2	12	737966	737977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295702906
227	NC_014103	TTCCTG	2	12	737985	737996	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295702906
228	NC_014103	TTATTT	2	12	742265	742276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295702911
229	NC_014103	TGTACA	2	12	748204	748215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295702915
230	NC_014103	CAACTG	2	12	756109	756120	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295702920
231	NC_014103	ACGATT	2	12	769497	769508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295702931
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333	NC_014103	AGCTAA	2	12	1075787	1075798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295703232
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341	NC_014103	AGGTAA	2	12	1113552	1113563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295703262
342	NC_014103	AAATGA	2	12	1116811	1116822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295703265
343	NC_014103	CCGCTT	2	12	1123481	1123492	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	295703270
344	NC_014103	TCTTGG	2	12	1125388	1125399	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	295703272
345	NC_014103	CAGCTG	2	12	1125747	1125758	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295703272
346	NC_014103	GCTTCT	2	12	1133284	1133295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	295703279
347	NC_014103	AGTAGG	2	12	1135178	1135189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	295703280
348	NC_014103	AGCTTT	2	12	1135226	1135237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295703280
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350	NC_014103	ATTTTG	2	12	1138967	1138978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295703283
351	NC_014103	AATTGG	2	12	1139723	1139734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295703284
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453	NC_014103	CAGCGC	2	12	1445514	1445525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	295703597
454	NC_014103	AAAAAG	2	12	1445641	1445652	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295703597
455	NC_014103	CTATTC	2	12	1445809	1445820	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	295703597
456	NC_014103	TTGCTG	2	12	1448906	1448917	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	295703601
457	NC_014103	AATGTC	2	12	1449066	1449077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295703601
458	NC_014103	TTTACG	2	12	1452045	1452056	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295703603
459	NC_014103	AACGTA	2	12	1461342	1461353	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295703614
460	NC_014103	GAAGCT	2	12	1462509	1462520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295703614
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462	NC_014103	GCGGTA	2	12	1466766	1466777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	295703618
463	NC_014103	GCTGCC	2	12	1466788	1466799	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	295703618
464	NC_014103	TGCAAT	2	12	1467021	1467032	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295703618
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468	NC_014103	ATTTCT	2	12	1484007	1484018	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295703635
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472	NC_014103	TACATT	2	12	1492335	1492346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295703646
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475	NC_014103	TGAAGA	2	12	1511383	1511394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295703661
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481	NC_014103	GGAATG	2	12	1535487	1535498	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	295703680
482	NC_014103	GACTTT	2	12	1547085	1547096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295703697
483	NC_014103	CTTATT	2	12	1548445	1548456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295703698
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488	NC_014103	ATTTTG	2	12	1563216	1563227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295703707
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